RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475658.1

ARRDC1-208, Transcript of arrestin domain containing 1, human

TSL 3

Gene ARRDC1, Length 854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRDC1-208	ENST00000475658	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		34.3	■■■■□ 3.08
ARRDC1-208	ENST00000475658	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		34.3	■■■■□ 3.08
ARRDC1-208	ENST00000475658	FMN1	Q68DA7	1419 aa		34.29	■■■■□ 3.08
ARRDC1-208	ENST00000475658	MLEC	Q14165	292 aa		34.25	■■■■□ 3.07
ARRDC1-208	ENST00000475658	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		34.25	■■■■□ 3.07
ARRDC1-208	ENST00000475658	HSPA2	P54652	639 aa		34.22	■■■■□ 3.07
ARRDC1-208	ENST00000475658	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		34.2	■■■■□ 3.07
ARRDC1-208	ENST00000475658	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	34.2	■■■■□ 3.07
ARRDC1-208	ENST00000475658	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		34.2	■■■■□ 3.07
ARRDC1-208	ENST00000475658	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		34.17	■■■■□ 3.06
ARRDC1-208	ENST00000475658	KIF14	Q15058	1648 aa		34.17	■■■■□ 3.06
ARRDC1-208	ENST00000475658	ATP10A	O60312	1499 aa		34.15	■■■■□ 3.06
ARRDC1-208	ENST00000475658	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		34.13	■■■■□ 3.05
ARRDC1-208	ENST00000475658	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	34.12	■■■■□ 3.05
ARRDC1-208	ENST00000475658	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		34.09	■■■■□ 3.05
ARRDC1-208	ENST00000475658	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		34.08	■■■■□ 3.05
ARRDC1-208	ENST00000475658	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		34.08	■■■■□ 3.05
ARRDC1-208	ENST00000475658	CLIP1	P30622	1438 aa		34.06	■■■■□ 3.04
ARRDC1-208	ENST00000475658	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		34.06	■■■■□ 3.04
ARRDC1-208	ENST00000475658	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		34.04	■■■■□ 3.04
ARRDC1-208	ENST00000475658	AFAP1	Q8N556	730 aa		34.03	■■■■□ 3.04
ARRDC1-208	ENST00000475658	KDM5C	P41229	1560 aa		34.01	■■■■□ 3.03
ARRDC1-208	ENST00000475658	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.97	■■■■□ 3.03
ARRDC1-208	ENST00000475658	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.97	■■■■□ 3.03
ARRDC1-208	ENST00000475658	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.94	■■■■□ 3.02
ARRDC1-208	ENST00000475658	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ARRDC1-208	ENST00000475658	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ARRDC1-208	ENST00000475658	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ARRDC1-208	ENST00000475658	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ARRDC1-208	ENST00000475658	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.88	■■■■□ 3.01
ARRDC1-208	ENST00000475658	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.87	■■■■□ 3.01
ARRDC1-208	ENST00000475658	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.87	■■■■□ 3.01
ARRDC1-208	ENST00000475658	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.87	■■■■□ 3.01
ARRDC1-208	ENST00000475658	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.86	■■■■□ 3.01
ARRDC1-208	ENST00000475658	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.86	■■■■□ 3.01
ARRDC1-208	ENST00000475658	ABCC1	P33527	1531 aa		33.85	■■■■□ 3.01
ARRDC1-208	ENST00000475658	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.8	■■■■□ 3
ARRDC1-208	ENST00000475658	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.8	■■■■□ 3
ARRDC1-208	ENST00000475658	AGL	P35573	1532 aa		33.77	■■■■□ 3
ARRDC1-208	ENST00000475658	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.76	■■■□□ 2.99
ARRDC1-208	ENST00000475658	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.75	■■■□□ 2.99
ARRDC1-208	ENST00000475658	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
ARRDC1-208	ENST00000475658	C3	P01024	1663 aa		33.74	■■■□□ 2.99
ARRDC1-208	ENST00000475658	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
ARRDC1-208	ENST00000475658	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.73	■■■□□ 2.99
ARRDC1-208	ENST00000475658	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.73	■■■□□ 2.99
ARRDC1-208	ENST00000475658	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.72	■■■□□ 2.99
ARRDC1-208	ENST00000475658	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
ARRDC1-208	ENST00000475658	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ARRDC1-208	ENST00000475658	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
ARRDC1-208	ENST00000475658	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ARRDC1-208	ENST00000475658	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.61	■■■□□ 2.97
ARRDC1-208	ENST00000475658	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.58	■■■□□ 2.97
ARRDC1-208	ENST00000475658	PTPRT	O14522	1441 aa		33.58	■■■□□ 2.97
ARRDC1-208	ENST00000475658	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.97
ARRDC1-208	ENST00000475658	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.48	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.48	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.48	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	NPAT	Q14207	1427 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
ARRDC1-208	ENST00000475658	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ARRDC1-208	ENST00000475658	A2M	P01023	1474 aa		33.43	■■■□□ 2.94
ARRDC1-208	ENST00000475658	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.43	■■■□□ 2.94
ARRDC1-208	ENST00000475658	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ARRDC1-208	ENST00000475658	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ARRDC1-208	ENST00000475658	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
ARRDC1-208	ENST00000475658	GGT6	Q6P531	493 aa		33.36	■■■□□ 2.93
ARRDC1-208	ENST00000475658	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
ARRDC1-208	ENST00000475658	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ARRDC1-208	ENST00000475658	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ARRDC1-208	ENST00000475658	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.32	■■■□□ 2.93
ARRDC1-208	ENST00000475658	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ARRDC1-208	ENST00000475658	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ARRDC1-208	ENST00000475658	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.3	■■■□□ 2.92
ARRDC1-208	ENST00000475658	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.29	■■■□□ 2.92
ARRDC1-208	ENST00000475658	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.29	■■■□□ 2.92
ARRDC1-208	ENST00000475658	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
ARRDC1-208	ENST00000475658	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ARRDC1-208	ENST00000475658	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
ARRDC1-208	ENST00000475658	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ARRDC1-208	ENST00000475658	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ARRDC1-208	ENST00000475658	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.23	■■■□□ 2.91
ARRDC1-208	ENST00000475658	PKD2	Q13563	968 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ARRDC1-208	ENST00000475658	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ARRDC1-208	ENST00000475658	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
ARRDC1-208	ENST00000475658	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ARRDC1-208	ENST00000475658	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
ARRDC1-208	ENST00000475658	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
ARRDC1-208	ENST00000475658	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ARRDC1-208	ENST00000475658	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ARRDC1-208	ENST00000475658	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ARRDC1-208	ENST00000475658	KIF3B	O15066	747 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ARRDC1-208	ENST00000475658	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ARRDC1-208	ENST00000475658	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.09	■■■□□ 2.89

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