RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 NBR1Q14596 966 aa22.03■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.03■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 KIF3BO15066 747 aa22.03■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-213ENST00000489895 FOXD1Q16676 465 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.113e-7■■■□□ 19.2
NISCH-213ENST00000489895 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
NISCH-213ENST00000489895 STK26Q9P289 416 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-213ENST00000489895 RALBP1Q15311 655 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-213ENST00000489895 PTPRGP23470 1445 aa21.93■■□□□ 1.1
NISCH-213ENST00000489895 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.92■■□□□ 1.1
NISCH-213ENST00000489895 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NISCH-213ENST00000489895 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NISCH-213ENST00000489895 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NISCH-213ENST00000489895 EID1Q9Y6B2 187 aa21.89■■□□□ 1.1
NISCH-213ENST00000489895 NPHP1O15259 732 aa21.88■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 SOX12O15370 315 aa21.88■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.86■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.86■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.86■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 NCAPD3P42695 1498 aa21.86■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 RGS3P49796 1198 aa21.85■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.85■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 CFAP44Q96MT7 982 aa21.83■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.83■■□□□ 1.09
NISCH-213ENST00000489895 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.82■■□□□ 1.08
NISCH-213ENST00000489895 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NISCH-213ENST00000489895 OSCARQ8IYS5 282 aa21.81■■□□□ 1.08
NISCH-213ENST00000489895 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NISCH-213ENST00000489895 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
NISCH-213ENST00000489895 UACAQ9BZF9 1416 aa21.81■■□□□ 1.08
NISCH-213ENST00000489895 IGF1RP08069 1367 aa21.8■■□□□ 1.08
NISCH-213ENST00000489895 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
NISCH-213ENST00000489895 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.79■■□□□ 1.08
NISCH-213ENST00000489895 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.78■■□□□ 1.08
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA2Q08379 1002 aa21.75■■□□□ 1.07
NISCH-213ENST00000489895 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NISCH-213ENST00000489895 KCNJ4P48050 445 aa21.74■■□□□ 1.07
NISCH-213ENST00000489895 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-213ENST00000489895 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-213ENST00000489895 FGD1P98174 961 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-213ENST00000489895 NLRP13Q86W25 1043 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-213ENST00000489895 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
NISCH-213ENST00000489895 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.7■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 MCCP23508 829 aa21.69■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.68■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.68■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.68■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.66■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 PDE3BQ13370 1112 aa21.65■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.65■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.65■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.65■■□□□ 1.06
NISCH-213ENST00000489895 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 KIF15Q9NS87 1388 aa21.63■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 STK31Q9BXU1 1019 aa21.63■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.63■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 HSCBQ8IWL3 235 aa21.62■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 CUX1P39880 1505 aa21.62■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 STAC3Q96MF2 364 aa21.6■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.59■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 AMPHP49418 695 aa21.58■■□□□ 1.05
NISCH-213ENST00000489895 EVC2Q86UK5 1308 aa21.58■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 GRIN2BQ13224 1484 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.56■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 27.8
NISCH-213ENST00000489895 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 CFTRP13569 1480 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 HMMRO75330 724 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 PANK3Q9H999 370 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-213ENST00000489895 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.51■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.5■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 USP47Q96K76 1375 aa21.49■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 COG3Q96JB2 828 aa21.48■■□□□ 1.03
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.48■■□□□ 1.03
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