RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	TOPBP1	Q92547	1522 aa		14.18	□□□□□ -0.14
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
TBC1D23-208	ENST00000486274	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		14.17	□□□□□ -0.14
TBC1D23-208	ENST00000486274	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
TBC1D23-208	ENST00000486274	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBC1D23-208	ENST00000486274	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBC1D23-208	ENST00000486274	MYT1	Q01538	1121 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRX	Q9BXM0	1461 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMF1	P82094	1093 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TBC1D23-208	ENST00000486274	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
TBC1D23-208	ENST00000486274	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		14.1	□□□□□ -0.15
TBC1D23-208	ENST00000486274	KANK1	Q14678	1352 aa		14.1	□□□□□ -0.15
TBC1D23-208	ENST00000486274	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		14.1	□□□□□ -0.15
TBC1D23-208	ENST00000486274	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		14.07	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	14.07	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	14.07	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	GRIN2B	Q13224	1484 aa		14.07	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		14.07	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		14.07	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDCA8	Q53HL2	280 aa		14.06	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	HMGXB3	Q12766	1538 aa		14.05	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	TOP2B	Q02880	1626 aa		14.05	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	RAPGEF3	O95398	923 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	MORC1	Q86VD1	984 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	NCOA2	Q15596	1464 aa		14.02	□□□□□ -0.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARX	Q96QS3	562 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRDM2	Q13029	1718 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	CFAP53	Q96M91	514 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		14	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	14	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	PANK3	Q9H999	370 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	RGS3	P49796	1198 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	NBR1	Q14596	966 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TBC1D23-208	ENST00000486274	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.96	□□□□□ -0.18	3e-9	■■■■□ 21.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	IFT140	Q96RY7	1462 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	USP47	Q96K76	1375 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		13.9	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	PLIN1	O60240	522 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	APBB1	O00213	710 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	SYNJ2	O15056	1496 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.8	□□□□□ -0.2

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