RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.23■■□□□ 1.31
HPS1-205ENST00000414009 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.22■■□□□ 1.31
HPS1-205ENST00000414009 SLC4A2P04920 1241 aa23.21■■□□□ 1.31
HPS1-205ENST00000414009 APLP2Q06481 763 aa23.2■■□□□ 1.3
HPS1-205ENST00000414009 KIF14Q15058 1648 aa23.19■■□□□ 1.3
HPS1-205ENST00000414009 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.18■■□□□ 1.3
HPS1-205ENST00000414009 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.16■■□□□ 1.3
HPS1-205ENST00000414009 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
HPS1-205ENST00000414009 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HPS1-205ENST00000414009 TIAM1Q13009 1591 aa23.11■■□□□ 1.29
HPS1-205ENST00000414009 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.11■■□□□ 1.29
HPS1-205ENST00000414009 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.1■■□□□ 1.29
HPS1-205ENST00000414009 KDM6BO15054 1643 aa23.08■■□□□ 1.29
HPS1-205ENST00000414009 MAP3K1Q13233 1512 aa23.08■■□□□ 1.28
HPS1-205ENST00000414009 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.07■■□□□ 1.28
HPS1-205ENST00000414009 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.06■■□□□ 1.28
HPS1-205ENST00000414009 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.05■■□□□ 1.28
HPS1-205ENST00000414009 PLCH2O75038 1416 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS1-205ENST00000414009 NEO1Q92859 1461 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS1-205ENST00000414009 FANCAO15360 1455 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS1-205ENST00000414009 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.02■■□□□ 1.28
HPS1-205ENST00000414009 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.01■■□□□ 1.27
HPS1-205ENST00000414009 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.01■■□□□ 1.27
HPS1-205ENST00000414009 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HPS1-205ENST00000414009 ARHGAP5Q13017 1502 aa23■■□□□ 1.27
HPS1-205ENST00000414009 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23■■□□□ 1.27
HPS1-205ENST00000414009 AKNAQ7Z591 1439 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS1-205ENST00000414009 PREX2Q70Z35 1606 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS1-205ENST00000414009 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.94■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 NCOA2Q15596 1464 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.92■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 ADGRL1O94910 1474 aa22.92■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HPS1-205ENST00000414009 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS1-205ENST00000414009 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HPS1-205ENST00000414009 RAPGEF3O95398 923 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS1-205ENST00000414009 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.83■■□□□ 1.25
HPS1-205ENST00000414009 RICTORQ6R327 1708 aa22.79■■□□□ 1.24
HPS1-205ENST00000414009 ABCC1P33527 1531 aa22.79■■□□□ 1.24
HPS1-205ENST00000414009 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.79■■□□□ 1.24
HPS1-205ENST00000414009 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.79■■□□□ 1.24
HPS1-205ENST00000414009 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.79■■□□□ 1.24
HPS1-205ENST00000414009 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.78■■□□□ 1.24
HPS1-205ENST00000414009 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.78■■□□□ 1.24
HPS1-205ENST00000414009 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.76■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 CAPN15O75808 1086 aa22.76■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.75■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 MIA2Q96PC5 1412 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 AFAP1Q8N556 730 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS1-205ENST00000414009 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.69■■□□□ 1.22
HPS1-205ENST00000414009 KDM5CP41229 1560 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS1-205ENST00000414009 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS1-205ENST00000414009 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.67■■□□□ 1.22
HPS1-205ENST00000414009 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.66■■□□□ 1.22
HPS1-205ENST00000414009 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HPS1-205ENST00000414009 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS1-205ENST00000414009 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS1-205ENST00000414009 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 DSG3P32926 999 aa22.63■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 MBD5Q9P267 1494 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 TSPY4P0CV99 314 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 TSPY10P0CW01 314 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.6■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 ATP10AO60312 1499 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS1-205ENST00000414009 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
HPS1-205ENST00000414009 ATP7AQ04656 1500 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-205ENST00000414009 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-205ENST00000414009 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.56■■□□□ 1.2
HPS1-205ENST00000414009 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.54■■□□□ 1.2
HPS1-205ENST00000414009 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
HPS1-205ENST00000414009 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.54■■□□□ 1.2
HPS1-205ENST00000414009 ABCA6Q8N139 1617 aa22.53■■□□□ 1.2
HPS1-205ENST00000414009 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
HPS1-205ENST00000414009 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HPS1-205ENST00000414009 DAPK1P53355 1430 aa22.48■■□□□ 1.19
HPS1-205ENST00000414009 REREQ9P2R6 1566 aa22.47■■□□□ 1.19
HPS1-205ENST00000414009 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.47■■□□□ 1.19
HPS1-205ENST00000414009 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.47■■□□□ 1.19
HPS1-205ENST00000414009 ABCC5O15440 1437 aa22.47■■□□□ 1.19
HPS1-205ENST00000414009 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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