RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523213.1

ZBED8-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED8, Length 2,484 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-202ENST00000523213 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
ZBED8-202ENST00000523213 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.26■□□□□ 0.99
ZBED8-202ENST00000523213 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
ZBED8-202ENST00000523213 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.25■□□□□ 0.99
ZBED8-202ENST00000523213 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
ZBED8-202ENST00000523213 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
ZBED8-202ENST00000523213 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.21■□□□□ 0.99
ZBED8-202ENST00000523213 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.2■□□□□ 0.98
ZBED8-202ENST00000523213 TONSLQ96HA7 1378 aa21.19■□□□□ 0.98
ZBED8-202ENST00000523213 AKNAQ7Z591 1439 aa21.18■□□□□ 0.98
ZBED8-202ENST00000523213 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
ZBED8-202ENST00000523213 SHROOM2Q13796 1616 aa21.18■□□□□ 0.98
ZBED8-202ENST00000523213 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.17■□□□□ 0.98
ZBED8-202ENST00000523213 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.17■□□□□ 0.98
ZBED8-202ENST00000523213 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.16■□□□□ 0.98
ZBED8-202ENST00000523213 ROCK1Q13464 1354 aa21.15■□□□□ 0.98
ZBED8-202ENST00000523213 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.14■□□□□ 0.98
ZBED8-202ENST00000523213 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
ZBED8-202ENST00000523213 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
ZBED8-202ENST00000523213 NCOA1Q15788 1441 aa21.11■□□□□ 0.97
ZBED8-202ENST00000523213 KCNH8Q96L42 1107 aa21.1■□□□□ 0.97
ZBED8-202ENST00000523213 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.08■□□□□ 0.97
ZBED8-202ENST00000523213 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ZBED8-202ENST00000523213 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.07■□□□□ 0.96
ZBED8-202ENST00000523213 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ZBED8-202ENST00000523213 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.05■□□□□ 0.96
ZBED8-202ENST00000523213 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
ZBED8-202ENST00000523213 ABCC2Q92887 1545 aa21.02■□□□□ 0.96
ZBED8-202ENST00000523213 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.02■□□□□ 0.96
ZBED8-202ENST00000523213 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.01■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.01■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.01■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.01■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.01■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 PZPP20742 1482 aa21■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 ADGRL2O95490 1459 aa20.99■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.98■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 TSPY4P0CV99 314 aa20.98■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 TSPY10P0CW01 314 aa20.98■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 MBD5Q9P267 1494 aa20.97■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.97■□□□□ 0.95
ZBED8-202ENST00000523213 PREX2Q70Z35 1606 aa20.95■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 PKD2Q13563 968 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.94■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 KIF15Q9NS87 1388 aa20.92■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.91■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.91■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 NUP155O75694 1391 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.9■□□□□ 0.94
ZBED8-202ENST00000523213 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.88■□□□□ 0.93
ZBED8-202ENST00000523213 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
ZBED8-202ENST00000523213 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.87■□□□□ 0.93
ZBED8-202ENST00000523213 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.85■□□□□ 0.93
ZBED8-202ENST00000523213 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.85■□□□□ 0.93
ZBED8-202ENST00000523213 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.85■□□□□ 0.93
ZBED8-202ENST00000523213 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.84■□□□□ 0.93
ZBED8-202ENST00000523213 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.84■□□□□ 0.93
ZBED8-202ENST00000523213 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ZBED8-202ENST00000523213 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.92
ZBED8-202ENST00000523213 PLCH2O75038 1416 aa20.79■□□□□ 0.92
ZBED8-202ENST00000523213 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
ZBED8-202ENST00000523213 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.77■□□□□ 0.92
ZBED8-202ENST00000523213 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.91
ZBED8-202ENST00000523213 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.77■□□□□ 0.91
ZBED8-202ENST00000523213 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.76■□□□□ 0.91
ZBED8-202ENST00000523213 OSCARQ8IYS5 282 aa20.76■□□□□ 0.91
ZBED8-202ENST00000523213 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.75■□□□□ 0.91
ZBED8-202ENST00000523213 AFAP1Q8N556 730 aa20.75■□□□□ 0.91
ZBED8-202ENST00000523213 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.73■□□□□ 0.91
ZBED8-202ENST00000523213 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.71■□□□□ 0.91
ZBED8-202ENST00000523213 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.7■□□□□ 0.9
ZBED8-202ENST00000523213 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.7■□□□□ 0.9
ZBED8-202ENST00000523213 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.69■□□□□ 0.9
ZBED8-202ENST00000523213 ANP32CO43423 234 aa20.69■□□□□ 0.9
ZBED8-202ENST00000523213 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.68■□□□□ 0.9
ZBED8-202ENST00000523213 ABCC1P33527 1531 aa20.67■□□□□ 0.9
ZBED8-202ENST00000523213 ASXL2Q76L83 1435 aa20.65■□□□□ 0.9
ZBED8-202ENST00000523213 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.64■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 PLXNC1O60486 1568 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 RGL3Q3MIN7 710 aa20.63■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.62■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 FANCAO15360 1455 aa20.6■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 PLA2R1Q13018 1463 aa20.6■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 CCDC7Q96M83 1385 aa20.6■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 UNC13BO14795 1591 aa20.6■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.6■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.6■□□□□ 0.89
ZBED8-202ENST00000523213 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.58■□□□□ 0.88
ZBED8-202ENST00000523213 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.58■□□□□ 0.88
ZBED8-202ENST00000523213 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ZBED8-202ENST00000523213 USP47Q96K76 1375 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED8-202ENST00000523213 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.56■□□□□ 0.88
ZBED8-202ENST00000523213 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
ZBED8-202ENST00000523213 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms