RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513139.1

SPCS3-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene SPCS3, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-204ENST00000513139 CERKQ8TCT0 537 aa23.51■■□□□ 1.35
SPCS3-204ENST00000513139 EEA1Q15075 1411 aa23.5■■□□□ 1.35
SPCS3-204ENST00000513139 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.48■■□□□ 1.35
SPCS3-204ENST00000513139 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SPCS3-204ENST00000513139 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.45■■□□□ 1.34
SPCS3-204ENST00000513139 PLCH2O75038 1416 aa23.45■■□□□ 1.34
SPCS3-204ENST00000513139 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.44■■□□□ 1.34
SPCS3-204ENST00000513139 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPCS3-204ENST00000513139 ATP10AO60312 1499 aa23.43■■□□□ 1.34
SPCS3-204ENST00000513139 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.42■■□□□ 1.34
SPCS3-204ENST00000513139 MLECQ14165 292 aa23.42■■□□□ 1.34
SPCS3-204ENST00000513139 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SPCS3-204ENST00000513139 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.4■■□□□ 1.34
SPCS3-204ENST00000513139 STRCQ7RTU9 1775 aa23.37■■□□□ 1.33
SPCS3-204ENST00000513139 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.35■■□□□ 1.33
SPCS3-204ENST00000513139 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.35■■□□□ 1.33
SPCS3-204ENST00000513139 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.32■■□□□ 1.32
SPCS3-204ENST00000513139 KDM5CP41229 1560 aa23.31■■□□□ 1.32
SPCS3-204ENST00000513139 FMN1Q68DA7 1419 aa23.29■■□□□ 1.32
SPCS3-204ENST00000513139 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SPCS3-204ENST00000513139 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.28■■□□□ 1.32
SPCS3-204ENST00000513139 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SPCS3-204ENST00000513139 KIF14Q15058 1648 aa23.28■■□□□ 1.32
SPCS3-204ENST00000513139 REREQ9P2R6 1566 aa23.27■■□□□ 1.32
SPCS3-204ENST00000513139 C3P01024 1663 aa23.24■■□□□ 1.31
SPCS3-204ENST00000513139 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.24■■□□□ 1.31
SPCS3-204ENST00000513139 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.23■■□□□ 1.31
SPCS3-204ENST00000513139 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.23■■□□□ 1.31
SPCS3-204ENST00000513139 PTPRTO14522 1441 aa23.22■■□□□ 1.31
SPCS3-204ENST00000513139 AFAP1Q8N556 730 aa23.21■■□□□ 1.31
SPCS3-204ENST00000513139 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SPCS3-204ENST00000513139 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.21■■□□□ 1.31
SPCS3-204ENST00000513139 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SPCS3-204ENST00000513139 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.19■■□□□ 1.3
SPCS3-204ENST00000513139 SOCS7O14512 581 aa23.19■■□□□ 1.3
SPCS3-204ENST00000513139 ILDR2Q71H61 639 aa23.19■■□□□ 1.3
SPCS3-204ENST00000513139 ABCA6Q8N139 1617 aa23.19■■□□□ 1.3
SPCS3-204ENST00000513139 AGLP35573 1532 aa23.18■■□□□ 1.3
SPCS3-204ENST00000513139 CLIP1P30622 1438 aa23.18■■□□□ 1.3
SPCS3-204ENST00000513139 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.17■■□□□ 1.3
SPCS3-204ENST00000513139 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.17■■□□□ 1.3
SPCS3-204ENST00000513139 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.14■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.13■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 PREX2Q70Z35 1606 aa23.13■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.13■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.12■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.12■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.11■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 ABCC1P33527 1531 aa23.11■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.1■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.09■■□□□ 1.29
SPCS3-204ENST00000513139 MROH2AA6NES4 1674 aa23.07■■□□□ 1.28
SPCS3-204ENST00000513139 NCOA1Q15788 1441 aa23.07■■□□□ 1.28
SPCS3-204ENST00000513139 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.05■■□□□ 1.28
SPCS3-204ENST00000513139 ADRA2BP18089 450 aa23.04■■□□□ 1.28
SPCS3-204ENST00000513139 NPATQ14207 1427 aa23.03■■□□□ 1.28
SPCS3-204ENST00000513139 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.02■■□□□ 1.28
SPCS3-204ENST00000513139 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23■■□□□ 1.27
SPCS3-204ENST00000513139 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.98■■□□□ 1.27
SPCS3-204ENST00000513139 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.97■■□□□ 1.27
SPCS3-204ENST00000513139 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.97■■□□□ 1.27
SPCS3-204ENST00000513139 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.97■■□□□ 1.27
SPCS3-204ENST00000513139 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SPCS3-204ENST00000513139 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPCS3-204ENST00000513139 ZMYM3Q14202 1370 aa22.94■■□□□ 1.26
SPCS3-204ENST00000513139 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPCS3-204ENST00000513139 PLA2R1Q13018 1463 aa22.91■■□□□ 1.26
SPCS3-204ENST00000513139 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.9■■□□□ 1.26
SPCS3-204ENST00000513139 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.89■■□□□ 1.26
SPCS3-204ENST00000513139 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 PKD2Q13563 968 aa22.88■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 PLXNC1O60486 1568 aa22.88■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 ATP7AQ04656 1500 aa22.87■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.86■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.86■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.84■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.84■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.83■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 A2MP01023 1474 aa22.83■■□□□ 1.25
SPCS3-204ENST00000513139 PTPRKQ15262 1439 aa22.82■■□□□ 1.24
SPCS3-204ENST00000513139 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.81■■□□□ 1.24
SPCS3-204ENST00000513139 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
SPCS3-204ENST00000513139 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SPCS3-204ENST00000513139 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SPCS3-204ENST00000513139 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SPCS3-204ENST00000513139 GGT6Q6P531 493 aa22.74■■□□□ 1.23
SPCS3-204ENST00000513139 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.73■■□□□ 1.23
SPCS3-204ENST00000513139 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS3-204ENST00000513139 CPS1P31327 1500 aa22.69■■□□□ 1.22
SPCS3-204ENST00000513139 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.66■■□□□ 1.22
SPCS3-204ENST00000513139 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SPCS3-204ENST00000513139 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.65■■□□□ 1.22
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