RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, human

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHBDD1-215	ENST00000539613	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		34.53	■■■■□ 3.12
RHBDD1-215	ENST00000539613	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		34.5	■■■■□ 3.11
RHBDD1-215	ENST00000539613	MLEC	Q14165	292 aa		34.49	■■■■□ 3.11
RHBDD1-215	ENST00000539613	PLCH2	O75038	1416 aa		34.48	■■■■□ 3.11
RHBDD1-215	ENST00000539613	FMN1	Q68DA7	1419 aa		34.48	■■■■□ 3.11
RHBDD1-215	ENST00000539613	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	34.48	■■■■□ 3.11
RHBDD1-215	ENST00000539613	KIF14	Q15058	1648 aa		34.47	■■■■□ 3.11
RHBDD1-215	ENST00000539613	HSPA2	P54652	639 aa		34.45	■■■■□ 3.11
RHBDD1-215	ENST00000539613	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		34.41	■■■■□ 3.1
RHBDD1-215	ENST00000539613	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		34.38	■■■■□ 3.09
RHBDD1-215	ENST00000539613	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		34.38	■■■■□ 3.09
RHBDD1-215	ENST00000539613	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		34.36	■■■■□ 3.09
RHBDD1-215	ENST00000539613	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	34.36	■■■■□ 3.09
RHBDD1-215	ENST00000539613	ATP10A	O60312	1499 aa		34.35	■■■■□ 3.09
RHBDD1-215	ENST00000539613	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		34.35	■■■■□ 3.09
RHBDD1-215	ENST00000539613	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		34.34	■■■■□ 3.09
RHBDD1-215	ENST00000539613	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		34.33	■■■■□ 3.09
RHBDD1-215	ENST00000539613	CLIP1	P30622	1438 aa		34.32	■■■■□ 3.08
RHBDD1-215	ENST00000539613	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		34.32	■■■■□ 3.08
RHBDD1-215	ENST00000539613	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	34.3	■■■■□ 3.08
RHBDD1-215	ENST00000539613	KDM5C	P41229	1560 aa		34.27	■■■■□ 3.08
RHBDD1-215	ENST00000539613	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		34.26	■■■■□ 3.08
RHBDD1-215	ENST00000539613	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		34.24	■■■■□ 3.07
RHBDD1-215	ENST00000539613	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		34.22	■■■■□ 3.07
RHBDD1-215	ENST00000539613	PREX2	Q70Z35	1606 aa		34.21	■■■■□ 3.07
RHBDD1-215	ENST00000539613	ABCA6	Q8N139	1617 aa		34.19	■■■■□ 3.06
RHBDD1-215	ENST00000539613	AFAP1	Q8N556	730 aa		34.16	■■■■□ 3.06
RHBDD1-215	ENST00000539613	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	34.15	■■■■□ 3.06
RHBDD1-215	ENST00000539613	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		34.15	■■■■□ 3.06
RHBDD1-215	ENST00000539613	ABCC1	P33527	1531 aa		34.13	■■■■□ 3.05
RHBDD1-215	ENST00000539613	RERE	Q9P2R6	1566 aa		34.12	■■■■□ 3.05
RHBDD1-215	ENST00000539613	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		34.12	■■■■□ 3.05
RHBDD1-215	ENST00000539613	CERK	Q8TCT0	537 aa		34.1	■■■■□ 3.05
RHBDD1-215	ENST00000539613	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		34.09	■■■■□ 3.05
RHBDD1-215	ENST00000539613	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		34.09	■■■■□ 3.05
RHBDD1-215	ENST00000539613	C3	P01024	1663 aa		34.09	■■■■□ 3.05
RHBDD1-215	ENST00000539613	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		34.08	■■■■□ 3.05
RHBDD1-215	ENST00000539613	STRC	Q7RTU9	1775 aa		34.07	■■■■□ 3.04
RHBDD1-215	ENST00000539613	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		34.05	■■■■□ 3.04
RHBDD1-215	ENST00000539613	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		34.04	■■■■□ 3.04
RHBDD1-215	ENST00000539613	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
RHBDD1-215	ENST00000539613	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		34.03	■■■■□ 3.04
RHBDD1-215	ENST00000539613	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		34	■■■■□ 3.03
RHBDD1-215	ENST00000539613	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	34	■■■■□ 3.03
RHBDD1-215	ENST00000539613	AGL	P35573	1532 aa		33.98	■■■■□ 3.03
RHBDD1-215	ENST00000539613	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.96	■■■■□ 3.03
RHBDD1-215	ENST00000539613	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.93	■■■■□ 3.02
RHBDD1-215	ENST00000539613	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.9	■■■■□ 3.02
RHBDD1-215	ENST00000539613	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.9	■■■■□ 3.02
RHBDD1-215	ENST00000539613	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.88	■■■■□ 3.01
RHBDD1-215	ENST00000539613	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
RHBDD1-215	ENST00000539613	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RHBDD1-215	ENST00000539613	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RHBDD1-215	ENST00000539613	PTPRT	O14522	1441 aa		33.79	■■■■□ 3
RHBDD1-215	ENST00000539613	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.78	■■■■□ 3
RHBDD1-215	ENST00000539613	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
RHBDD1-215	ENST00000539613	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
RHBDD1-215	ENST00000539613	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
RHBDD1-215	ENST00000539613	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
RHBDD1-215	ENST00000539613	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.72	■■■□□ 2.99
RHBDD1-215	ENST00000539613	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.71	■■■□□ 2.99
RHBDD1-215	ENST00000539613	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.71	■■■□□ 2.99
RHBDD1-215	ENST00000539613	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.69	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	NPAT	Q14207	1427 aa		33.69	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.68	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.68	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.68	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.67	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.66	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	A2M	P01023	1474 aa		33.65	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.65	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.64	■■■□□ 2.98
RHBDD1-215	ENST00000539613	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.63	■■■□□ 2.97
RHBDD1-215	ENST00000539613	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.63	■■■□□ 2.97
RHBDD1-215	ENST00000539613	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.59	■■■□□ 2.97
RHBDD1-215	ENST00000539613	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.59	■■■□□ 2.97
RHBDD1-215	ENST00000539613	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
RHBDD1-215	ENST00000539613	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.56	■■■□□ 2.96
RHBDD1-215	ENST00000539613	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.56	■■■□□ 2.96
RHBDD1-215	ENST00000539613	GGT6	Q6P531	493 aa		33.54	■■■□□ 2.96
RHBDD1-215	ENST00000539613	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.51	■■■□□ 2.95
RHBDD1-215	ENST00000539613	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RHBDD1-215	ENST00000539613	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RHBDD1-215	ENST00000539613	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
RHBDD1-215	ENST00000539613	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RHBDD1-215	ENST00000539613	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
RHBDD1-215	ENST00000539613	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
RHBDD1-215	ENST00000539613	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.4	■■■□□ 2.94
RHBDD1-215	ENST00000539613	PKD2	Q13563	968 aa		33.39	■■■□□ 2.94
RHBDD1-215	ENST00000539613	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
RHBDD1-215	ENST00000539613	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.38	■■■□□ 2.93
RHBDD1-215	ENST00000539613	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
RHBDD1-215	ENST00000539613	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.35	■■■□□ 2.93
RHBDD1-215	ENST00000539613	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.35	■■■□□ 2.93
RHBDD1-215	ENST00000539613	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RHBDD1-215	ENST00000539613	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RHBDD1-215	ENST00000539613	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.33	■■■□□ 2.93
RHBDD1-215	ENST00000539613	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.33	■■■□□ 2.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms