RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526284.5

TSSC2-202, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 2 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSSC2, Length 1,244 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC2-202ENST00000526284 HECW1Q76N89 1606 aa26.21■■□□□ 1.79
TSSC2-202ENST00000526284 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.2■■□□□ 1.79
TSSC2-202ENST00000526284 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.18■■□□□ 1.78
TSSC2-202ENST00000526284 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
TSSC2-202ENST00000526284 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
TSSC2-202ENST00000526284 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.15■■□□□ 1.78
TSSC2-202ENST00000526284 ATP10AO60312 1499 aa26.13■■□□□ 1.77
TSSC2-202ENST00000526284 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.12■■□□□ 1.77
TSSC2-202ENST00000526284 CERKQ8TCT0 537 aa26.12■■□□□ 1.77
TSSC2-202ENST00000526284 FMN1Q68DA7 1419 aa26.12■■□□□ 1.77
TSSC2-202ENST00000526284 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.09■■□□□ 1.77
TSSC2-202ENST00000526284 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TSSC2-202ENST00000526284 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.07■■□□□ 1.76
TSSC2-202ENST00000526284 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.06■■□□□ 1.76
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TSSC2-202ENST00000526284 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.04■■□□□ 1.76
TSSC2-202ENST00000526284 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.04■■□□□ 1.76
TSSC2-202ENST00000526284 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.01■■□□□ 1.75
TSSC2-202ENST00000526284 KIF14Q15058 1648 aa26■■□□□ 1.75
TSSC2-202ENST00000526284 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
TSSC2-202ENST00000526284 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.99■■□□□ 1.75
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TSSC2-202ENST00000526284 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.98■■□□□ 1.75
TSSC2-202ENST00000526284 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.98■■□□□ 1.75
TSSC2-202ENST00000526284 CLIP1P30622 1438 aa25.97■■□□□ 1.75
TSSC2-202ENST00000526284 KDM5CP41229 1560 aa25.94■■□□□ 1.74
TSSC2-202ENST00000526284 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.91■■□□□ 1.74
TSSC2-202ENST00000526284 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TSSC2-202ENST00000526284 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.88■■□□□ 1.73
TSSC2-202ENST00000526284 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.88■■□□□ 1.73
TSSC2-202ENST00000526284 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.88■■□□□ 1.73
TSSC2-202ENST00000526284 STRCQ7RTU9 1775 aa25.87■■□□□ 1.73
TSSC2-202ENST00000526284 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.86■■□□□ 1.73
TSSC2-202ENST00000526284 REREQ9P2R6 1566 aa25.86■■□□□ 1.73
TSSC2-202ENST00000526284 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.84■■□□□ 1.73
TSSC2-202ENST00000526284 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.84■■□□□ 1.73
TSSC2-202ENST00000526284 ABCA6Q8N139 1617 aa25.82■■□□□ 1.72
TSSC2-202ENST00000526284 AGLP35573 1532 aa25.81■■□□□ 1.72
TSSC2-202ENST00000526284 C3P01024 1663 aa25.79■■□□□ 1.72
TSSC2-202ENST00000526284 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.79■■□□□ 1.72
TSSC2-202ENST00000526284 PREX2Q70Z35 1606 aa25.78■■□□□ 1.72
TSSC2-202ENST00000526284 PTPRTO14522 1441 aa25.78■■□□□ 1.72
TSSC2-202ENST00000526284 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.78■■□□□ 1.72
TSSC2-202ENST00000526284 ABCC1P33527 1531 aa25.78■■□□□ 1.72
TSSC2-202ENST00000526284 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.74■■□□□ 1.71
TSSC2-202ENST00000526284 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TSSC2-202ENST00000526284 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.73■■□□□ 1.71
TSSC2-202ENST00000526284 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.73■■□□□ 1.71
TSSC2-202ENST00000526284 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.72■■□□□ 1.71
TSSC2-202ENST00000526284 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.7■■□□□ 1.7
TSSC2-202ENST00000526284 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
TSSC2-202ENST00000526284 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.71e-8■■■□□ 18.9
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TSSC2-202ENST00000526284 NCOA1Q15788 1441 aa25.65■■□□□ 1.7
TSSC2-202ENST00000526284 ZMYM3Q14202 1370 aa25.65■■□□□ 1.7
TSSC2-202ENST00000526284 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.65■■□□□ 1.7
TSSC2-202ENST00000526284 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.63■■□□□ 1.69
TSSC2-202ENST00000526284 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
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TSSC2-202ENST00000526284 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.59■■□□□ 1.69
TSSC2-202ENST00000526284 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
TSSC2-202ENST00000526284 MROH2AA6NES4 1674 aa25.58■■□□□ 1.69
TSSC2-202ENST00000526284 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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TSSC2-202ENST00000526284 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.58■■□□□ 1.69
TSSC2-202ENST00000526284 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.57■■□□□ 1.68
TSSC2-202ENST00000526284 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.57■■□□□ 1.68
TSSC2-202ENST00000526284 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.57■■□□□ 1.68
TSSC2-202ENST00000526284 GGT6Q6P531 493 aa25.55■■□□□ 1.68
TSSC2-202ENST00000526284 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.54■■□□□ 1.68
TSSC2-202ENST00000526284 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.53■■□□□ 1.68
TSSC2-202ENST00000526284 ATP7AQ04656 1500 aa25.53■■□□□ 1.68
TSSC2-202ENST00000526284 A2MP01023 1474 aa25.53■■□□□ 1.68
TSSC2-202ENST00000526284 PKD2Q13563 968 aa25.51■■□□□ 1.67
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TSSC2-202ENST00000526284 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.48■■□□□ 1.67
TSSC2-202ENST00000526284 PTPRKQ15262 1439 aa25.47■■□□□ 1.67
TSSC2-202ENST00000526284 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.47■■□□□ 1.67
TSSC2-202ENST00000526284 PLXNC1O60486 1568 aa25.47■■□□□ 1.67
TSSC2-202ENST00000526284 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TSSC2-202ENST00000526284 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.46■■□□□ 1.67
TSSC2-202ENST00000526284 PLA2R1Q13018 1463 aa25.45■■□□□ 1.66
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TSSC2-202ENST00000526284 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.43■■□□□ 1.66
TSSC2-202ENST00000526284 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TSSC2-202ENST00000526284 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TSSC2-202ENST00000526284 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TSSC2-202ENST00000526284 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.39■■□□□ 1.65
TSSC2-202ENST00000526284 MBD5Q9P267 1494 aa25.36■■□□□ 1.65
TSSC2-202ENST00000526284 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TSSC2-202ENST00000526284 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.35■■□□□ 1.65
TSSC2-202ENST00000526284 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.33■■□□□ 1.65
TSSC2-202ENST00000526284 TIAM1Q13009 1591 aa25.32■■□□□ 1.64
TSSC2-202ENST00000526284 KIF3BO15066 747 aa25.32■■□□□ 1.64
TSSC2-202ENST00000526284 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TSSC2-202ENST00000526284 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TSSC2-202ENST00000526284 CEP162Q5TB80 1403 aa25.29■■□□□ 1.64
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