RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495530.5

PTPRE-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRE, Length 987 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-211ENST00000495530 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRE-211ENST00000495530 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRE-211ENST00000495530 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRE-211ENST00000495530 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRE-211ENST00000495530 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRE-211ENST00000495530 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRE-211ENST00000495530 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRE-211ENST00000495530 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRE-211ENST00000495530 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRE-211ENST00000495530 RAPGEF3O95398 923 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRE-211ENST00000495530 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRE-211ENST00000495530 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRE-211ENST00000495530 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRE-211ENST00000495530 NEO1Q92859 1461 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRE-211ENST00000495530 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRE-211ENST00000495530 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRE-211ENST00000495530 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 FANCAO15360 1455 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 NCOA2Q15596 1464 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 STRCQ7RTU9 1775 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 KIF14Q15058 1648 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 RICTORQ6R327 1708 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRE-211ENST00000495530 FOXD1Q16676 465 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRE-211ENST00000495530 AKNAQ7Z591 1439 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-211ENST00000495530 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRE-211ENST00000495530 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRE-211ENST00000495530 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 MIA2Q96PC5 1412 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 PLCH2O75038 1416 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRE-211ENST00000495530 PTPRTO14522 1441 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 MLECQ14165 292 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRE-211ENST00000495530 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRE-211ENST00000495530 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRE-211ENST00000495530 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRE-211ENST00000495530 PREX2Q70Z35 1606 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRE-211ENST00000495530 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRE-211ENST00000495530 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRE-211ENST00000495530 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRE-211ENST00000495530 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRE-211ENST00000495530 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRE-211ENST00000495530 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRE-211ENST00000495530 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRE-211ENST00000495530 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRE-211ENST00000495530 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRE-211ENST00000495530 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
PTPRE-211ENST00000495530 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 ATP10AO60312 1499 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 TSPY4P0CV99 314 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 TSPY10P0CW01 314 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 ITGAEP38570 1179 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 C3P01024 1663 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 MBD5Q9P267 1494 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRE-211ENST00000495530 NCOA1Q15788 1441 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRE-211ENST00000495530 ABCC1P33527 1531 aa22■■□□□ 1.11
PTPRE-211ENST00000495530 ABCC5O15440 1437 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRE-211ENST00000495530 DAPK1P53355 1430 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRE-211ENST00000495530 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRE-211ENST00000495530 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-211ENST00000495530 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRE-211ENST00000495530 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-211ENST00000495530 AFAP1Q8N556 730 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRE-211ENST00000495530 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRE-211ENST00000495530 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRE-211ENST00000495530 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-211ENST00000495530 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRE-211ENST00000495530 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRE-211ENST00000495530 PTPRKQ15262 1439 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRE-211ENST00000495530 ROCK1Q13464 1354 aa21.91■■□□□ 1.1
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