RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363509.1

RN7SKP45-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 45, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP45, Length 304 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP45-201ENST00000363509 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.14■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 KIF14Q15058 1648 aa15.11■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.11■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.11■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.11■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.1■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.09■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.09■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 MLECQ14165 292 aa15.09■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.09■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 ATP10AO60312 1499 aa15.08■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.08■□□□□ 0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.08■□□□□ 0
RN7SKP45-201ENST00000363509 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
RN7SKP45-201ENST00000363509 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.07■□□□□ 0
RN7SKP45-201ENST00000363509 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.07■□□□□ 0
RN7SKP45-201ENST00000363509 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.04■□□□□ -0
RN7SKP45-201ENST00000363509 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
RN7SKP45-201ENST00000363509 HSPA2P54652 639 aa15.02■□□□□ -0
RN7SKP45-201ENST00000363509 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.02□□□□□ -0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 CHIC1Q5VXU3 224 aa15□□□□□ -0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15□□□□□ -0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 KDM5CP41229 1560 aa14.99□□□□□ -0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.98□□□□□ -0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 AFAP1Q8N556 730 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 REREQ9P2R6 1566 aa14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP45-201ENST00000363509 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 CERKQ8TCT0 537 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 PREX2Q70Z35 1606 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 ABCC1P33527 1531 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 AGLP35573 1532 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 ABCA6Q8N139 1617 aa14.9□□□□□ -0.02
RN7SKP45-201ENST00000363509 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.88□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.85□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.85□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 C3P01024 1663 aa14.84□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.84□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 PTPRTO14522 1441 aa14.83□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.83□□□□□ -0.03
RN7SKP45-201ENST00000363509 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 NPATQ14207 1427 aa14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 MROH2AA6NES4 1674 aa14.8□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 STRCQ7RTU9 1775 aa14.8□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 ATP7AQ04656 1500 aa14.79□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 A2MP01023 1474 aa14.77□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 NCOA1Q15788 1441 aa14.77□□□□□ -0.04
RN7SKP45-201ENST00000363509 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.77□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 ZMYM3Q14202 1370 aa14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.75□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 PKD2Q13563 968 aa14.73□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 GGT6Q6P531 493 aa14.73□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.73□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.73□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.72□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 PLXNC1O60486 1568 aa14.72□□□□□ -0.05
RN7SKP45-201ENST00000363509 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 PLA2R1Q13018 1463 aa14.7□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 CEP162Q5TB80 1403 aa14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 TIAM1Q13009 1591 aa14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 PTPRKQ15262 1439 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP45-201ENST00000363509 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP45-201ENST00000363509 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP45-201ENST00000363509 MBD5Q9P267 1494 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP45-201ENST00000363509 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP45-201ENST00000363509 TSPY4P0CV99 314 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP45-201ENST00000363509 TSPY10P0CW01 314 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP45-201ENST00000363509 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP45-201ENST00000363509 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms