RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDE4D-223	ENST00000515011	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PDE4D-223	ENST00000515011	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PDE4D-223	ENST00000515011	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PDE4D-223	ENST00000515011	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PDE4D-223	ENST00000515011	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PDE4D-223	ENST00000515011	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PDE4D-223	ENST00000515011	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PDE4D-223	ENST00000515011	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PDE4D-223	ENST00000515011	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PDE4D-223	ENST00000515011	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.88
PDE4D-223	ENST00000515011	ABCC2	Q92887	1545 aa		33	■■■□□ 2.87
PDE4D-223	ENST00000515011	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PDE4D-223	ENST00000515011	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.95	■■■□□ 2.86
PDE4D-223	ENST00000515011	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PDE4D-223	ENST00000515011	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PDE4D-223	ENST00000515011	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PDE4D-223	ENST00000515011	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PDE4D-223	ENST00000515011	MIER1	Q8N108	512 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PDE4D-223	ENST00000515011	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PDE4D-223	ENST00000515011	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PDE4D-223	ENST00000515011	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PDE4D-223	ENST00000515011	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PDE4D-223	ENST00000515011	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PDE4D-223	ENST00000515011	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PDE4D-223	ENST00000515011	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PDE4D-223	ENST00000515011	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PDE4D-223	ENST00000515011	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PDE4D-223	ENST00000515011	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.77	■■■□□ 2.84
PDE4D-223	ENST00000515011	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.84
PDE4D-223	ENST00000515011	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PDE4D-223	ENST00000515011	PZP	P20742	1482 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PDE4D-223	ENST00000515011	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.7	■■■□□ 2.82
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PDE4D-223	ENST00000515011	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PDE4D-223	ENST00000515011	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PDE4D-223	ENST00000515011	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PDE4D-223	ENST00000515011	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PDE4D-223	ENST00000515011	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PDE4D-223	ENST00000515011	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PDE4D-223	ENST00000515011	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.64	■■■□□ 2.82
PDE4D-223	ENST00000515011	FOXD1	Q16676	465 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PDE4D-223	ENST00000515011	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PDE4D-223	ENST00000515011	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PDE4D-223	ENST00000515011	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PDE4D-223	ENST00000515011	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PDE4D-223	ENST00000515011	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PDE4D-223	ENST00000515011	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PDE4D-223	ENST00000515011	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PDE4D-223	ENST00000515011	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PDE4D-223	ENST00000515011	PLCH2	O75038	1416 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PDE4D-223	ENST00000515011	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PDE4D-223	ENST00000515011	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PDE4D-223	ENST00000515011	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PDE4D-223	ENST00000515011	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PDE4D-223	ENST00000515011	NUP155	O75694	1391 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PDE4D-223	ENST00000515011	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PDE4D-223	ENST00000515011	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PDE4D-223	ENST00000515011	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PDE4D-223	ENST00000515011	PKD2	Q13563	968 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PDE4D-223	ENST00000515011	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PDE4D-223	ENST00000515011	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PDE4D-223	ENST00000515011	ABCC1	P33527	1531 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PDE4D-223	ENST00000515011	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PDE4D-223	ENST00000515011	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PDE4D-223	ENST00000515011	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PDE4D-223	ENST00000515011	UNC13B	O14795	1591 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PDE4D-223	ENST00000515011	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PDE4D-223	ENST00000515011	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PDE4D-223	ENST00000515011	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PDE4D-223	ENST00000515011	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PDE4D-223	ENST00000515011	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PDE4D-223	ENST00000515011	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.27	■■■□□ 2.76
PDE4D-223	ENST00000515011	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PDE4D-223	ENST00000515011	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PDE4D-223	ENST00000515011	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PDE4D-223	ENST00000515011	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PDE4D-223	ENST00000515011	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PDE4D-223	ENST00000515011	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PDE4D-223	ENST00000515011	FANCA	O15360	1455 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PDE4D-223	ENST00000515011	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PDE4D-223	ENST00000515011	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PDE4D-223	ENST00000515011	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PDE4D-223	ENST00000515011	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PDE4D-223	ENST00000515011	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PDE4D-223	ENST00000515011	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PDE4D-223	ENST00000515011	ANP32C	O43423	234 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PDE4D-223	ENST00000515011	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PDE4D-223	ENST00000515011	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.04	■■■□□ 2.72

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