RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533683.6

SAMD1-202, Transcript of sterile alpha motif domain containing 1, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAMD1, Length 2,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1-202ENST00000533683 KDM6BO15054 1643 aa41.24■■■■■ 4.19
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SAMD1-202ENST00000533683 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.18■■■■■ 4.18
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SAMD1-202ENST00000533683 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.13■■■■■ 4.18
SAMD1-202ENST00000533683 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.12■■■■■ 4.17
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SAMD1-202ENST00000533683 TRIM52Q96A61 297 aa41.09■■■■■ 4.17
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SAMD1-202ENST00000533683 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.82■■■■■ 4.13
SAMD1-202ENST00000533683 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.81■■■■■ 4.12
SAMD1-202ENST00000533683 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.78■■■■■ 4.12
SAMD1-202ENST00000533683 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.78■■■■■ 4.12
SAMD1-202ENST00000533683 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.76■■■■■ 4.12
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SAMD1-202ENST00000533683 TSPY10P0CW01 314 aa40.69■■■■■ 4.11
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SAMD1-202ENST00000533683 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.43■■■■■ 4.06
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SAMD1-202ENST00000533683 PLXNC1O60486 1568 aa40.27■■■■■ 4.04
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SAMD1-202ENST00000533683 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.23■■■■■ 4.03
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SAMD1-202ENST00000533683 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.17■■■■■ 4.02
SAMD1-202ENST00000533683 UNC13BO14795 1591 aa40.15■■■■■ 4.02
SAMD1-202ENST00000533683 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.13■■■■■ 4.02
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SAMD1-202ENST00000533683 ASXL2Q76L83 1435 aa40.11■■■■■ 4.01
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SAMD1-202ENST00000533683 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.02■■■■■ 4
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SAMD1-202ENST00000533683 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.96■■■■□ 3.99
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SAMD1-202ENST00000533683 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.95■■■■□ 3.99
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SAMD1-202ENST00000533683 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.85■■■■□ 3.97
SAMD1-202ENST00000533683 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.85■■■■□ 3.97
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