RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468255.5

CSNK2B-206, Transcript of casein kinase 2 beta, humanhuman

TSL 5

Gene CSNK2B, Length 1,792 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2B-206ENST00000468255 ABCC5O15440 1437 aa20.89■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.88■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.86■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.86■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.84■□□□□ 0.93
CSNK2B-206ENST00000468255 ADGRL2O95490 1459 aa20.82■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 FKBP8Q14318 412 aa20.82■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.82■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 NCOA1Q15788 1441 aa20.81■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 SYNJ2O15056 1496 aa20.81■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.81■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.8■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.79■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.79■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.78■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.78■□□□□ 0.92
CSNK2B-206ENST00000468255 CCDC7Q96M83 1385 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK2B-206ENST00000468255 NUP160Q12769 1436 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK2B-206ENST00000468255 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CSNK2B-206ENST00000468255 CEP170Q5SW79 1584 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK2B-206ENST00000468255 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.73■□□□□ 0.91
CSNK2B-206ENST00000468255 PZPP20742 1482 aa20.72■□□□□ 0.91
CSNK2B-206ENST00000468255 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CSNK2B-206ENST00000468255 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.71■□□□□ 0.91
CSNK2B-206ENST00000468255 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.71■□□□□ 0.91
CSNK2B-206ENST00000468255 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.7■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.69■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 MBD5Q9P267 1494 aa20.68■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.67■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.67■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.67■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 ABCA8O94911 1581 aa20.66■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 KIF14Q15058 1648 aa20.66■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 ARID3CA6NKF2 412 aa20.65■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.65■□□□□ 0.9
CSNK2B-206ENST00000468255 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.64■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.63■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 BCANQ96GW7 911 aa20.62■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 FOXD1Q16676 465 aa20.61■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.61■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 JPH4Q96JJ6 628 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.6■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.59■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.58■□□□□ 0.89
CSNK2B-206ENST00000468255 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.58■□□□□ 0.88
CSNK2B-206ENST00000468255 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.56■□□□□ 0.88
CSNK2B-206ENST00000468255 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CSNK2B-206ENST00000468255 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CSNK2B-206ENST00000468255 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.54■□□□□ 0.88
CSNK2B-206ENST00000468255 ATP10BO94823 1461 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK2B-206ENST00000468255 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.53■□□□□ 0.88
CSNK2B-206ENST00000468255 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CSNK2B-206ENST00000468255 KDM5CP41229 1560 aa20.52■□□□□ 0.88
CSNK2B-206ENST00000468255 MRS2Q9HD23 443 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 PKD2Q13563 968 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.51■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 PTPRGP23470 1445 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 USP47Q96K76 1375 aa20.5■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 TSPY4P0CV99 314 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 TSPY10P0CW01 314 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.48■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 NUP155O75694 1391 aa20.46■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CSNK2B-206ENST00000468255 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CSNK2B-206ENST00000468255 FBLN2P98095 1184 aa20.44■□□□□ 0.86
CSNK2B-206ENST00000468255 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.44■□□□□ 0.86
CSNK2B-206ENST00000468255 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.43■□□□□ 0.86
CSNK2B-206ENST00000468255 PREX2Q70Z35 1606 aa20.43■□□□□ 0.86
CSNK2B-206ENST00000468255 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.43■□□□□ 0.86
CSNK2B-206ENST00000468255 KIF15Q9NS87 1388 aa20.42■□□□□ 0.86
CSNK2B-206ENST00000468255 CCDC184Q52MB2 194 aa20.41■□□□□ 0.86
CSNK2B-206ENST00000468255 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.4■□□□□ 0.86
CSNK2B-206ENST00000468255 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CSNK2B-206ENST00000468255 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK2B-206ENST00000468255 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK2B-206ENST00000468255 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK2B-206ENST00000468255 UNC13BO14795 1591 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK2B-206ENST00000468255 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms