RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376085.3

LRRC38-201, Transcript of leucine rich repeat containing 38, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC38, Length 2,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38-201ENST00000376085 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.1■■□□□ 1.61
LRRC38-201ENST00000376085 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.09■■□□□ 1.61
LRRC38-201ENST00000376085 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
LRRC38-201ENST00000376085 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.08■■□□□ 1.6
LRRC38-201ENST00000376085 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
LRRC38-201ENST00000376085 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.07■■□□□ 1.6
LRRC38-201ENST00000376085 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.07■■□□□ 1.6
LRRC38-201ENST00000376085 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.06■■□□□ 1.6
LRRC38-201ENST00000376085 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
LRRC38-201ENST00000376085 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
LRRC38-201ENST00000376085 NEUROD1Q13562 356 aa25.03■■□□□ 1.6
LRRC38-201ENST00000376085 AKNAQ7Z591 1439 aa25.01■■□□□ 1.59
LRRC38-201ENST00000376085 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25■■□□□ 1.59
LRRC38-201ENST00000376085 TRIM52Q96A61 297 aa24.98■■□□□ 1.59
LRRC38-201ENST00000376085 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.98■■□□□ 1.59
LRRC38-201ENST00000376085 ROCK1Q13464 1354 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC38-201ENST00000376085 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.95■■□□□ 1.59
LRRC38-201ENST00000376085 NCOA1Q15788 1441 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRC38-201ENST00000376085 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
LRRC38-201ENST00000376085 PREX2Q70Z35 1606 aa24.94■■□□□ 1.58
LRRC38-201ENST00000376085 MBD5Q9P267 1494 aa24.93■■□□□ 1.58
LRRC38-201ENST00000376085 FOXD1Q16676 465 aa24.92■■□□□ 1.58
LRRC38-201ENST00000376085 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRC38-201ENST00000376085 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.89■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.87■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.85■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.85■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 ASXL2Q76L83 1435 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 ADGRL2O95490 1459 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 PLCH2O75038 1416 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 TSPY4P0CV99 314 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 TSPY10P0CW01 314 aa24.84■■□□□ 1.57
LRRC38-201ENST00000376085 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.83■■□□□ 1.56
LRRC38-201ENST00000376085 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.81■■□□□ 1.56
LRRC38-201ENST00000376085 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.8■■□□□ 1.56
LRRC38-201ENST00000376085 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.78■■□□□ 1.56
LRRC38-201ENST00000376085 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.78■■□□□ 1.56
LRRC38-201ENST00000376085 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.77■■□□□ 1.56
LRRC38-201ENST00000376085 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.77■■□□□ 1.56
LRRC38-201ENST00000376085 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.76■■□□□ 1.55
LRRC38-201ENST00000376085 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
LRRC38-201ENST00000376085 KIF15Q9NS87 1388 aa24.75■■□□□ 1.55
LRRC38-201ENST00000376085 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
LRRC38-201ENST00000376085 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.73■■□□□ 1.55
LRRC38-201ENST00000376085 PZPP20742 1482 aa24.72■■□□□ 1.55
LRRC38-201ENST00000376085 AFAP1Q8N556 730 aa24.71■■□□□ 1.55
LRRC38-201ENST00000376085 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
LRRC38-201ENST00000376085 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.7■■□□□ 1.55
LRRC38-201ENST00000376085 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
LRRC38-201ENST00000376085 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.67■■□□□ 1.54
LRRC38-201ENST00000376085 ABCC1P33527 1531 aa24.67■■□□□ 1.54
LRRC38-201ENST00000376085 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.67■■□□□ 1.54
LRRC38-201ENST00000376085 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.65■■□□□ 1.54
LRRC38-201ENST00000376085 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.65■■□□□ 1.54
LRRC38-201ENST00000376085 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.65■■□□□ 1.54
LRRC38-201ENST00000376085 TONSLQ96HA7 1378 aa24.65■■□□□ 1.54
LRRC38-201ENST00000376085 FANCAO15360 1455 aa24.65■■□□□ 1.54
LRRC38-201ENST00000376085 NUP155O75694 1391 aa24.64■■□□□ 1.53
LRRC38-201ENST00000376085 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.64■■□□□ 1.53
LRRC38-201ENST00000376085 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.63■■□□□ 1.53
LRRC38-201ENST00000376085 PKD2Q13563 968 aa24.62■■□□□ 1.53
LRRC38-201ENST00000376085 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.59■■□□□ 1.53
LRRC38-201ENST00000376085 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.59■■□□□ 1.53
LRRC38-201ENST00000376085 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
LRRC38-201ENST00000376085 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
LRRC38-201ENST00000376085 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.57■■□□□ 1.52
LRRC38-201ENST00000376085 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.56■■□□□ 1.52
LRRC38-201ENST00000376085 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
LRRC38-201ENST00000376085 CD109Q6YHK3 1445 aa24.54■■□□□ 1.52
LRRC38-201ENST00000376085 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.54■■□□□ 1.52
LRRC38-201ENST00000376085 ADGRL1O94910 1474 aa24.54■■□□□ 1.52
LRRC38-201ENST00000376085 PLXNC1O60486 1568 aa24.5■■□□□ 1.51
LRRC38-201ENST00000376085 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
LRRC38-201ENST00000376085 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.48■■□□□ 1.51
LRRC38-201ENST00000376085 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.47■■□□□ 1.51
LRRC38-201ENST00000376085 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
LRRC38-201ENST00000376085 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.46■■□□□ 1.51
LRRC38-201ENST00000376085 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.45■■□□□ 1.5
LRRC38-201ENST00000376085 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.45■■□□□ 1.5
LRRC38-201ENST00000376085 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.42■■□□□ 1.5
LRRC38-201ENST00000376085 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.41■■□□□ 1.5
LRRC38-201ENST00000376085 RAPGEF3O95398 923 aa24.41■■□□□ 1.5
LRRC38-201ENST00000376085 MIER1Q8N108 512 aa24.41■■□□□ 1.5
LRRC38-201ENST00000376085 ATP7AQ04656 1500 aa24.4■■□□□ 1.5
LRRC38-201ENST00000376085 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.4■■□□□ 1.5
LRRC38-201ENST00000376085 UNC13BO14795 1591 aa24.39■■□□□ 1.49
LRRC38-201ENST00000376085 ERBINQ96RT1 1412 aa24.38■■□□□ 1.49
LRRC38-201ENST00000376085 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
LRRC38-201ENST00000376085 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.37■■□□□ 1.49
LRRC38-201ENST00000376085 PLA2R1Q13018 1463 aa24.34■■□□□ 1.49
LRRC38-201ENST00000376085 KIF3BO15066 747 aa24.33■■□□□ 1.49
LRRC38-201ENST00000376085 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.33■■□□□ 1.48
LRRC38-201ENST00000376085 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.32■■□□□ 1.48
LRRC38-201ENST00000376085 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.31■■□□□ 1.48
LRRC38-201ENST00000376085 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.31■■□□□ 1.48
LRRC38-201ENST00000376085 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
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