RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401533.6

GAREM2-201, Transcript of GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GAREM2, Length 4,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAREM2-201ENST00000401533 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.84■■□□□ 1.57
GAREM2-201ENST00000401533 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.83■■□□□ 1.57
GAREM2-201ENST00000401533 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.82■■□□□ 1.56
GAREM2-201ENST00000401533 GRIN2BQ13224 1484 aa24.81■■□□□ 1.56
GAREM2-201ENST00000401533 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.79■■□□□ 1.56
GAREM2-201ENST00000401533 NCOA2Q15596 1464 aa24.78■■□□□ 1.56
GAREM2-201ENST00000401533 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.77■■□□□ 1.56
GAREM2-201ENST00000401533 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.75■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 WDR97A6NE52 1622 aa24.75■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.74■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.73■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 IFT140Q96RY7 1462 aa24.72■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.71■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.7■■□□□ 1.55
GAREM2-201ENST00000401533 NEUROD2Q15784 382 aa24.69■■□□□ 1.54
GAREM2-201ENST00000401533 MAPKBP1O60336 1514 aa24.68■■□□□ 1.54
GAREM2-201ENST00000401533 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.67■■□□□ 1.54
GAREM2-201ENST00000401533 IQGAP2Q13576 1575 aa24.67■■□□□ 1.54
GAREM2-201ENST00000401533 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.66■■□□□ 1.54
GAREM2-201ENST00000401533 SAMD9Q5K651 1589 aa24.65■■□□□ 1.54
GAREM2-201ENST00000401533 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
GAREM2-201ENST00000401533 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.64■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.62■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 SLC24A1O60721 1099 aa24.62■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 UACAQ9BZF9 1416 aa24.61■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 PTPRKQ15262 1439 aa24.61■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.6■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 ADAMTS12P58397 1594 aa24.59■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 HFM1A2PYH4 1435 aa24.58■■□□□ 1.53
GAREM2-201ENST00000401533 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 PBRM1Q86U86 1689 aa24.55■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.54■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 NEFMP07197 916 aa24.54■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 TMF1P82094 1093 aa24.54■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 HECW1Q76N89 1606 aa24.54■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 GGT6Q6P531 493 aa24.53■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 NAIPQ13075 1403 aa24.53■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.53■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GAREM2-201ENST00000401533 CCDC184Q52MB2 194 aa24.51■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 GRIN2AQ12879 1464 aa24.49■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.48■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 WDR62O43379 1518 aa24.48■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.48■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.47■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.47■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.46■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 KIF3BO15066 747 aa24.46■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 USP47Q96K76 1375 aa24.46■■□□□ 1.51
GAREM2-201ENST00000401533 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GAREM2-201ENST00000401533 PTPRGP23470 1445 aa24.44■■□□□ 1.5
GAREM2-201ENST00000401533 RGS3P49796 1198 aa24.43■■□□□ 1.5
GAREM2-201ENST00000401533 CDCA8Q53HL2 280 aa24.43■■□□□ 1.5
GAREM2-201ENST00000401533 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
GAREM2-201ENST00000401533 CCDC7Q96M83 1385 aa24.4■■□□□ 1.5
GAREM2-201ENST00000401533 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
GAREM2-201ENST00000401533 MIA2Q96PC5 1412 aa24.4■■□□□ 1.5
GAREM2-201ENST00000401533 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
GAREM2-201ENST00000401533 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 NUDCQ9Y266 331 aa24.37■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.36■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 DISP1Q96F81 1524 aa24.36■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 PLEKHG5O94827 1062 aa24.36■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 SYNJ2O15056 1496 aa24.35■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 PANK3Q9H999 370 aa24.35■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.35■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 STK26Q9P289 416 aa24.35■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.33■■□□□ 1.49
GAREM2-201ENST00000401533 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 RALBP1Q15311 655 aa24.32■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 KIAA0556O60303 1618 aa24.32■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 MLECQ14165 292 aa24.32■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.32■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 PLIN1O60240 522 aa24.31■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 ARXQ96QS3 562 aa24.31■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 NLRP13Q86W25 1043 aa24.3■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 KIF15Q9NS87 1388 aa24.3■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.3■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.29■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 ARHGEF11O15085 1522 aa24.28■■□□□ 1.48
GAREM2-201ENST00000401533 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
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