RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.59■■■□□ 2.33
TSTA3-214ENST00000531473 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.58■■■□□ 2.33
TSTA3-214ENST00000531473 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
TSTA3-214ENST00000531473 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.54■■■□□ 2.32
TSTA3-214ENST00000531473 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.53■■■□□ 2.32
TSTA3-214ENST00000531473 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.53■■■□□ 2.32
TSTA3-214ENST00000531473 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.53■■■□□ 2.32
TSTA3-214ENST00000531473 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.31
TSTA3-214ENST00000531473 ABCC5O15440 1437 aa29.49■■■□□ 2.31
TSTA3-214ENST00000531473 DAPK1P53355 1430 aa29.47■■■□□ 2.31
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
TSTA3-214ENST00000531473 NAIPQ13075 1403 aa29.46■■■□□ 2.31
TSTA3-214ENST00000531473 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.45■■■□□ 2.31
TSTA3-214ENST00000531473 HFM1A2PYH4 1435 aa29.44■■■□□ 2.3
TSTA3-214ENST00000531473 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
TSTA3-214ENST00000531473 KDM6BO15054 1643 aa29.4■■■□□ 2.3
TSTA3-214ENST00000531473 PREX2Q70Z35 1606 aa29.39■■■□□ 2.3
TSTA3-214ENST00000531473 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
TSTA3-214ENST00000531473 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.39■■■□□ 2.29
TSTA3-214ENST00000531473 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.36■■■□□ 2.29
TSTA3-214ENST00000531473 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.35■■■□□ 2.29
TSTA3-214ENST00000531473 ASXL2Q76L83 1435 aa29.35■■■□□ 2.29
TSTA3-214ENST00000531473 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.35■■■□□ 2.29
TSTA3-214ENST00000531473 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.35■■■□□ 2.29
TSTA3-214ENST00000531473 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.35■■■□□ 2.29
TSTA3-214ENST00000531473 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.33■■■□□ 2.29
TSTA3-214ENST00000531473 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.31■■■□□ 2.28
TSTA3-214ENST00000531473 MAPKBP1O60336 1514 aa29.31■■■□□ 2.28
TSTA3-214ENST00000531473 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.31■■■□□ 2.28
TSTA3-214ENST00000531473 AKNAQ7Z591 1439 aa29.3■■■□□ 2.28
TSTA3-214ENST00000531473 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.28■■■□□ 2.28
TSTA3-214ENST00000531473 MBD5Q9P267 1494 aa29.27■■■□□ 2.28
TSTA3-214ENST00000531473 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.27■■■□□ 2.28
TSTA3-214ENST00000531473 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
TSTA3-214ENST00000531473 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.25■■■□□ 2.27
TSTA3-214ENST00000531473 PLCH2O75038 1416 aa29.24■■■□□ 2.27
TSTA3-214ENST00000531473 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.22■■■□□ 2.27
TSTA3-214ENST00000531473 ROCK1Q13464 1354 aa29.22■■■□□ 2.27
TSTA3-214ENST00000531473 NCOA1Q15788 1441 aa29.21■■■□□ 2.27
TSTA3-214ENST00000531473 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.19■■■□□ 2.26
TSTA3-214ENST00000531473 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.18■■■□□ 2.26
TSTA3-214ENST00000531473 TRIM52Q96A61 297 aa29.17■■■□□ 2.26
TSTA3-214ENST00000531473 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.16■■■□□ 2.26
TSTA3-214ENST00000531473 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.15■■■□□ 2.26
TSTA3-214ENST00000531473 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.14■■■□□ 2.26
TSTA3-214ENST00000531473 ADGRL2O95490 1459 aa29.14■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 TSPY4P0CV99 314 aa29.13■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 TSPY10P0CW01 314 aa29.13■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.13■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.13■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.1■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.1■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.09■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 MIER1Q8N108 512 aa29.08■■■□□ 2.25
TSTA3-214ENST00000531473 ABCC1P33527 1531 aa29.07■■■□□ 2.24
TSTA3-214ENST00000531473 FOXD1Q16676 465 aa29.07■■■□□ 2.24
TSTA3-214ENST00000531473 FANCAO15360 1455 aa29.06■■■□□ 2.24
TSTA3-214ENST00000531473 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.06■■■□□ 2.24
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TSTA3-214ENST00000531473 KIF15Q9NS87 1388 aa29.04■■■□□ 2.24
TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.02■■■□□ 2.24
TSTA3-214ENST00000531473 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.01■■■□□ 2.23
TSTA3-214ENST00000531473 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29■■■□□ 2.23
TSTA3-214ENST00000531473 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.99■■■□□ 2.23
TSTA3-214ENST00000531473 CD109Q6YHK3 1445 aa28.98■■■□□ 2.23
TSTA3-214ENST00000531473 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.98■■■□□ 2.23
TSTA3-214ENST00000531473 ADGRL1O94910 1474 aa28.94■■■□□ 2.22
TSTA3-214ENST00000531473 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.93■■■□□ 2.22
TSTA3-214ENST00000531473 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.92■■■□□ 2.22
TSTA3-214ENST00000531473 PZPP20742 1482 aa28.92■■■□□ 2.22
TSTA3-214ENST00000531473 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
TSTA3-214ENST00000531473 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
TSTA3-214ENST00000531473 NUP155O75694 1391 aa28.84■■■□□ 2.21
TSTA3-214ENST00000531473 PLXNC1O60486 1568 aa28.84■■■□□ 2.21
TSTA3-214ENST00000531473 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.84■■■□□ 2.21
TSTA3-214ENST00000531473 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.83■■■□□ 2.21
TSTA3-214ENST00000531473 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.8■■■□□ 2.2
TSTA3-214ENST00000531473 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.24e-6■■■■□ 19.8
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TSTA3-214ENST00000531473 PKD2Q13563 968 aa28.78■■■□□ 2.2
TSTA3-214ENST00000531473 DIP2BQ9P265 1576 aa28.78■■■□□ 2.2
TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.76■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 RAPGEF3O95398 923 aa28.76■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 ATP7AQ04656 1500 aa28.75■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.75■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 TSPOAP1O95153 1857 aa28.74■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.72■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 GLI2P10070 1586 aa28.71■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 TONSLQ96HA7 1378 aa28.7■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.7■■■□□ 2.19
TSTA3-214ENST00000531473 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.7■■■□□ 2.18
TSTA3-214ENST00000531473 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.69■■■□□ 2.18
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.68■■■□□ 2.18
TSTA3-214ENST00000531473 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.68■■■□□ 2.18
TSTA3-214ENST00000531473 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.68■■■□□ 2.18
TSTA3-214ENST00000531473 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.67■■■□□ 2.18
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