RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446817.1

HLA-V-202, Transcript of major histocompatibility complex, class I, V (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene HLA-V, Length 847 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-V-202ENST00000446817 MLECQ14165 292 aa42.81■■■■■ 4.44
HLA-V-202ENST00000446817 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.8■■■■■ 4.44
HLA-V-202ENST00000446817 HSPA2P54652 639 aa42.79■■■■■ 4.44
HLA-V-202ENST00000446817 PLCH2O75038 1416 aa42.79■■■■■ 4.44
HLA-V-202ENST00000446817 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.76■■■■■ 4.44
HLA-V-202ENST00000446817 FMN1Q68DA7 1419 aa42.72■■■■■ 4.43
HLA-V-202ENST00000446817 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
HLA-V-202ENST00000446817 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.7■■■■■ 4.43
HLA-V-202ENST00000446817 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.66■■■■■ 4.42
HLA-V-202ENST00000446817 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
HLA-V-202ENST00000446817 KIF14Q15058 1648 aa42.65■■■■■ 4.42
HLA-V-202ENST00000446817 ATP10AO60312 1499 aa42.65■■■■■ 4.42
HLA-V-202ENST00000446817 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.63■■■■■ 4.41
HLA-V-202ENST00000446817 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.6■■■■■ 4.41
HLA-V-202ENST00000446817 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.59■■■■■ 4.41
HLA-V-202ENST00000446817 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.59■■■■■ 4.41
HLA-V-202ENST00000446817 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.56■■■■■ 4.4
HLA-V-202ENST00000446817 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.54■■■■■ 4.4
HLA-V-202ENST00000446817 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.52■■■■■ 4.4
HLA-V-202ENST00000446817 CLIP1P30622 1438 aa42.52■■■■■ 4.4
HLA-V-202ENST00000446817 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
HLA-V-202ENST00000446817 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.5■■■■■ 4.39
HLA-V-202ENST00000446817 KDM5CP41229 1560 aa42.45■■■■■ 4.39
HLA-V-202ENST00000446817 CERKQ8TCT0 537 aa42.45■■■■■ 4.39
HLA-V-202ENST00000446817 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.43■■■■■ 4.38
HLA-V-202ENST00000446817 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
HLA-V-202ENST00000446817 AFAP1Q8N556 730 aa42.41■■■■■ 4.38
HLA-V-202ENST00000446817 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
HLA-V-202ENST00000446817 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.39■■■■■ 4.38
HLA-V-202ENST00000446817 PREX2Q70Z35 1606 aa42.33■■■■■ 4.37
HLA-V-202ENST00000446817 ABCA6Q8N139 1617 aa42.33■■■■■ 4.37
HLA-V-202ENST00000446817 REREQ9P2R6 1566 aa42.31■■■■■ 4.36
HLA-V-202ENST00000446817 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.3■■■■■ 4.36
HLA-V-202ENST00000446817 STRCQ7RTU9 1775 aa42.3■■■■■ 4.36
HLA-V-202ENST00000446817 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.28■■■■■ 4.36
HLA-V-202ENST00000446817 C3P01024 1663 aa42.27■■■■■ 4.36
HLA-V-202ENST00000446817 ABCC1P33527 1531 aa42.25■■■■■ 4.35
HLA-V-202ENST00000446817 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.24■■■■■ 4.35
HLA-V-202ENST00000446817 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.24■■■■■ 4.35
HLA-V-202ENST00000446817 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.24■■■■■ 4.35
HLA-V-202ENST00000446817 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
HLA-V-202ENST00000446817 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.2■■■■■ 4.35
HLA-V-202ENST00000446817 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.18■■■■■ 4.34
HLA-V-202ENST00000446817 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.18■■■■■ 4.34
HLA-V-202ENST00000446817 AGLP35573 1532 aa42.15■■■■■ 4.34
HLA-V-202ENST00000446817 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.14■■■■■ 4.34
HLA-V-202ENST00000446817 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.01■■■■■ 4.32
HLA-V-202ENST00000446817 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
