RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 MAPKBP1O60336 1514 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRK-216ENST00000524481 HFM1A2PYH4 1435 aa16.68■□□□□ 0.26
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PTPRK-216ENST00000524481 ARHGEF11O15085 1522 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-216ENST00000524481 PKD2Q13563 968 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-216ENST00000524481 ATP10BO94823 1461 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRK-216ENST00000524481 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.67■□□□□ 0.26
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PTPRK-216ENST00000524481 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
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PTPRK-216ENST00000524481 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-216ENST00000524481 DAPK1P53355 1430 aa16.62■□□□□ 0.25
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PTPRK-216ENST00000524481 MIA2Q96PC5 1412 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-216ENST00000524481 NUP155O75694 1391 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.6■□□□□ 0.25
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PTPRK-216ENST00000524481 KIF14Q15058 1648 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRK-216ENST00000524481 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.52■□□□□ 0.23
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PTPRK-216ENST00000524481 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRK-216ENST00000524481 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-216ENST00000524481 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-216ENST00000524481 NCOA1Q15788 1441 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRK-216ENST00000524481 KIF15Q9NS87 1388 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRK-216ENST00000524481 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRK-216ENST00000524481 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRK-216ENST00000524481 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRK-216ENST00000524481 AKNAQ7Z591 1439 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRK-216ENST00000524481 ABCA8O94911 1581 aa16.43■□□□□ 0.22
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PTPRK-216ENST00000524481 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRK-216ENST00000524481 KIF3BO15066 747 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRK-216ENST00000524481 ROCK1Q13464 1354 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRK-216ENST00000524481 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRK-216ENST00000524481 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRK-216ENST00000524481 GGT6Q6P531 493 aa16.38■□□□□ 0.21
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PTPRK-216ENST00000524481 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.35■□□□□ 0.21
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PTPRK-216ENST00000524481 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
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PTPRK-216ENST00000524481 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 BCANQ96GW7 911 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 ABCC2Q92887 1545 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.31■□□□□ 0.2
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PTPRK-216ENST00000524481 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 PZPP20742 1482 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRK-216ENST00000524481 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.2
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PTPRK-216ENST00000524481 PLCH2O75038 1416 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 ASXL2Q76L83 1435 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC184Q52MB2 194 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 MLECQ14165 292 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 MRS2Q9HD23 443 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.22■□□□□ 0.19
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PTPRK-216ENST00000524481 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PTPRK-216ENST00000524481 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
PTPRK-216ENST00000524481 USP47Q96K76 1375 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRK-216ENST00000524481 FANCAO15360 1455 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRK-216ENST00000524481 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRK-216ENST00000524481 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRK-216ENST00000524481 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRK-216ENST00000524481 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.17■□□□□ 0.18
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