RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360274.8

PRKAR1B-201, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1B, Length 2,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1B-201ENST00000360274 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.4■■■■■ 4.22
PRKAR1B-201ENST00000360274 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.39■■■■■ 4.22
PRKAR1B-201ENST00000360274 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
PRKAR1B-201ENST00000360274 ROCK1Q13464 1354 aa41.31■■■■■ 4.2
PRKAR1B-201ENST00000360274 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
PRKAR1B-201ENST00000360274 KDM6BO15054 1643 aa41.29■■■■■ 4.2
PRKAR1B-201ENST00000360274 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.27■■■■■ 4.2
PRKAR1B-201ENST00000360274 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.27■■■■■ 4.2
PRKAR1B-201ENST00000360274 OSCARQ8IYS5 282 aa41.25■■■■■ 4.19
PRKAR1B-201ENST00000360274 PREX2Q70Z35 1606 aa41.24■■■■■ 4.19
PRKAR1B-201ENST00000360274 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.21■■■■■ 4.19
PRKAR1B-201ENST00000360274 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.21■■■■■ 4.19
PRKAR1B-201ENST00000360274 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.21■■■■■ 4.19
PRKAR1B-201ENST00000360274 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.19■■■■■ 4.18
PRKAR1B-201ENST00000360274 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.18
PRKAR1B-201ENST00000360274 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.11■■■■■ 4.17
PRKAR1B-201ENST00000360274 ADGRL2O95490 1459 aa41.11■■■■■ 4.17
PRKAR1B-201ENST00000360274 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.1■■■■■ 4.17
PRKAR1B-201ENST00000360274 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.08■■■■■ 4.17
PRKAR1B-201ENST00000360274 NCOA1Q15788 1441 aa41.07■■■■■ 4.17
PRKAR1B-201ENST00000360274 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.06■■■■■ 4.16
PRKAR1B-201ENST00000360274 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.05■■■■■ 4.16
PRKAR1B-201ENST00000360274 NEUROD1Q13562 356 aa41.03■■■■■ 4.16
PRKAR1B-201ENST00000360274 KCNH8Q96L42 1107 aa41.03■■■■■ 4.16
PRKAR1B-201ENST00000360274 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.02■■■■■ 4.16
PRKAR1B-201ENST00000360274 TRIM52Q96A61 297 aa41.01■■■■■ 4.16
PRKAR1B-201ENST00000360274 MBD5Q9P267 1494 aa41■■■■■ 4.15
PRKAR1B-201ENST00000360274 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
PRKAR1B-201ENST00000360274 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.98■■■■■ 4.15
PRKAR1B-201ENST00000360274 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.97■■■■■ 4.15
PRKAR1B-201ENST00000360274 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
PRKAR1B-201ENST00000360274 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.96■■■■■ 4.151e-6■■■■□ 21.7
PRKAR1B-201ENST00000360274 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.93■■■■■ 4.14
PRKAR1B-201ENST00000360274 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.91■■■■■ 4.14
PRKAR1B-201ENST00000360274 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.9■■■■■ 4.14
PRKAR1B-201ENST00000360274 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.88■■■■■ 4.14
PRKAR1B-201ENST00000360274 PLCH2O75038 1416 aa40.88■■■■■ 4.14
PRKAR1B-201ENST00000360274 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.88■■■■■ 4.14
PRKAR1B-201ENST00000360274 TSPY4P0CV99 314 aa40.88■■■■■ 4.13
PRKAR1B-201ENST00000360274 TSPY10P0CW01 314 aa40.88■■■■■ 4.13
PRKAR1B-201ENST00000360274 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
PRKAR1B-201ENST00000360274 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.83■■■■■ 4.13
PRKAR1B-201ENST00000360274 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.82■■■■■ 4.13
PRKAR1B-201ENST00000360274 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.8■■■■■ 4.12
PRKAR1B-201ENST00000360274 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.8■■■■■ 4.12
PRKAR1B-201ENST00000360274 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.76■■■■■ 4.12
