RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 PKD2Q13563 968 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 FOXD1Q16676 465 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 KIF21BO75037 1637 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 NCAPD3P42695 1498 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 MS4A1P11836 297 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRM-202ENST00000400053 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 ARID3AQ99856 593 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 TMF1P82094 1093 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 HSCBQ8IWL3 235 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 C14orf37Q86TY3 774 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 CFAP44Q96MT7 982 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 FGD1P98174 961 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHG5O94827 1062 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 NUDCQ9Y266 331 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 SYNJ1O43426 1573 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 NUP155O75694 1391 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 RCAN3Q9UKA8 241 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRM-202ENST00000400053 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 KCNJ4P48050 445 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 RALBP1Q15311 655 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 ARAP1Q96P48 1450 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 PRXQ9BXM0 1461 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 CFTRP13569 1480 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 KANK1Q14678 1352 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 NPHP1O15259 732 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA2Q08379 1002 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 JPH4Q96JJ6 628 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 MCCP23508 829 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA2012Q0VF49 1180 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 TOP2BQ02880 1626 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRM-202ENST00000400053 PTMSP20962 102 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 SLC4A3P48751 1232 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 GBP4Q96PP9 640 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 USP35Q9P2H5 1018 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 UACAQ9BZF9 1416 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 DRC7Q8IY82 874 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 APBB1O00213 710 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 CUX1P39880 1505 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 NLRP13Q86W25 1043 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 POGKQ9P215 609 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 HMGXB3Q12766 1538 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 GSE1Q14687 1217 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 CLSTN1O94985 981 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 PDE4AP27815 886 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRM-202ENST00000400053 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 PDE3BQ13370 1112 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 MORC1Q86VD1 984 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRM-202ENST00000400053 KIF15Q9NS87 1388 aa11.13□□□□□ -0.63
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