RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 DAPK1P53355 1430 aa25.44■■□□□ 1.66
PRRT4-205ENST00000489835 HFM1A2PYH4 1435 aa25.44■■□□□ 1.66
PRRT4-205ENST00000489835 ABCC5O15440 1437 aa25.44■■□□□ 1.66
PRRT4-205ENST00000489835 NAIPQ13075 1403 aa25.43■■□□□ 1.66
PRRT4-205ENST00000489835 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
PRRT4-205ENST00000489835 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PRRT4-205ENST00000489835 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.4■■□□□ 1.66
PRRT4-205ENST00000489835 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PRRT4-205ENST00000489835 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
PRRT4-205ENST00000489835 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.36■■□□□ 1.65
PRRT4-205ENST00000489835 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PRRT4-205ENST00000489835 NEUROD1Q13562 356 aa25.33■■□□□ 1.65
PRRT4-205ENST00000489835 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.32■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 PREX2Q70Z35 1606 aa25.32■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 KDM6BO15054 1643 aa25.3■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.3■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 AKNAQ7Z591 1439 aa25.29■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.29■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 MAPKBP1O60336 1514 aa25.29■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.28■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.28■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 ASXL2Q76L83 1435 aa25.27■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 ROCK1Q13464 1354 aa25.27■■□□□ 1.64
PRRT4-205ENST00000489835 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.26■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.26■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 TRIM52Q96A61 297 aa25.26■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 TSPY4P0CV99 314 aa25.23■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 TSPY10P0CW01 314 aa25.23■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 PLCH2O75038 1416 aa25.23■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 NCOA1Q15788 1441 aa25.22■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 MBD5Q9P267 1494 aa25.22■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.22■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.22■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
PRRT4-205ENST00000489835 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.19■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.19■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.19■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.19■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.19■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.19■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.18■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.16■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.15■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 ADGRL2O95490 1459 aa25.15■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.14■■□□□ 1.62
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.13■■□□□ 1.61
PRRT4-205ENST00000489835 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.12■■□□□ 1.61
PRRT4-205ENST00000489835 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.12■■□□□ 1.61
PRRT4-205ENST00000489835 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.11■■□□□ 1.61
PRRT4-205ENST00000489835 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.1■■□□□ 1.61
PRRT4-205ENST00000489835 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.1■■□□□ 1.61
PRRT4-205ENST00000489835 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.09■■□□□ 1.61
PRRT4-205ENST00000489835 FOXD1Q16676 465 aa25.07■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.07■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.07■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 KIF15Q9NS87 1388 aa25.06■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.05■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 FANCAO15360 1455 aa25.05■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 AFAP1Q8N556 730 aa25.04■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 ABCC1P33527 1531 aa25.03■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PRRT4-205ENST00000489835 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.01■■□□□ 1.59
PRRT4-205ENST00000489835 CD109Q6YHK3 1445 aa24.99■■□□□ 1.59
PRRT4-205ENST00000489835 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.95■■□□□ 1.59
PRRT4-205ENST00000489835 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.95■■□□□ 1.58
PRRT4-205ENST00000489835 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PRRT4-205ENST00000489835 ADGRL1O94910 1474 aa24.94■■□□□ 1.58
PRRT4-205ENST00000489835 PZPP20742 1482 aa24.94■■□□□ 1.58
PRRT4-205ENST00000489835 NUP155O75694 1391 aa24.93■■□□□ 1.58
PRRT4-205ENST00000489835 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.91■■□□□ 1.58
PRRT4-205ENST00000489835 TONSLQ96HA7 1378 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRT4-205ENST00000489835 PKD2Q13563 968 aa24.88■■□□□ 1.57
PRRT4-205ENST00000489835 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
PRRT4-205ENST00000489835 PLXNC1O60486 1568 aa24.86■■□□□ 1.57
PRRT4-205ENST00000489835 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.85■■□□□ 1.57
PRRT4-205ENST00000489835 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.85■■□□□ 1.57
PRRT4-205ENST00000489835 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.85■■□□□ 1.57
PRRT4-205ENST00000489835 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PRRT4-205ENST00000489835 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.82■■□□□ 1.56
PRRT4-205ENST00000489835 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.81■■□□□ 1.56
PRRT4-205ENST00000489835 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.81■■□□□ 1.56
PRRT4-205ENST00000489835 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PRRT4-205ENST00000489835 ATP7AQ04656 1500 aa24.78■■□□□ 1.56
PRRT4-205ENST00000489835 RAPGEF3O95398 923 aa24.77■■□□□ 1.56
PRRT4-205ENST00000489835 ERBINQ96RT1 1412 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.75■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.74■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.74■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 MIER1Q8N108 512 aa24.74■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 DIP2BQ9P265 1576 aa24.73■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 GLI2P10070 1586 aa24.72■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.72■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.71■■□□□ 1.55
PRRT4-205ENST00000489835 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
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