RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SYNE4-204ENST00000465425 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SYNE4-204ENST00000465425 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
SYNE4-204ENST00000465425 FOXD1Q16676 465 aa25.64■■□□□ 1.7
SYNE4-204ENST00000465425 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.62■■□□□ 1.69
SYNE4-204ENST00000465425 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SYNE4-204ENST00000465425 SYNJ2O15056 1496 aa25.61■■□□□ 1.69
SYNE4-204ENST00000465425 FBLN2P98095 1184 aa25.6■■□□□ 1.69
SYNE4-204ENST00000465425 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SYNE4-204ENST00000465425 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.58■■□□□ 1.69
SYNE4-204ENST00000465425 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SYNE4-204ENST00000465425 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SYNE4-204ENST00000465425 CEP170Q5SW79 1584 aa25.58■■□□□ 1.69
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.58■■□□□ 1.69
SYNE4-204ENST00000465425 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.56■■□□□ 1.68
SYNE4-204ENST00000465425 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.56■■□□□ 1.68
SYNE4-204ENST00000465425 FKBP8Q14318 412 aa25.56■■□□□ 1.68
SYNE4-204ENST00000465425 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SYNE4-204ENST00000465425 NEFLP07196 543 aa25.55■■□□□ 1.68
SYNE4-204ENST00000465425 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.55■■□□□ 1.68
SYNE4-204ENST00000465425 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.53■■□□□ 1.68
SYNE4-204ENST00000465425 BCANQ96GW7 911 aa25.51■■□□□ 1.67
SYNE4-204ENST00000465425 JPH4Q96JJ6 628 aa25.51■■□□□ 1.67
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SYNE4-204ENST00000465425 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SYNE4-204ENST00000465425 NUP160Q12769 1436 aa25.47■■□□□ 1.67
SYNE4-204ENST00000465425 NCOA1Q15788 1441 aa25.47■■□□□ 1.67
SYNE4-204ENST00000465425 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.47■■□□□ 1.67
SYNE4-204ENST00000465425 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.46■■□□□ 1.67
SYNE4-204ENST00000465425 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.46■■□□□ 1.67
SYNE4-204ENST00000465425 KIF14Q15058 1648 aa25.45■■□□□ 1.67
SYNE4-204ENST00000465425 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.44■■□□□ 1.66
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.43■■□□□ 1.66
SYNE4-204ENST00000465425 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
SYNE4-204ENST00000465425 ADGRL2O95490 1459 aa25.41■■□□□ 1.66
SYNE4-204ENST00000465425 PZPP20742 1482 aa25.41■■□□□ 1.66
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.41■■□□□ 1.66
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC7Q96M83 1385 aa25.41■■□□□ 1.66
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.41■■□□□ 1.66
SYNE4-204ENST00000465425 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.41■■□□□ 1.66
SYNE4-204ENST00000465425 MYT1Q01538 1121 aa25.4■■□□□ 1.66
SYNE4-204ENST00000465425 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SYNE4-204ENST00000465425 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.37■■□□□ 1.65
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.35■■□□□ 1.65
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.33■■□□□ 1.65
SYNE4-204ENST00000465425 ABCA8O94911 1581 aa25.33■■□□□ 1.65
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.32■■□□□ 1.64
SYNE4-204ENST00000465425 PKD2Q13563 968 aa25.32■■□□□ 1.64
SYNE4-204ENST00000465425 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SYNE4-204ENST00000465425 ATP10BO94823 1461 aa25.3■■□□□ 1.64
SYNE4-204ENST00000465425 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.29■■□□□ 1.64
SYNE4-204ENST00000465425 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.28■■□□□ 1.64
SYNE4-204ENST00000465425 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.28■■□□□ 1.64
SYNE4-204ENST00000465425 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.27■■□□□ 1.64
SYNE4-204ENST00000465425 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.27■■□□□ 1.64
SYNE4-204ENST00000465425 TSPY4P0CV99 314 aa25.26■■□□□ 1.63
SYNE4-204ENST00000465425 TSPY10P0CW01 314 aa25.26■■□□□ 1.63
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SYNE4-204ENST00000465425 MBD5Q9P267 1494 aa25.24■■□□□ 1.63
SYNE4-204ENST00000465425 NUP155O75694 1391 aa25.24■■□□□ 1.63
SYNE4-204ENST00000465425 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SYNE4-204ENST00000465425 MRS2Q9HD23 443 aa25.23■■□□□ 1.63
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC184Q52MB2 194 aa25.23■■□□□ 1.63
SYNE4-204ENST00000465425 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.2■■□□□ 1.62
SYNE4-204ENST00000465425 USP47Q96K76 1375 aa25.2■■□□□ 1.62
SYNE4-204ENST00000465425 PTPRGP23470 1445 aa25.19■■□□□ 1.62
SYNE4-204ENST00000465425 KIF15Q9NS87 1388 aa25.16■■□□□ 1.62
SYNE4-204ENST00000465425 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
SYNE4-204ENST00000465425 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.13■■□□□ 1.61
SYNE4-204ENST00000465425 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.13■■□□□ 1.61
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.12■■□□□ 1.61
SYNE4-204ENST00000465425 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SYNE4-204ENST00000465425 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.1■■□□□ 1.61
SYNE4-204ENST00000465425 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.09■■□□□ 1.61
SYNE4-204ENST00000465425 KDM5CP41229 1560 aa25.09■■□□□ 1.61
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.08■■□□□ 1.61
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.08■■□□□ 1.61
SYNE4-204ENST00000465425 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.08■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.07■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.07■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.05■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.04■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 PREX2Q70Z35 1606 aa25.04■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.03■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.02■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SYNE4-204ENST00000465425 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.01■■□□□ 1.59
SYNE4-204ENST00000465425 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.01■■□□□ 1.59
SYNE4-204ENST00000465425 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SYNE4-204ENST00000465425 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.98■■□□□ 1.59
SYNE4-204ENST00000465425 CHD1O14646 1710 aa24.96■■□□□ 1.59
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.96■■□□□ 1.59
SYNE4-204ENST00000465425 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.95■■□□□ 1.58
SYNE4-204ENST00000465425 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.94■■□□□ 1.58
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.93■■□□□ 1.58
SYNE4-204ENST00000465425 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.92■■□□□ 1.58
SYNE4-204ENST00000465425 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.91■■□□□ 1.58
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