RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	STK25	O00506	426 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC24A1	O60721	1099 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	IFNL1	Q8IU54	200 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	NCAPD3	P42695	1498 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	PLCB2	Q00722	1185 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	HMGXB3	Q12766	1538 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF27	Q86VH2	1401 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP3K1	Q13233	1512 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	STK24	Q9Y6E0	443 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	GABBR2	O75899	941 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	PSEN1	P49768	467 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	CFTR	P13569	1480 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP44	Q96MT7	982 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	MAPKBP1	O60336	1514 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	IGF1R	P08069	1367 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	TIAM1	Q13009	1591 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	CLCN6	P51797	869 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	TRPC6	Q9Y210	931 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ATXN3-212	ENST00000515746	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	POTEI	P0CG38	1075 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	CABP2	Q9NPB3	220 aa		7.13	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	TIE1	P35590	1138 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		7.12	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNH8	Q96L42	1107 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR97	A6NE52	1622 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA2	Q08379	1002 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	7.1	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	SOX12	O15370	315 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	PRDM2	Q13029	1718 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ATXN3-212	ENST00000515746	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	CCER2	I3L3R5	266 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	MFRP	Q9BY79	579 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		7.08	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	POTEM	A6NI47	508 aa		7.07	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	ITGAE	P38570	1179 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	NLRP6	P59044	892 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		7.04	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		7.03	□□□□□ -1.28
ATXN3-212	ENST00000515746	HFM1	A2PYH4	1435 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPRK	Q15262	1439 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	POTEG	Q6S5H5	508 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	UACA	Q9BZF9	1416 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		7	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		7	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R37	O75864	691 aa		7	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	7	□□□□□ -1.29	3e-6	■■□□□ 13.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		7	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	NAIP	Q13075	1403 aa		7	□□□□□ -1.29

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