PRKAR1B-201ENST00000360274 TONSLQ96HA7 1378 aa40.75■■■■■ 4.11
PRKAR1B-201ENST00000360274 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.73■■■■■ 4.11
PRKAR1B-201ENST00000360274 PZPP20742 1482 aa40.73■■■■■ 4.11
PRKAR1B-201ENST00000360274 ASXL2Q76L83 1435 aa40.73■■■■■ 4.11
PRKAR1B-201ENST00000360274 KIF15Q9NS87 1388 aa40.73■■■■■ 4.11
PRKAR1B-201ENST00000360274 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.72■■■■■ 4.11
PRKAR1B-201ENST00000360274 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.72■■■■■ 4.11
PRKAR1B-201ENST00000360274 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.71■■■■■ 4.11
PRKAR1B-201ENST00000360274 ABCC1P33527 1531 aa40.7■■■■■ 4.11
PRKAR1B-201ENST00000360274 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
PRKAR1B-201ENST00000360274 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
PRKAR1B-201ENST00000360274 FOXD1Q16676 465 aa40.67■■■■■ 4.1
PRKAR1B-201ENST00000360274 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.62■■■■■ 4.09
PRKAR1B-201ENST00000360274 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.09
PRKAR1B-201ENST00000360274 PLXNC1O60486 1568 aa40.61■■■■■ 4.09
PRKAR1B-201ENST00000360274 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.57■■■■■ 4.08
PRKAR1B-201ENST00000360274 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.53■■■■■ 4.08
PRKAR1B-201ENST00000360274 FANCAO15360 1455 aa40.51■■■■■ 4.08
PRKAR1B-201ENST00000360274 NUP155O75694 1391 aa40.51■■■■■ 4.07
PRKAR1B-201ENST00000360274 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
PRKAR1B-201ENST00000360274 PKD2Q13563 968 aa40.43■■■■■ 4.06
PRKAR1B-201ENST00000360274 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.42■■■■■ 4.06
PRKAR1B-201ENST00000360274 UNC13BO14795 1591 aa40.4■■■■■ 4.06
PRKAR1B-201ENST00000360274 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.37■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.37■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.37■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.35■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 ADGRL1O94910 1474 aa40.35■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.34■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 AFAP1Q8N556 730 aa40.34■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.34■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 ERBINQ96RT1 1412 aa40.33■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.32■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.32■■■■■ 4.05
PRKAR1B-201ENST00000360274 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.29■■■■■ 4.04
PRKAR1B-201ENST00000360274 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
PRKAR1B-201ENST00000360274 CD109Q6YHK3 1445 aa40.26■■■■■ 4.04
PRKAR1B-201ENST00000360274 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.25■■■■■ 4.03
PRKAR1B-201ENST00000360274 ATP7AQ04656 1500 aa40.24■■■■■ 4.03
PRKAR1B-201ENST00000360274 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.24■■■■■ 4.03
PRKAR1B-201ENST00000360274 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.24■■■■■ 4.03
PRKAR1B-201ENST00000360274 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.23■■■■■ 4.03
PRKAR1B-201ENST00000360274 MIER1Q8N108 512 aa40.18■■■■■ 4.02
PRKAR1B-201ENST00000360274 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.023e-7■□□□□ 9.7
PRKAR1B-201ENST00000360274 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
PRKAR1B-201ENST00000360274 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.1■■■■■ 4.01
PRKAR1B-201ENST00000360274 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.06■■■■■ 4
PRKAR1B-201ENST00000360274 NBPF8Q3BBV2 869 aa40.04■■■■■ 4
PRKAR1B-201ENST00000360274 DEPDC5O75140 1603 aa40.04■■■■■ 4
PRKAR1B-201ENST00000360274 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.03■■■■■ 4
PRKAR1B-201ENST00000360274 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.03■■■■■ 4
PRKAR1B-201ENST00000360274 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.01■■■■■ 4
PRKAR1B-201ENST00000360274 KDM5CP41229 1560 aa40.01■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms