RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 FBLN2P98095 1184 aa28.73■■■□□ 2.19
IMP4-208ENST00000460766 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
IMP4-208ENST00000460766 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
IMP4-208ENST00000460766 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
IMP4-208ENST00000460766 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.7■■■□□ 2.18
IMP4-208ENST00000460766 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
IMP4-208ENST00000460766 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.67■■■□□ 2.18
IMP4-208ENST00000460766 SYNJ2O15056 1496 aa28.66■■■□□ 2.18
IMP4-208ENST00000460766 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.66■■■□□ 2.18
IMP4-208ENST00000460766 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
IMP4-208ENST00000460766 CEP170Q5SW79 1584 aa28.66■■■□□ 2.18
IMP4-208ENST00000460766 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.65■■■□□ 2.18
IMP4-208ENST00000460766 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
IMP4-208ENST00000460766 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.63■■■□□ 2.17
IMP4-208ENST00000460766 FKBP8Q14318 412 aa28.6■■■□□ 2.17
IMP4-208ENST00000460766 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
IMP4-208ENST00000460766 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.59■■■□□ 2.17
IMP4-208ENST00000460766 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.58■■■□□ 2.17
IMP4-208ENST00000460766 JPH4Q96JJ6 628 aa28.58■■■□□ 2.17
IMP4-208ENST00000460766 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
IMP4-208ENST00000460766 BCANQ96GW7 911 aa28.58■■■□□ 2.17
IMP4-208ENST00000460766 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
IMP4-208ENST00000460766 KIF14Q15058 1648 aa28.52■■■□□ 2.16
IMP4-208ENST00000460766 NUP160Q12769 1436 aa28.51■■■□□ 2.15
IMP4-208ENST00000460766 NEFLP07196 543 aa28.51■■■□□ 2.15
IMP4-208ENST00000460766 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.51■■■□□ 2.15
IMP4-208ENST00000460766 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.51■■■□□ 2.15
IMP4-208ENST00000460766 NCOA1Q15788 1441 aa28.5■■■□□ 2.15
IMP4-208ENST00000460766 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.5■■■□□ 2.15
IMP4-208ENST00000460766 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.46■■■□□ 2.15
IMP4-208ENST00000460766 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
IMP4-208ENST00000460766 PZPP20742 1482 aa28.46■■■□□ 2.15
IMP4-208ENST00000460766 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.45■■■□□ 2.15
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.44■■■□□ 2.14
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
IMP4-208ENST00000460766 CCDC7Q96M83 1385 aa28.43■■■□□ 2.14
IMP4-208ENST00000460766 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.43■■■□□ 2.14
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.42■■■□□ 2.14
IMP4-208ENST00000460766 ADGRL2O95490 1459 aa28.41■■■□□ 2.14
IMP4-208ENST00000460766 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.41■■■□□ 2.14
IMP4-208ENST00000460766 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.36■■■□□ 2.13
IMP4-208ENST00000460766 PKD2Q13563 968 aa28.36■■■□□ 2.13
IMP4-208ENST00000460766 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.36■■■□□ 2.13
IMP4-208ENST00000460766 ABCA8O94911 1581 aa28.35■■■□□ 2.13
IMP4-208ENST00000460766 ATP10BO94823 1461 aa28.35■■■□□ 2.13
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.34■■■□□ 2.13
IMP4-208ENST00000460766 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.33■■■□□ 2.13
IMP4-208ENST00000460766 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.32■■■□□ 2.12
IMP4-208ENST00000460766 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
IMP4-208ENST00000460766 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.3■■■□□ 2.12
IMP4-208ENST00000460766 CCDC184Q52MB2 194 aa28.3■■■□□ 2.12
IMP4-208ENST00000460766 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
IMP4-208ENST00000460766 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.28■■■□□ 2.12
IMP4-208ENST00000460766 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.27■■■□□ 2.12
IMP4-208ENST00000460766 TSPY4P0CV99 314 aa28.26■■■□□ 2.11
IMP4-208ENST00000460766 TSPY10P0CW01 314 aa28.26■■■□□ 2.11
IMP4-208ENST00000460766 NUP155O75694 1391 aa28.25■■■□□ 2.11
IMP4-208ENST00000460766 MBD5Q9P267 1494 aa28.24■■■□□ 2.11
IMP4-208ENST00000460766 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.24■■■□□ 2.11
IMP4-208ENST00000460766 MRS2Q9HD23 443 aa28.23■■■□□ 2.11
IMP4-208ENST00000460766 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.22■■■□□ 2.11
IMP4-208ENST00000460766 PTPRGP23470 1445 aa28.21■■■□□ 2.11
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
IMP4-208ENST00000460766 USP47Q96K76 1375 aa28.19■■■□□ 2.1
IMP4-208ENST00000460766 MYT1Q01538 1121 aa28.18■■■□□ 2.1
IMP4-208ENST00000460766 KIF15Q9NS87 1388 aa28.16■■■□□ 2.1
IMP4-208ENST00000460766 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.16■■■□□ 2.1
IMP4-208ENST00000460766 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
IMP4-208ENST00000460766 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
IMP4-208ENST00000460766 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
IMP4-208ENST00000460766 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.08■■■□□ 2.09
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.08■■■□□ 2.09
IMP4-208ENST00000460766 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.06■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.06■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.06■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.05■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 KDM5CP41229 1560 aa28.05■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.05■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.04■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.03■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.03■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.02■■■□□ 2.08
IMP4-208ENST00000460766 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.01■■■□□ 2.07
IMP4-208ENST00000460766 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
IMP4-208ENST00000460766 RSPH4AQ5TD94 716 aa28■■■□□ 2.07
IMP4-208ENST00000460766 PREX2Q70Z35 1606 aa27.99■■■□□ 2.07
IMP4-208ENST00000460766 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.98■■■□□ 2.07
IMP4-208ENST00000460766 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.95■■■□□ 2.07
IMP4-208ENST00000460766 CHD1O14646 1710 aa27.94■■■□□ 2.06
IMP4-208ENST00000460766 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.94■■■□□ 2.06
IMP4-208ENST00000460766 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.94■■■□□ 2.06
IMP4-208ENST00000460766 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.93■■■□□ 2.06
IMP4-208ENST00000460766 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
IMP4-208ENST00000460766 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.9■■■□□ 2.06
IMP4-208ENST00000460766 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.89■■■□□ 2.06
IMP4-208ENST00000460766 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.062e-7■■■□□ 17.7
IMP4-208ENST00000460766 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 166.9 ms