RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409440.7

CERKL-205, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CERKL, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-205ENST00000409440 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.71■■■□□ 2.19
CERKL-205ENST00000409440 ROCK1Q13464 1354 aa28.71■■■□□ 2.19
CERKL-205ENST00000409440 CCDC184Q52MB2 194 aa28.7■■■□□ 2.19
CERKL-205ENST00000409440 ABCC5O15440 1437 aa28.7■■■□□ 2.19
CERKL-205ENST00000409440 NCOA1Q15788 1441 aa28.69■■■□□ 2.18
CERKL-205ENST00000409440 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.69■■■□□ 2.18
CERKL-205ENST00000409440 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CERKL-205ENST00000409440 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
CERKL-205ENST00000409440 CCDC7Q96M83 1385 aa28.68■■■□□ 2.18
CERKL-205ENST00000409440 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CERKL-205ENST00000409440 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CERKL-205ENST00000409440 DISP1Q96F81 1524 aa28.66■■■□□ 2.18
CERKL-205ENST00000409440 KIAA0556O60303 1618 aa28.66■■■□□ 2.18
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CERKL-205ENST00000409440 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.62■■■□□ 2.17
CERKL-205ENST00000409440 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.59■■■□□ 2.17
CERKL-205ENST00000409440 IFT140Q96RY7 1462 aa28.57■■■□□ 2.16
CERKL-205ENST00000409440 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.57■■■□□ 2.16
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CERKL-205ENST00000409440 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.55■■■□□ 2.16
CERKL-205ENST00000409440 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.54■■■□□ 2.16
CERKL-205ENST00000409440 MRS2Q9HD23 443 aa28.54■■■□□ 2.16
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CERKL-205ENST00000409440 PZPP20742 1482 aa28.5■■■□□ 2.15
CERKL-205ENST00000409440 GRIN2AQ12879 1464 aa28.5■■■□□ 2.15
CERKL-205ENST00000409440 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.49■■■□□ 2.15
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CERKL-205ENST00000409440 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CERKL-205ENST00000409440 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CERKL-205ENST00000409440 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CERKL-205ENST00000409440 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.43■■■□□ 2.14
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CERKL-205ENST00000409440 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.41■■■□□ 2.14
CERKL-205ENST00000409440 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.41■■■□□ 2.14
CERKL-205ENST00000409440 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CERKL-205ENST00000409440 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.4■■■□□ 2.14
CERKL-205ENST00000409440 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.4■■■□□ 2.14
CERKL-205ENST00000409440 KIF14Q15058 1648 aa28.39■■■□□ 2.14
CERKL-205ENST00000409440 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.39■■■□□ 2.13
CERKL-205ENST00000409440 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.38■■■□□ 2.13
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CERKL-205ENST00000409440 MBD5Q9P267 1494 aa28.37■■■□□ 2.13
CERKL-205ENST00000409440 PKD2Q13563 968 aa28.35■■■□□ 2.13
CERKL-205ENST00000409440 ADGRL2O95490 1459 aa28.34■■■□□ 2.13
CERKL-205ENST00000409440 MSH5O43196 834 aa28.34■■■□□ 2.13
CERKL-205ENST00000409440 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.34■■■□□ 2.13
CERKL-205ENST00000409440 USP47Q96K76 1375 aa28.33■■■□□ 2.13
CERKL-205ENST00000409440 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CERKL-205ENST00000409440 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.33■■■□□ 2.13
CERKL-205ENST00000409440 CEP170Q5SW79 1584 aa28.32■■■□□ 2.12
CERKL-205ENST00000409440 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CERKL-205ENST00000409440 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.32■■■□□ 2.12
CERKL-205ENST00000409440 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.31■■■□□ 2.12
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CERKL-205ENST00000409440 FBLN2P98095 1184 aa28.27■■■□□ 2.12
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CERKL-205ENST00000409440 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.27■■■□□ 2.12
CERKL-205ENST00000409440 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
CERKL-205ENST00000409440 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.26■■■□□ 2.12
CERKL-205ENST00000409440 KDM5CP41229 1560 aa28.24■■■□□ 2.11
CERKL-205ENST00000409440 SYNJ2O15056 1496 aa28.23■■■□□ 2.11
CERKL-205ENST00000409440 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.22■■■□□ 2.11
CERKL-205ENST00000409440 JPH4Q96JJ6 628 aa28.21■■■□□ 2.11
CERKL-205ENST00000409440 NUP155O75694 1391 aa28.19■■■□□ 2.1
CERKL-205ENST00000409440 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.18■■■□□ 2.1
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CERKL-205ENST00000409440 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.16■■■□□ 2.1
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CERKL-205ENST00000409440 ERCC6Q03468 1493 aa28.13■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.13■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.13■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 NUP160Q12769 1436 aa28.12■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.11■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.1■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 NUDCQ9Y266 331 aa28.1■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.1■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 ATP10BO94823 1461 aa28.1■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 ABCA8O94911 1581 aa28.09■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 TSPY4P0CV99 314 aa28.08■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 TSPY10P0CW01 314 aa28.08■■■□□ 2.09
CERKL-205ENST00000409440 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.07■■■□□ 2.08
CERKL-205ENST00000409440 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CERKL-205ENST00000409440 TMC1Q8TDI8 760 aa28.05■■■□□ 2.08
CERKL-205ENST00000409440 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.05■■■□□ 2.08
CERKL-205ENST00000409440 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.04■■■□□ 2.08
CERKL-205ENST00000409440 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.08
CERKL-205ENST00000409440 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.04■■■□□ 2.08
CERKL-205ENST00000409440 KIF15Q9NS87 1388 aa28.04■■■□□ 2.08
CERKL-205ENST00000409440 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.03■■■□□ 2.08
CERKL-205ENST00000409440 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.01■■■□□ 2.07
CERKL-205ENST00000409440 PTPRGP23470 1445 aa27.98■■■□□ 2.07
CERKL-205ENST00000409440 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.95■■■□□ 2.06
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