HLA-V-202ENST00000446817 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.01■■■■■ 4.32
HLA-V-202ENST00000446817 PTPRTO14522 1441 aa41.99■■■■■ 4.31
HLA-V-202ENST00000446817 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.99■■■■■ 4.31
HLA-V-202ENST00000446817 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
HLA-V-202ENST00000446817 MROH2AA6NES4 1674 aa41.96■■■■■ 4.31
HLA-V-202ENST00000446817 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.95■■■■■ 4.31
HLA-V-202ENST00000446817 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
HLA-V-202ENST00000446817 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.88■■■■■ 4.29
HLA-V-202ENST00000446817 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
HLA-V-202ENST00000446817 NCOA1Q15788 1441 aa41.85■■■■■ 4.29
HLA-V-202ENST00000446817 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.29
HLA-V-202ENST00000446817 ATP7AQ04656 1500 aa41.83■■■■■ 4.29
HLA-V-202ENST00000446817 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
HLA-V-202ENST00000446817 NPATQ14207 1427 aa41.82■■■■■ 4.29
HLA-V-202ENST00000446817 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.81■■■■■ 4.28
HLA-V-202ENST00000446817 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.8■■■■■ 4.28
HLA-V-202ENST00000446817 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.78■■■■■ 4.28
HLA-V-202ENST00000446817 ZMYM3Q14202 1370 aa41.77■■■■■ 4.28
HLA-V-202ENST00000446817 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
HLA-V-202ENST00000446817 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
HLA-V-202ENST00000446817 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.75■■■■■ 4.27
HLA-V-202ENST00000446817 PLXNC1O60486 1568 aa41.72■■■■■ 4.27
HLA-V-202ENST00000446817 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.72■■■■■ 4.27
HLA-V-202ENST00000446817 A2MP01023 1474 aa41.72■■■■■ 4.27
HLA-V-202ENST00000446817 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.72■■■■■ 4.27
HLA-V-202ENST00000446817 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.7■■■■■ 4.27
HLA-V-202ENST00000446817 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
HLA-V-202ENST00000446817 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.68■■■■■ 4.26
HLA-V-202ENST00000446817 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.68■■■■■ 4.26
HLA-V-202ENST00000446817 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.67■■■■■ 4.26
HLA-V-202ENST00000446817 GGT6Q6P531 493 aa41.64■■■■■ 4.26
HLA-V-202ENST00000446817 ILDR2Q71H61 639 aa41.64■■■■■ 4.26
HLA-V-202ENST00000446817 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.63■■■■■ 4.25
HLA-V-202ENST00000446817 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
HLA-V-202ENST00000446817 PTPRKQ15262 1439 aa41.57■■■■■ 4.25
HLA-V-202ENST00000446817 TIAM1Q13009 1591 aa41.55■■■■■ 4.24
HLA-V-202ENST00000446817 PLA2R1Q13018 1463 aa41.54■■■■■ 4.24
HLA-V-202ENST00000446817 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
HLA-V-202ENST00000446817 SOCS7O14512 581 aa41.51■■■■■ 4.24
HLA-V-202ENST00000446817 PKD2Q13563 968 aa41.51■■■■■ 4.24
HLA-V-202ENST00000446817 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.5■■■■■ 4.23
HLA-V-202ENST00000446817 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
HLA-V-202ENST00000446817 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.47■■■■■ 4.23
HLA-V-202ENST00000446817 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
HLA-V-202ENST00000446817 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.43■■■■■ 4.22
HLA-V-202ENST00000446817 MBD5Q9P267 1494 aa41.4■■■■■ 4.22
HLA-V-202ENST00000446817 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.39■■■■■ 4.22
HLA-V-202ENST00000446817 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.38■■■■■ 4.22
HLA-V-202ENST00000446817 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
HLA-V-202ENST00000446817 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
HLA-V-202ENST00000446817 CEP162Q5TB80 1403 aa41.35■■■■■ 4.21
HLA-V-202ENST00000446817 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms