RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423170.1

RNF25-202, Transcript of ring finger protein 25, humanhuman

TSL 5

Gene RNF25, Length 624 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25-202ENST00000423170 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.42■■□□□ 1.02
RNF25-202ENST00000423170 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RNF25-202ENST00000423170 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.39■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 ILDR2Q71H61 639 aa21.37■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.35■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.35■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.35■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.35■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 ATP10AO60312 1499 aa21.34■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.34■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 KDM5CP41229 1560 aa21.34■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 C3P01024 1663 aa21.34■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 PLCH2O75038 1416 aa21.33■■□□□ 1.01
RNF25-202ENST00000423170 KIF14Q15058 1648 aa21.33■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 MLECQ14165 292 aa21.32■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.31■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 EEA1Q15075 1411 aa21.3■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.3■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.29■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 REREQ9P2R6 1566 aa21.29■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 ABCA6Q8N139 1617 aa21.28■■□□□ 1
RNF25-202ENST00000423170 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.26■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 SOCS7O14512 581 aa21.26■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.24■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.23■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.23■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 PTPRTO14522 1441 aa21.21■□□□□ 0.99
RNF25-202ENST00000423170 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.18■□□□□ 0.98
RNF25-202ENST00000423170 PREX2Q70Z35 1606 aa21.17■□□□□ 0.98
RNF25-202ENST00000423170 AGLP35573 1532 aa21.16■□□□□ 0.98
RNF25-202ENST00000423170 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.16■□□□□ 0.98
RNF25-202ENST00000423170 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.16■□□□□ 0.98
RNF25-202ENST00000423170 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.15■□□□□ 0.98
RNF25-202ENST00000423170 ABCC1P33527 1531 aa21.14■□□□□ 0.98
RNF25-202ENST00000423170 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.14■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 MROH2AA6NES4 1674 aa21.13■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.13■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 NCOA1Q15788 1441 aa21.12■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.12■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.1■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.1■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 AFAP1Q8N556 730 aa21.09■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 FMN1Q68DA7 1419 aa21.08■□□□□ 0.97
RNF25-202ENST00000423170 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.06■□□□□ 0.96
RNF25-202ENST00000423170 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.06■□□□□ 0.96
RNF25-202ENST00000423170 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
RNF25-202ENST00000423170 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.04■□□□□ 0.96
RNF25-202ENST00000423170 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
RNF25-202ENST00000423170 CLIP1P30622 1438 aa21■□□□□ 0.95
RNF25-202ENST00000423170 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21■□□□□ 0.95
RNF25-202ENST00000423170 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.99■□□□□ 0.95
RNF25-202ENST00000423170 NPATQ14207 1427 aa20.98■□□□□ 0.95
RNF25-202ENST00000423170 PLXNC1O60486 1568 aa20.97■□□□□ 0.95
RNF25-202ENST00000423170 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
RNF25-202ENST00000423170 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 PLA2R1Q13018 1463 aa20.92■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.92■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.91■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.9■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.89■□□□□ 0.94
RNF25-202ENST00000423170 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
RNF25-202ENST00000423170 ATP7AQ04656 1500 aa20.88■□□□□ 0.93
RNF25-202ENST00000423170 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RNF25-202ENST00000423170 ZMYM3Q14202 1370 aa20.86■□□□□ 0.93
RNF25-202ENST00000423170 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.86■□□□□ 0.93
RNF25-202ENST00000423170 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RNF25-202ENST00000423170 PTPRKQ15262 1439 aa20.86■□□□□ 0.93
RNF25-202ENST00000423170 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.85■□□□□ 0.93
RNF25-202ENST00000423170 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.83■□□□□ 0.93
RNF25-202ENST00000423170 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.83■□□□□ 0.92
RNF25-202ENST00000423170 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
RNF25-202ENST00000423170 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.81■□□□□ 0.92
RNF25-202ENST00000423170 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
RNF25-202ENST00000423170 A2MP01023 1474 aa20.79■□□□□ 0.92
RNF25-202ENST00000423170 ALKQ9UM73 1620 aa20.78■□□□□ 0.92
RNF25-202ENST00000423170 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.77■□□□□ 0.92
RNF25-202ENST00000423170 PKD2Q13563 968 aa20.76■□□□□ 0.91
RNF25-202ENST00000423170 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.75■□□□□ 0.91
RNF25-202ENST00000423170 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RNF25-202ENST00000423170 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.73■□□□□ 0.91
RNF25-202ENST00000423170 CPS1P31327 1500 aa20.72■□□□□ 0.91
RNF25-202ENST00000423170 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.72■□□□□ 0.91
RNF25-202ENST00000423170 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.7■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.69■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.69■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 HSPA1LP34931 641 aa20.68■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 TIAM1Q13009 1591 aa20.68■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
RNF25-202ENST00000423170 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms