RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.69■■■□□ 2.5
C10orf55-201ENST00000409178 NUP160Q12769 1436 aa30.69■■■□□ 2.5
C10orf55-201ENST00000409178 JPH4Q96JJ6 628 aa30.69■■■□□ 2.5
C10orf55-201ENST00000409178 FOXD1Q16676 465 aa30.67■■■□□ 2.5
C10orf55-201ENST00000409178 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
C10orf55-201ENST00000409178 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
C10orf55-201ENST00000409178 ROCK1Q13464 1354 aa30.65■■■□□ 2.5
C10orf55-201ENST00000409178 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.63■■■□□ 2.49
C10orf55-201ENST00000409178 KIF14Q15058 1648 aa30.59■■■□□ 2.49
C10orf55-201ENST00000409178 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
C10orf55-201ENST00000409178 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.57■■■□□ 2.48
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C10orf55-201ENST00000409178 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
C10orf55-201ENST00000409178 ANP32CO43423 234 aa30.5■■■□□ 2.47
C10orf55-201ENST00000409178 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.5■■■□□ 2.47
C10orf55-201ENST00000409178 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.49■■■□□ 2.47
C10orf55-201ENST00000409178 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.48■■■□□ 2.47
C10orf55-201ENST00000409178 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.48■■■□□ 2.47
C10orf55-201ENST00000409178 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
C10orf55-201ENST00000409178 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
C10orf55-201ENST00000409178 ABCA8O94911 1581 aa30.46■■■□□ 2.47
C10orf55-201ENST00000409178 NCOA1Q15788 1441 aa30.43■■■□□ 2.46
C10orf55-201ENST00000409178 ATP10BO94823 1461 aa30.42■■■□□ 2.46
C10orf55-201ENST00000409178 CCER2I3L3R5 266 aa30.42■■■□□ 2.46
C10orf55-201ENST00000409178 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
C10orf55-201ENST00000409178 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.41■■■□□ 2.46
C10orf55-201ENST00000409178 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
C10orf55-201ENST00000409178 PZPP20742 1482 aa30.37■■■□□ 2.45
C10orf55-201ENST00000409178 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.37■■■□□ 2.45
C10orf55-201ENST00000409178 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.35■■■□□ 2.45
C10orf55-201ENST00000409178 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.35■■■□□ 2.45
C10orf55-201ENST00000409178 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.35■■■□□ 2.45
C10orf55-201ENST00000409178 ADGRL2O95490 1459 aa30.34■■■□□ 2.45
C10orf55-201ENST00000409178 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.34■■■□□ 2.45
C10orf55-201ENST00000409178 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.34■■■□□ 2.45
C10orf55-201ENST00000409178 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.34■■■□□ 2.45
C10orf55-201ENST00000409178 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.31■■■□□ 2.44
C10orf55-201ENST00000409178 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.3■■■□□ 2.44
C10orf55-201ENST00000409178 PTPRGP23470 1445 aa30.29■■■□□ 2.44
C10orf55-201ENST00000409178 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.24■■■□□ 2.43
C10orf55-201ENST00000409178 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
C10orf55-201ENST00000409178 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.22■■■□□ 2.43
C10orf55-201ENST00000409178 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.21■■■□□ 2.43
C10orf55-201ENST00000409178 PKD2Q13563 968 aa30.21■■■□□ 2.43
C10orf55-201ENST00000409178 CHD1O14646 1710 aa30.19■■■□□ 2.42
C10orf55-201ENST00000409178 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
C10orf55-201ENST00000409178 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.17■■■□□ 2.42
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC7Q96M83 1385 aa30.14■■■□□ 2.42
C10orf55-201ENST00000409178 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.13■■■□□ 2.41
C10orf55-201ENST00000409178 TSPY4P0CV99 314 aa30.13■■■□□ 2.41
C10orf55-201ENST00000409178 TSPY10P0CW01 314 aa30.13■■■□□ 2.41
C10orf55-201ENST00000409178 NUP155O75694 1391 aa30.12■■■□□ 2.41
C10orf55-201ENST00000409178 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.11■■■□□ 2.41
C10orf55-201ENST00000409178 MBD5Q9P267 1494 aa30.09■■■□□ 2.41
C10orf55-201ENST00000409178 KIF15Q9NS87 1388 aa30.08■■■□□ 2.41
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
C10orf55-201ENST00000409178 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.05■■■□□ 2.4
C10orf55-201ENST00000409178 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.05■■■□□ 2.4
C10orf55-201ENST00000409178 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.04■■■□□ 2.4
C10orf55-201ENST00000409178 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.04■■■□□ 2.4
C10orf55-201ENST00000409178 SHROOM2Q13796 1616 aa30.04■■■□□ 2.4
C10orf55-201ENST00000409178 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.03■■■□□ 2.4
C10orf55-201ENST00000409178 FKBP8Q14318 412 aa30.03■■■□□ 2.4
C10orf55-201ENST00000409178 BCANQ96GW7 911 aa30.02■■■□□ 2.4
C10orf55-201ENST00000409178 PREX2Q70Z35 1606 aa30.02■■■□□ 2.4
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30■■■□□ 2.39
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC184Q52MB2 194 aa29.99■■■□□ 2.39
C10orf55-201ENST00000409178 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.98■■■□□ 2.39
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C10orf55-201ENST00000409178 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.97■■■□□ 2.39
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C10orf55-201ENST00000409178 USP47Q96K76 1375 aa29.94■■■□□ 2.38
C10orf55-201ENST00000409178 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.94■■■□□ 2.38
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C10orf55-201ENST00000409178 ABCC2Q92887 1545 aa29.91■■■□□ 2.38
C10orf55-201ENST00000409178 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
C10orf55-201ENST00000409178 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.87■■■□□ 2.37
C10orf55-201ENST00000409178 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.86■■■□□ 2.37
C10orf55-201ENST00000409178 NEFLP07196 543 aa29.86■■■□□ 2.37
C10orf55-201ENST00000409178 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.86■■■□□ 2.37
C10orf55-201ENST00000409178 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.85■■■□□ 2.37
C10orf55-201ENST00000409178 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.85■■■□□ 2.37
C10orf55-201ENST00000409178 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.84■■■□□ 2.37
C10orf55-201ENST00000409178 KDM5CP41229 1560 aa29.84■■■□□ 2.37
C10orf55-201ENST00000409178 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.82■■■□□ 2.37
C10orf55-201ENST00000409178 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.82■■■□□ 2.36
C10orf55-201ENST00000409178 MRS2Q9HD23 443 aa29.81■■■□□ 2.36
C10orf55-201ENST00000409178 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.8■■■□□ 2.36
C10orf55-201ENST00000409178 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.8■■■□□ 2.36
C10orf55-201ENST00000409178 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.79■■■□□ 2.36
C10orf55-201ENST00000409178 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
C10orf55-201ENST00000409178 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.77■■■□□ 2.36
C10orf55-201ENST00000409178 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.77■■■□□ 2.36
C10orf55-201ENST00000409178 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
C10orf55-201ENST00000409178 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
C10orf55-201ENST00000409178 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.76■■■□□ 2.35
C10orf55-201ENST00000409178 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.75■■■□□ 2.35
C10orf55-201ENST00000409178 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
C10orf55-201ENST00000409178 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.72■■■□□ 2.35
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