RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
UBASH3B-202ENST00000525711 MLECQ14165 292 aa23.77■■□□□ 1.4
UBASH3B-202ENST00000525711 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.76■■□□□ 1.39
UBASH3B-202ENST00000525711 PLCH2O75038 1416 aa23.76■■□□□ 1.39
UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.74■■□□□ 1.39
UBASH3B-202ENST00000525711 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.73■■□□□ 1.39
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP10AO60312 1499 aa23.73■■□□□ 1.39
UBASH3B-202ENST00000525711 CERKQ8TCT0 537 aa23.72■■□□□ 1.39
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF14Q15058 1648 aa23.7■■□□□ 1.38
UBASH3B-202ENST00000525711 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
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UBASH3B-202ENST00000525711 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.67■■□□□ 1.38
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.67■■□□□ 1.38
UBASH3B-202ENST00000525711 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.64■■□□□ 1.37
UBASH3B-202ENST00000525711 KDM5CP41229 1560 aa23.63■■□□□ 1.37
UBASH3B-202ENST00000525711 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.6■■□□□ 1.37
UBASH3B-202ENST00000525711 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.6■■□□□ 1.37
UBASH3B-202ENST00000525711 CLIP1P30622 1438 aa23.59■■□□□ 1.37
UBASH3B-202ENST00000525711 REREQ9P2R6 1566 aa23.59■■□□□ 1.37
UBASH3B-202ENST00000525711 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.59■■□□□ 1.37
UBASH3B-202ENST00000525711 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.59■■□□□ 1.37
UBASH3B-202ENST00000525711 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.58■■□□□ 1.37
UBASH3B-202ENST00000525711 C3P01024 1663 aa23.57■■□□□ 1.36
UBASH3B-202ENST00000525711 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.57■■□□□ 1.36
UBASH3B-202ENST00000525711 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.56■■□□□ 1.36
UBASH3B-202ENST00000525711 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCA6Q8N139 1617 aa23.55■■□□□ 1.36
UBASH3B-202ENST00000525711 PREX2Q70Z35 1606 aa23.53■■□□□ 1.36
UBASH3B-202ENST00000525711 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.52■■□□□ 1.36
UBASH3B-202ENST00000525711 AFAP1Q8N556 730 aa23.51■■□□□ 1.35
UBASH3B-202ENST00000525711 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.49■■□□□ 1.35
UBASH3B-202ENST00000525711 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.48■■□□□ 1.35
UBASH3B-202ENST00000525711 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCC1P33527 1531 aa23.47■■□□□ 1.35
UBASH3B-202ENST00000525711 AGLP35573 1532 aa23.47■■□□□ 1.35
UBASH3B-202ENST00000525711 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.46■■□□□ 1.35
UBASH3B-202ENST00000525711 PTPRTO14522 1441 aa23.45■■□□□ 1.34
UBASH3B-202ENST00000525711 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.45■■□□□ 1.34
UBASH3B-202ENST00000525711 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.44■■□□□ 1.34
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.43■■□□□ 1.34
UBASH3B-202ENST00000525711 MROH2AA6NES4 1674 aa23.41■■□□□ 1.34
UBASH3B-202ENST00000525711 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.41■■□□□ 1.34
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.41■■□□□ 1.34
UBASH3B-202ENST00000525711 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.4■■□□□ 1.34
UBASH3B-202ENST00000525711 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.37■■□□□ 1.33
UBASH3B-202ENST00000525711 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
UBASH3B-202ENST00000525711 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.35■■□□□ 1.33
UBASH3B-202ENST00000525711 NCOA1Q15788 1441 aa23.33■■□□□ 1.33
UBASH3B-202ENST00000525711 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.33■■□□□ 1.33
UBASH3B-202ENST00000525711 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.32■■□□□ 1.32
UBASH3B-202ENST00000525711 SOCS7O14512 581 aa23.32■■□□□ 1.32
UBASH3B-202ENST00000525711 ILDR2Q71H61 639 aa23.32■■□□□ 1.32
UBASH3B-202ENST00000525711 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.32■■□□□ 1.32
UBASH3B-202ENST00000525711 NPATQ14207 1427 aa23.3■■□□□ 1.32
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UBASH3B-202ENST00000525711 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.29■■□□□ 1.32
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UBASH3B-202ENST00000525711 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.28■■□□□ 1.32
UBASH3B-202ENST00000525711 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.27■■□□□ 1.32
UBASH3B-202ENST00000525711 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.26■■□□□ 1.31
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP7AQ04656 1500 aa23.24■■□□□ 1.31
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
UBASH3B-202ENST00000525711 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
UBASH3B-202ENST00000525711 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
UBASH3B-202ENST00000525711 ZMYM3Q14202 1370 aa23.22■■□□□ 1.31
UBASH3B-202ENST00000525711 PLXNC1O60486 1568 aa23.21■■□□□ 1.31
UBASH3B-202ENST00000525711 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.2■■□□□ 1.3
UBASH3B-202ENST00000525711 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.2■■□□□ 1.3
UBASH3B-202ENST00000525711 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
UBASH3B-202ENST00000525711 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
UBASH3B-202ENST00000525711 PLA2R1Q13018 1463 aa23.18■■□□□ 1.3
UBASH3B-202ENST00000525711 A2MP01023 1474 aa23.17■■□□□ 1.3
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.16■■□□□ 1.3
UBASH3B-202ENST00000525711 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.14■■□□□ 1.3
UBASH3B-202ENST00000525711 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
UBASH3B-202ENST00000525711 PKD2Q13563 968 aa23.14■■□□□ 1.29
UBASH3B-202ENST00000525711 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
UBASH3B-202ENST00000525711 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
UBASH3B-202ENST00000525711 PTPRKQ15262 1439 aa23.11■■□□□ 1.29
UBASH3B-202ENST00000525711 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.11■■□□□ 1.29
UBASH3B-202ENST00000525711 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
UBASH3B-202ENST00000525711 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.1■■□□□ 1.29
UBASH3B-202ENST00000525711 GGT6Q6P531 493 aa23.08■■□□□ 1.29
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.06■■□□□ 1.28
UBASH3B-202ENST00000525711 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
UBASH3B-202ENST00000525711 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.04■■□□□ 1.28
UBASH3B-202ENST00000525711 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.04■■□□□ 1.28
UBASH3B-202ENST00000525711 TIAM1Q13009 1591 aa23.02■■□□□ 1.28
UBASH3B-202ENST00000525711 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23■■□□□ 1.27
UBASH3B-202ENST00000525711 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.98■■□□□ 1.27
UBASH3B-202ENST00000525711 CPS1P31327 1500 aa22.98■■□□□ 1.27
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.98■■□□□ 1.27
UBASH3B-202ENST00000525711 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.95■■□□□ 1.26
UBASH3B-202ENST00000525711 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.95■■□□□ 1.26
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