RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531040.5

CARNS1-205, Transcript of carnosine synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CARNS1, Length 2,968 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARNS1-205ENST00000531040 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CARNS1-205ENST00000531040 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.73■■□□□ 1.87
CARNS1-205ENST00000531040 TONSLQ96HA7 1378 aa26.71■■□□□ 1.87
CARNS1-205ENST00000531040 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.7■■□□□ 1.86
CARNS1-205ENST00000531040 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.69■■□□□ 1.86
CARNS1-205ENST00000531040 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CARNS1-205ENST00000531040 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CARNS1-205ENST00000531040 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.66■■□□□ 1.86
CARNS1-205ENST00000531040 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CARNS1-205ENST00000531040 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
CARNS1-205ENST00000531040 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
CARNS1-205ENST00000531040 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.61■■□□□ 1.85
CARNS1-205ENST00000531040 AKNAQ7Z591 1439 aa26.6■■□□□ 1.85
CARNS1-205ENST00000531040 KCNH8Q96L42 1107 aa26.6■■□□□ 1.85
CARNS1-205ENST00000531040 ROCK1Q13464 1354 aa26.57■■□□□ 1.84
CARNS1-205ENST00000531040 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.57■■□□□ 1.84
CARNS1-205ENST00000531040 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CARNS1-205ENST00000531040 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CARNS1-205ENST00000531040 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.57■■□□□ 1.84
CARNS1-205ENST00000531040 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CARNS1-205ENST00000531040 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.55■■□□□ 1.84
CARNS1-205ENST00000531040 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.54■■□□□ 1.84
CARNS1-205ENST00000531040 NCOA1Q15788 1441 aa26.54■■□□□ 1.84
CARNS1-205ENST00000531040 SHROOM2Q13796 1616 aa26.52■■□□□ 1.84
CARNS1-205ENST00000531040 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.47■■□□□ 1.83
CARNS1-205ENST00000531040 TSPY4P0CV99 314 aa26.45■■□□□ 1.82
CARNS1-205ENST00000531040 TSPY10P0CW01 314 aa26.45■■□□□ 1.82
CARNS1-205ENST00000531040 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.44■■□□□ 1.82
CARNS1-205ENST00000531040 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.43■■□□□ 1.82
CARNS1-205ENST00000531040 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.41■■□□□ 1.82
CARNS1-205ENST00000531040 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.41■■□□□ 1.82
CARNS1-205ENST00000531040 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.4■■□□□ 1.82
CARNS1-205ENST00000531040 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.39■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 ABCC2Q92887 1545 aa26.39■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.39■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 PKD2Q13563 968 aa26.38■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 PZPP20742 1482 aa26.37■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.36■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.36■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.35■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.35■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 ADGRL2O95490 1459 aa26.35■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.33■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 MBD5Q9P267 1494 aa26.33■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
CARNS1-205ENST00000531040 NUP155O75694 1391 aa26.32■■□□□ 1.8
CARNS1-205ENST00000531040 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.32■■□□□ 1.8
CARNS1-205ENST00000531040 KIF15Q9NS87 1388 aa26.32■■□□□ 1.8
CARNS1-205ENST00000531040 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.31■■□□□ 1.8
CARNS1-205ENST00000531040 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CARNS1-205ENST00000531040 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CARNS1-205ENST00000531040 PREX2Q70Z35 1606 aa26.27■■□□□ 1.8
CARNS1-205ENST00000531040 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.27■■□□□ 1.8
CARNS1-205ENST00000531040 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CARNS1-205ENST00000531040 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
CARNS1-205ENST00000531040 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CARNS1-205ENST00000531040 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.24■■□□□ 1.79
CARNS1-205ENST00000531040 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.22■■□□□ 1.79
CARNS1-205ENST00000531040 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.21■■□□□ 1.79
CARNS1-205ENST00000531040 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
CARNS1-205ENST00000531040 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.18■■□□□ 1.78
CARNS1-205ENST00000531040 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.18■■□□□ 1.78
CARNS1-205ENST00000531040 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.17■■□□□ 1.78
CARNS1-205ENST00000531040 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CARNS1-205ENST00000531040 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.15■■□□□ 1.78
CARNS1-205ENST00000531040 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.15■■□□□ 1.78
CARNS1-205ENST00000531040 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.14■■□□□ 1.78
CARNS1-205ENST00000531040 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.14■■□□□ 1.77
CARNS1-205ENST00000531040 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.14■■□□□ 1.77
CARNS1-205ENST00000531040 OSCARQ8IYS5 282 aa26.13■■□□□ 1.77
CARNS1-205ENST00000531040 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.13■■□□□ 1.77
CARNS1-205ENST00000531040 AFAP1Q8N556 730 aa26.12■■□□□ 1.77
CARNS1-205ENST00000531040 PLCH2O75038 1416 aa26.12■■□□□ 1.77
CARNS1-205ENST00000531040 ANP32CO43423 234 aa26.1■■□□□ 1.77
CARNS1-205ENST00000531040 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.08■■□□□ 1.77
CARNS1-205ENST00000531040 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.07■■□□□ 1.76
CARNS1-205ENST00000531040 RGL3Q3MIN7 710 aa26.02■■□□□ 1.76
CARNS1-205ENST00000531040 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.02■■□□□ 1.76
CARNS1-205ENST00000531040 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.01■■□□□ 1.75
CARNS1-205ENST00000531040 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26■■□□□ 1.75
CARNS1-205ENST00000531040 POLR3GLQ9BT43 218 aa26■■□□□ 1.75
CARNS1-205ENST00000531040 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.99■■□□□ 1.75
CARNS1-205ENST00000531040 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CARNS1-205ENST00000531040 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CARNS1-205ENST00000531040 ASXL2Q76L83 1435 aa25.96■■□□□ 1.75
CARNS1-205ENST00000531040 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.96■■□□□ 1.75
CARNS1-205ENST00000531040 ABCC1P33527 1531 aa25.94■■□□□ 1.74
CARNS1-205ENST00000531040 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.93■■□□□ 1.74
CARNS1-205ENST00000531040 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
CARNS1-205ENST00000531040 CCDC7Q96M83 1385 aa25.92■■□□□ 1.74
CARNS1-205ENST00000531040 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.91■■□□□ 1.74
CARNS1-205ENST00000531040 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.9■■□□□ 1.74
CARNS1-205ENST00000531040 FANCAO15360 1455 aa25.9■■□□□ 1.74
CARNS1-205ENST00000531040 USP47Q96K76 1375 aa25.88■■□□□ 1.73
CARNS1-205ENST00000531040 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.88■■□□□ 1.73
CARNS1-205ENST00000531040 PLA2R1Q13018 1463 aa25.87■■□□□ 1.73
CARNS1-205ENST00000531040 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.87■■□□□ 1.73
CARNS1-205ENST00000531040 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.86■■□□□ 1.73
CARNS1-205ENST00000531040 CCER2I3L3R5 266 aa25.86■■□□□ 1.73
CARNS1-205ENST00000531040 PLXNC1O60486 1568 aa25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms