RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514596.1

CTBP1-215, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTBP1, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-215ENST00000514596 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.16■■■□□ 2.42
CTBP1-215ENST00000514596 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.15■■■□□ 2.42
CTBP1-215ENST00000514596 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.15■■■□□ 2.42
CTBP1-215ENST00000514596 CEP162Q5TB80 1403 aa30.14■■■□□ 2.42
CTBP1-215ENST00000514596 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.14■■■□□ 2.42
CTBP1-215ENST00000514596 HECW1Q76N89 1606 aa30.14■■■□□ 2.41
CTBP1-215ENST00000514596 MLECQ14165 292 aa30.1■■■□□ 2.41
CTBP1-215ENST00000514596 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.08■■■□□ 2.41
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CTBP1-215ENST00000514596 PLCH2O75038 1416 aa30■■■□□ 2.39
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CTBP1-215ENST00000514596 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.99■■■□□ 2.39
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CTBP1-215ENST00000514596 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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CTBP1-215ENST00000514596 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.87■■■□□ 2.37
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CTBP1-215ENST00000514596 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
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CTBP1-215ENST00000514596 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.77■■■□□ 2.36
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CTBP1-215ENST00000514596 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
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CTBP1-215ENST00000514596 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.73■■■□□ 2.35
CTBP1-215ENST00000514596 AFAP1Q8N556 730 aa29.73■■■□□ 2.35
CTBP1-215ENST00000514596 C3P01024 1663 aa29.71■■■□□ 2.35
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CTBP1-215ENST00000514596 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.64■■■□□ 2.34
CTBP1-215ENST00000514596 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.63■■■□□ 2.33
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CTBP1-215ENST00000514596 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.48■■■□□ 2.31
CTBP1-215ENST00000514596 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.45■■■□□ 2.3
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CTBP1-215ENST00000514596 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.36■■■□□ 2.29
CTBP1-215ENST00000514596 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.36■■■□□ 2.29
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CTBP1-215ENST00000514596 NCOA2Q15596 1464 aa29.35■■■□□ 2.29
CTBP1-215ENST00000514596 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
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CTBP1-215ENST00000514596 PKD2Q13563 968 aa29.33■■■□□ 2.29
CTBP1-215ENST00000514596 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.33■■■□□ 2.29
CTBP1-215ENST00000514596 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CTBP1-215ENST00000514596 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.31■■■□□ 2.28
CTBP1-215ENST00000514596 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
CTBP1-215ENST00000514596 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CTBP1-215ENST00000514596 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CTBP1-215ENST00000514596 ATP7AQ04656 1500 aa29.27■■■□□ 2.28
CTBP1-215ENST00000514596 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CTBP1-215ENST00000514596 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CTBP1-215ENST00000514596 PLXNC1O60486 1568 aa29.26■■■□□ 2.27
CTBP1-215ENST00000514596 A2MP01023 1474 aa29.23■■■□□ 2.27
CTBP1-215ENST00000514596 PTPRKQ15262 1439 aa29.23■■■□□ 2.27
CTBP1-215ENST00000514596 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.23■■■□□ 2.27
CTBP1-215ENST00000514596 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CTBP1-215ENST00000514596 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
CTBP1-215ENST00000514596 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CTBP1-215ENST00000514596 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.2■■■□□ 2.27
CTBP1-215ENST00000514596 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.2■■■□□ 2.26
CTBP1-215ENST00000514596 GGT6Q6P531 493 aa29.17■■■□□ 2.26
CTBP1-215ENST00000514596 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.14■■■□□ 2.26
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