RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464495.4

SOGA3-204, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SOGA3, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-204ENST00000464495 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.98■□□□□ 0.31
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SOGA3-204ENST00000464495 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.92■□□□□ 0.3
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SOGA3-204ENST00000464495 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.87■□□□□ 0.29
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SOGA3-204ENST00000464495 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.83■□□□□ 0.28
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SOGA3-204ENST00000464495 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.66■□□□□ 0.26
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SOGA3-204ENST00000464495 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.65■□□□□ 0.26
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SOGA3-204ENST00000464495 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.64■□□□□ 0.25
SOGA3-204ENST00000464495 SAMD9Q5K651 1589 aa16.62■□□□□ 0.25
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SOGA3-204ENST00000464495 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.61■□□□□ 0.25
SOGA3-204ENST00000464495 HAX1O00165 279 aa16.59■□□□□ 0.25
SOGA3-204ENST00000464495 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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SOGA3-204ENST00000464495 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.55■□□□□ 0.24
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SOGA3-204ENST00000464495 STRCQ7RTU9 1775 aa16.54■□□□□ 0.24
SOGA3-204ENST00000464495 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SOGA3-204ENST00000464495 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.53■□□□□ 0.24
SOGA3-204ENST00000464495 PTPRTO14522 1441 aa16.52■□□□□ 0.23
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SOGA3-204ENST00000464495 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SOGA3-204ENST00000464495 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SOGA3-204ENST00000464495 PLCH2O75038 1416 aa16.47■□□□□ 0.23
SOGA3-204ENST00000464495 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
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SOGA3-204ENST00000464495 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.44■□□□□ 0.22
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SOGA3-204ENST00000464495 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.44■□□□□ 0.22
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SOGA3-204ENST00000464495 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.41■□□□□ 0.22
SOGA3-204ENST00000464495 C3P01024 1663 aa16.4■□□□□ 0.22
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SOGA3-204ENST00000464495 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-204ENST00000464495 REREQ9P2R6 1566 aa16.37■□□□□ 0.21
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SOGA3-204ENST00000464495 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-204ENST00000464495 NCOA1Q15788 1441 aa16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-204ENST00000464495 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-204ENST00000464495 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-204ENST00000464495 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
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SOGA3-204ENST00000464495 AFAP1Q8N556 730 aa16.34■□□□□ 0.21
SOGA3-204ENST00000464495 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.34■□□□□ 0.21
SOGA3-204ENST00000464495 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.34■□□□□ 0.21
SOGA3-204ENST00000464495 KIF14Q15058 1648 aa16.34■□□□□ 0.21
SOGA3-204ENST00000464495 AGLP35573 1532 aa16.33■□□□□ 0.2
SOGA3-204ENST00000464495 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SOGA3-204ENST00000464495 EEA1Q15075 1411 aa16.32■□□□□ 0.2
SOGA3-204ENST00000464495 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.31■□□□□ 0.2
SOGA3-204ENST00000464495 CLIP1P30622 1438 aa16.31■□□□□ 0.2
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