RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517402.1

HOXA11-202, Transcript of homeobox A11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXA11, Length 2,137 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-202ENST00000517402 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
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HOXA11-202ENST00000517402 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXA11-202ENST00000517402 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
HOXA11-202ENST00000517402 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
HOXA11-202ENST00000517402 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXA11-202ENST00000517402 MIER1Q8N108 512 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXA11-202ENST00000517402 ROCK1Q13464 1354 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXA11-202ENST00000517402 TRIM52Q96A61 297 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXA11-202ENST00000517402 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXA11-202ENST00000517402 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXA11-202ENST00000517402 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXA11-202ENST00000517402 TONSLQ96HA7 1378 aa28.39■■■□□ 2.13
HOXA11-202ENST00000517402 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXA11-202ENST00000517402 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
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HOXA11-202ENST00000517402 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXA11-202ENST00000517402 NCOA1Q15788 1441 aa28.31■■■□□ 2.12
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HOXA11-202ENST00000517402 ADGRL2O95490 1459 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXA11-202ENST00000517402 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXA11-202ENST00000517402 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXA11-202ENST00000517402 PREX2Q70Z35 1606 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXA11-202ENST00000517402 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXA11-202ENST00000517402 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXA11-202ENST00000517402 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
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HOXA11-202ENST00000517402 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
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HOXA11-202ENST00000517402 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXA11-202ENST00000517402 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXA11-202ENST00000517402 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.79■■■□□ 2.04
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HOXA11-202ENST00000517402 ASXL2Q76L83 1435 aa27.73■■■□□ 2.03
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HOXA11-202ENST00000517402 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
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HOXA11-202ENST00000517402 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXA11-202ENST00000517402 ERBINQ96RT1 1412 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXA11-202ENST00000517402 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXA11-202ENST00000517402 ANP32CO43423 234 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXA11-202ENST00000517402 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.64■■■□□ 2.01
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HOXA11-202ENST00000517402 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.63■■■□□ 2.01
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HOXA11-202ENST00000517402 ADGRL1O94910 1474 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXA11-202ENST00000517402 PLA2R1Q13018 1463 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXA11-202ENST00000517402 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXA11-202ENST00000517402 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.57■■■□□ 2
HOXA11-202ENST00000517402 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
HOXA11-202ENST00000517402 CCDC7Q96M83 1385 aa27.56■■■□□ 2
HOXA11-202ENST00000517402 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.56■■■□□ 2
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