RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SYNJ2O15056 1496 aa5.9□□□□□ -1.46
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP43Q8NDM7 1665 aa5.9□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 JPH4Q96JJ6 628 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 C19orf67A6NJJ6 358 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 DISP1Q96F81 1524 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP170Q5SW79 1584 aa5.87□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 FKBP8Q14318 412 aa5.86□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 NCOA2Q15596 1464 aa5.86□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.86□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP160Q12769 1436 aa5.86□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 FGD6Q6ZV73 1430 aa5.86□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.86□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA0556O60303 1618 aa5.86□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 SETD5Q9C0A6 1442 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 HECW1Q76N89 1606 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 MYOM3Q5VTT5 1437 aa5.84□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa5.84□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
LRRTM4-201ENST00000409088 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.83□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 CHIC2Q9UKJ5 165 aa5.82□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPRKQ15262 1439 aa5.82□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa5.81□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGEF11O15085 1522 aa5.81□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa5.81□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHD1A6NEE1 506 aa5.8□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPRGP23470 1445 aa5.8□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 NEUROD1Q13562 356 aa5.8□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa5.8□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.8□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPN23Q9H3S7 1636 aa5.8□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR29P0C7W0 189 aa5.79□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 MIA2Q96PC5 1412 aa5.79□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 CREBZFQ9NS37 354 aa5.78□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 CHD1O14646 1710 aa5.78□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 HFM1A2PYH4 1435 aa5.78□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 NAIPQ13075 1403 aa5.78□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP10BO94823 1461 aa5.77□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 MAPKBP1O60336 1514 aa5.77□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM52Q96A61 297 aa5.77□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCA8O94911 1581 aa5.76□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 UACAQ9BZF9 1416 aa5.75□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCC5O15440 1437 aa5.75□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 DAPK1P53355 1430 aa5.74□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.74□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 KIF14Q15058 1648 aa5.74□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNH8Q96L42 1107 aa5.73□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.73□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 VASPP50552 380 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa5.72□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 SHROOM2Q13796 1616 aa5.72□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.72□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.72□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 AKNAQ7Z591 1439 aa5.72□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 ROCK1Q13464 1354 aa5.72□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 TONSLQ96HA7 1378 aa5.71□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCC10Q5T3U5 1492 aa5.71□□□□□ -1.49
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPY4P0CV99 314 aa5.71□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPY10P0CW01 314 aa5.71□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 KDM6BO15054 1643 aa5.71□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 ADCY10Q96PN6 1610 aa5.71□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 CLASP1Q7Z460 1538 aa5.71□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 MIER1Q8N108 512 aa5.7□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 ITSN2Q9NZM3 1697 aa5.7□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 NCOA1Q15788 1441 aa5.7□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCC2Q92887 1545 aa5.7□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC24A1O60721 1099 aa5.7□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa5.69□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 GCC2Q8IWJ2 1684 aa5.69□□□□□ -1.5
LRRTM4-201ENST00000409088 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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