RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522926.1

TNIP1-216, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNIP1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-216ENST00000522926 PLCH2O75038 1416 aa30.73■■■□□ 2.51
TNIP1-216ENST00000522926 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.67■■■□□ 2.5
TNIP1-216ENST00000522926 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.65■■■□□ 2.5
TNIP1-216ENST00000522926 ATP10AO60312 1499 aa30.63■■■□□ 2.49
TNIP1-216ENST00000522926 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.63■■■□□ 2.49
TNIP1-216ENST00000522926 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
TNIP1-216ENST00000522926 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.59■■■□□ 2.49
TNIP1-216ENST00000522926 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
TNIP1-216ENST00000522926 CERKQ8TCT0 537 aa30.59■■■□□ 2.49
TNIP1-216ENST00000522926 KIF14Q15058 1648 aa30.58■■■□□ 2.49
TNIP1-216ENST00000522926 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.58■■■□□ 2.49
TNIP1-216ENST00000522926 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.58■■■□□ 2.49
TNIP1-216ENST00000522926 FMN1Q68DA7 1419 aa30.56■■■□□ 2.48
TNIP1-216ENST00000522926 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.55■■■□□ 2.48
TNIP1-216ENST00000522926 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
TNIP1-216ENST00000522926 AFAP1Q8N556 730 aa30.53■■■□□ 2.48
TNIP1-216ENST00000522926 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.49■■■□□ 2.47
TNIP1-216ENST00000522926 KDM5CP41229 1560 aa30.48■■■□□ 2.47
TNIP1-216ENST00000522926 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.47■■■□□ 2.47
TNIP1-216ENST00000522926 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
TNIP1-216ENST00000522926 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.47■■■□□ 2.47
TNIP1-216ENST00000522926 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.43■■■□□ 2.46
TNIP1-216ENST00000522926 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.43■■■□□ 2.46
TNIP1-216ENST00000522926 STRCQ7RTU9 1775 aa30.41■■■□□ 2.46
TNIP1-216ENST00000522926 ABCA6Q8N139 1617 aa30.37■■■□□ 2.45
TNIP1-216ENST00000522926 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.37■■■□□ 2.45
TNIP1-216ENST00000522926 CLIP1P30622 1438 aa30.37■■■□□ 2.45
TNIP1-216ENST00000522926 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.36■■■□□ 2.45
TNIP1-216ENST00000522926 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.36■■■□□ 2.45
TNIP1-216ENST00000522926 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.35■■■□□ 2.45
TNIP1-216ENST00000522926 REREQ9P2R6 1566 aa30.33■■■□□ 2.45
TNIP1-216ENST00000522926 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.33■■■□□ 2.45
TNIP1-216ENST00000522926 ABCC1P33527 1531 aa30.3■■■□□ 2.44
TNIP1-216ENST00000522926 C3P01024 1663 aa30.28■■■□□ 2.44
TNIP1-216ENST00000522926 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.28■■■□□ 2.44
TNIP1-216ENST00000522926 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
TNIP1-216ENST00000522926 PREX2Q70Z35 1606 aa30.27■■■□□ 2.44
TNIP1-216ENST00000522926 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.27■■■□□ 2.44
TNIP1-216ENST00000522926 AGLP35573 1532 aa30.27■■■□□ 2.44
TNIP1-216ENST00000522926 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.23■■■□□ 2.43
TNIP1-216ENST00000522926 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.22■■■□□ 2.43
TNIP1-216ENST00000522926 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.21■■■□□ 2.43
TNIP1-216ENST00000522926 ILDR2Q71H61 639 aa30.2■■■□□ 2.43
TNIP1-216ENST00000522926 PTPRTO14522 1441 aa30.2■■■□□ 2.42
TNIP1-216ENST00000522926 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.18■■■□□ 2.42
TNIP1-216ENST00000522926 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.16■■■□□ 2.42
TNIP1-216ENST00000522926 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
TNIP1-216ENST00000522926 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.16■■■□□ 2.42
TNIP1-216ENST00000522926 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.14■■■□□ 2.41
TNIP1-216ENST00000522926 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.13■■■□□ 2.41
TNIP1-216ENST00000522926 NCOA1Q15788 1441 aa30.13■■■□□ 2.41
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
TNIP1-216ENST00000522926 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.1■■■□□ 2.41
TNIP1-216ENST00000522926 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.08■■■□□ 2.41
TNIP1-216ENST00000522926 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
TNIP1-216ENST00000522926 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
TNIP1-216ENST00000522926 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.05■■■□□ 2.4
TNIP1-216ENST00000522926 ZMYM3Q14202 1370 aa30.03■■■□□ 2.4
TNIP1-216ENST00000522926 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
TNIP1-216ENST00000522926 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.03■■■□□ 2.4
TNIP1-216ENST00000522926 NPATQ14207 1427 aa30.02■■■□□ 2.4
TNIP1-216ENST00000522926 MROH2AA6NES4 1674 aa29.99■■■□□ 2.39
TNIP1-216ENST00000522926 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TNIP1-216ENST00000522926 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.98■■■□□ 2.39
TNIP1-216ENST00000522926 SOCS7O14512 581 aa29.97■■■□□ 2.39
TNIP1-216ENST00000522926 ATP7AQ04656 1500 aa29.96■■■□□ 2.39
TNIP1-216ENST00000522926 PLXNC1O60486 1568 aa29.95■■■□□ 2.39
TNIP1-216ENST00000522926 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.95■■■□□ 2.39
TNIP1-216ENST00000522926 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.95■■■□□ 2.39
TNIP1-216ENST00000522926 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
TNIP1-216ENST00000522926 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
TNIP1-216ENST00000522926 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.93■■■□□ 2.38
TNIP1-216ENST00000522926 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
TNIP1-216ENST00000522926 A2MP01023 1474 aa29.92■■■□□ 2.38
TNIP1-216ENST00000522926 PTPRKQ15262 1439 aa29.91■■■□□ 2.38
TNIP1-216ENST00000522926 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.89■■■□□ 2.37
TNIP1-216ENST00000522926 GGT6Q6P531 493 aa29.88■■■□□ 2.37
TNIP1-216ENST00000522926 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.88■■■□□ 2.37
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
TNIP1-216ENST00000522926 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.86■■■□□ 2.37
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
TNIP1-216ENST00000522926 PLA2R1Q13018 1463 aa29.84■■■□□ 2.37
TNIP1-216ENST00000522926 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
TNIP1-216ENST00000522926 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
TNIP1-216ENST00000522926 PKD2Q13563 968 aa29.8■■■□□ 2.36
TNIP1-216ENST00000522926 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.79■■■□□ 2.36
TNIP1-216ENST00000522926 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.79■■■□□ 2.36
TNIP1-216ENST00000522926 MBD5Q9P267 1494 aa29.79■■■□□ 2.36
TNIP1-216ENST00000522926 TIAM1Q13009 1591 aa29.77■■■□□ 2.36
TNIP1-216ENST00000522926 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.73■■■□□ 2.35
TNIP1-216ENST00000522926 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.72■■■□□ 2.35
TNIP1-216ENST00000522926 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.71■■■□□ 2.35
TNIP1-216ENST00000522926 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
TNIP1-216ENST00000522926 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
TNIP1-216ENST00000522926 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
TNIP1-216ENST00000522926 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.67■■■□□ 2.34
TNIP1-216ENST00000522926 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.66■■■□□ 2.34
TNIP1-216ENST00000522926 CEP162Q5TB80 1403 aa29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms