RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRU-209ENST00000526080 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRU-209ENST00000526080 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRU-209ENST00000526080 ATP10AO60312 1499 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRU-209ENST00000526080 CERKQ8TCT0 537 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRU-209ENST00000526080 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRU-209ENST00000526080 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRU-209ENST00000526080 MLECQ14165 292 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRU-209ENST00000526080 KDM5CP41229 1560 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRU-209ENST00000526080 KIF14Q15058 1648 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRU-209ENST00000526080 STRCQ7RTU9 1775 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRU-209ENST00000526080 REREQ9P2R6 1566 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRU-209ENST00000526080 FMN1Q68DA7 1419 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRU-209ENST00000526080 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRU-209ENST00000526080 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRU-209ENST00000526080 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRU-209ENST00000526080 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRU-209ENST00000526080 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-209ENST00000526080 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-209ENST00000526080 ABCA6Q8N139 1617 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-209ENST00000526080 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRU-209ENST00000526080 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-209ENST00000526080 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRU-209ENST00000526080 AFAP1Q8N556 730 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRU-209ENST00000526080 C3P01024 1663 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRU-209ENST00000526080 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRU-209ENST00000526080 AGLP35573 1532 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-209ENST00000526080 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-209ENST00000526080 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-209ENST00000526080 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-209ENST00000526080 ABCC1P33527 1531 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRU-209ENST00000526080 PTPRTO14522 1441 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRU-209ENST00000526080 PREX2Q70Z35 1606 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-209ENST00000526080 CLIP1P30622 1438 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-209ENST00000526080 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-209ENST00000526080 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-209ENST00000526080 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-209ENST00000526080 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-209ENST00000526080 ILDR2Q71H61 639 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-209ENST00000526080 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-209ENST00000526080 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-209ENST00000526080 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRU-209ENST00000526080 NCOA1Q15788 1441 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRU-209ENST00000526080 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-209ENST00000526080 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-209ENST00000526080 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-209ENST00000526080 SOCS7O14512 581 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRU-209ENST00000526080 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRU-209ENST00000526080 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRU-209ENST00000526080 MROH2AA6NES4 1674 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRU-209ENST00000526080 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRU-209ENST00000526080 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRU-209ENST00000526080 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRU-209ENST00000526080 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRU-209ENST00000526080 NPATQ14207 1427 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-209ENST00000526080 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRU-209ENST00000526080 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-209ENST00000526080 PLXNC1O60486 1568 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-209ENST00000526080 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRU-209ENST00000526080 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRU-209ENST00000526080 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRU-209ENST00000526080 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-209ENST00000526080 ZMYM3Q14202 1370 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-209ENST00000526080 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-209ENST00000526080 ATP7AQ04656 1500 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRU-209ENST00000526080 PLA2R1Q13018 1463 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-209ENST00000526080 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-209ENST00000526080 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-209ENST00000526080 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRU-209ENST00000526080 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-209ENST00000526080 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-209ENST00000526080 PTPRKQ15262 1439 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRU-209ENST00000526080 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRU-209ENST00000526080 A2MP01023 1474 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-209ENST00000526080 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-209ENST00000526080 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-209ENST00000526080 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-209ENST00000526080 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRU-209ENST00000526080 PKD2Q13563 968 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRU-209ENST00000526080 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-209ENST00000526080 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
PTPRU-209ENST00000526080 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRU-209ENST00000526080 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRU-209ENST00000526080 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRU-209ENST00000526080 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRU-209ENST00000526080 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRU-209ENST00000526080 MBD5Q9P267 1494 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRU-209ENST00000526080 TIAM1Q13009 1591 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRU-209ENST00000526080 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRU-209ENST00000526080 GGT6Q6P531 493 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRU-209ENST00000526080 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRU-209ENST00000526080 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-209ENST00000526080 CPS1P31327 1500 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-209ENST00000526080 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-209ENST00000526080 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.54■■□□□ 1.2
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