RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 CCER2I3L3R5 266 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF3BO15066 747 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4-201ENST00000344528 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-201ENST00000344528 STK26Q9P289 416 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.974e-7■■■■□ 21.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-201ENST00000344528 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-201ENST00000344528 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-201ENST00000344528 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4-201ENST00000344528 SOX12O15370 315 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-201ENST00000344528 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS3P49796 1198 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 RALBP1Q15311 655 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPRGP23470 1445 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 NPHP1O15259 732 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 EID1Q9Y6B2 187 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4-201ENST00000344528 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 OSCARQ8IYS5 282 aa20.89■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.89■□□□□ 0.94
SH3BP4-201ENST00000344528 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 IGF1RP08069 1367 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 NCAPD3P42695 1498 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNJ4P48050 445 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 FGD1P98174 961 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA2Q08379 1002 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP44Q96MT7 982 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 NLRP13Q86W25 1043 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 UACAQ9BZF9 1416 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP4-201ENST00000344528 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP4-201ENST00000344528 MCCP23508 829 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 STK31Q9BXU1 1019 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 HSCBQ8IWL3 235 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE3BQ13370 1112 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 AMPHP49418 695 aa20.7■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF15Q9NS87 1388 aa20.7■□□□□ 0.91
SH3BP4-201ENST00000344528 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-201ENST00000344528 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-201ENST00000344528 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-201ENST00000344528 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-201ENST00000344528 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4-201ENST00000344528 EVC2Q86UK5 1308 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4-201ENST00000344528 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.91e-8■■□□□ 14.2
SH3BP4-201ENST00000344528 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 40.5
SH3BP4-201ENST00000344528 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4-201ENST00000344528 APBB1O00213 710 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 PANK3Q9H999 370 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 NUTM2FA1L443 756 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 STAC3Q96MF2 364 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 GRIN2BQ13224 1484 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 CUX1P39880 1505 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 HMMRO75330 724 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 USP47Q96K76 1375 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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