RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 DISP1Q96F81 1524 aa18.32■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 DAPK1P53355 1430 aa18.32■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA0556O60303 1618 aa18.32■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.31■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 ABCC5O15440 1437 aa18.28■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 GRIN2AQ12879 1464 aa18.28■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 ROCK1Q13464 1354 aa18.28■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.27■□□□□ 0.52
TMOD1-202ENST00000375175 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
TMOD1-202ENST00000375175 FBLN2P98095 1184 aa18.26■□□□□ 0.51
TMOD1-202ENST00000375175 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
TMOD1-202ENST00000375175 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.24■□□□□ 0.51
TMOD1-202ENST00000375175 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TMOD1-202ENST00000375175 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TMOD1-202ENST00000375175 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TMOD1-202ENST00000375175 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.21■□□□□ 0.51
TMOD1-202ENST00000375175 ERCC6Q03468 1493 aa18.21■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.18■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.18■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.17■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC7Q96M83 1385 aa18.17■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.17■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.16■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 NCOA1Q15788 1441 aa18.15■□□□□ 0.5
TMOD1-202ENST00000375175 JPH4Q96JJ6 628 aa18.14■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 CEP170Q5SW79 1584 aa18.14■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.14■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.14■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC184Q52MB2 194 aa18.13■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 SYNJ2O15056 1496 aa18.13■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.12■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.11■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 KIF14Q15058 1648 aa18.11■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 PZPP20742 1482 aa18.11■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.1■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 PKD2Q13563 968 aa18.09■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 MRS2Q9HD23 443 aa18.09■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.09■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.09■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
TMOD1-202ENST00000375175 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.08■□□□□ 0.48
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.06■□□□□ 0.48
TMOD1-202ENST00000375175 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.06■□□□□ 0.48
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.06■□□□□ 0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.05■□□□□ 0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ADGRL2O95490 1459 aa18.04■□□□□ 0.48
TMOD1-202ENST00000375175 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
TMOD1-202ENST00000375175 NUP160Q12769 1436 aa18.03■□□□□ 0.48
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.03■□□□□ 0.48
TMOD1-202ENST00000375175 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TMOD1-202ENST00000375175 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.02■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 TSPY4P0CV99 314 aa18.01■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 TSPY10P0CW01 314 aa18.01■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 NUP155O75694 1391 aa18■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 USP47Q96K76 1375 aa17.99■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ATP10BO94823 1461 aa17.98■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.97■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.97■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.97■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 MBD5Q9P267 1494 aa17.97■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ABCA8O94911 1581 aa17.96■□□□□ 0.47
TMOD1-202ENST00000375175 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.95■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.95■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.94■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.93■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.92■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.91■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 ERICH6BQ5W0A0 696 aa17.91■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 KIF15Q9NS87 1388 aa17.91■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 PTPRGP23470 1445 aa17.9■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 PPP4R2Q9NY27 417 aa17.9■□□□□ 0.46
TMOD1-202ENST00000375175 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.89■□□□□ 0.45
TMOD1-202ENST00000375175 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
TMOD1-202ENST00000375175 KDM5CP41229 1560 aa17.88■□□□□ 0.45
TMOD1-202ENST00000375175 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.86■□□□□ 0.45
TMOD1-202ENST00000375175 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.85■□□□□ 0.45
TMOD1-202ENST00000375175 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa17.84■□□□□ 0.45
TMOD1-202ENST00000375175 NBR1Q14596 966 aa17.84■□□□□ 0.45
TMOD1-202ENST00000375175 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.83■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.82■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.82■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 TMC1Q8TDI8 760 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms