RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344079.9

LRRC27-201, Transcript of leucine rich repeat containing 27, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene LRRC27, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27-201ENST00000344079 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
LRRC27-201ENST00000344079 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
LRRC27-201ENST00000344079 DAPK1P53355 1430 aa27.29■■□□□ 1.96
LRRC27-201ENST00000344079 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 ABCC5O15440 1437 aa27.25■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 NAIPQ13075 1403 aa27.25■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 AKNAQ7Z591 1439 aa27.25■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.25■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.24■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 PREX2Q70Z35 1606 aa27.24■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.22■■□□□ 1.95
LRRC27-201ENST00000344079 KCNH8Q96L42 1107 aa27.2■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.19■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.19■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 ROCK1Q13464 1354 aa27.18■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.17■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.17■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 ASXL2Q76L83 1435 aa27.16■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.16■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.14■■□□□ 1.94
LRRC27-201ENST00000344079 MAPKBP1O60336 1514 aa27.14■■□□□ 1.93
LRRC27-201ENST00000344079 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.13■■□□□ 1.93
LRRC27-201ENST00000344079 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.12■■□□□ 1.93
LRRC27-201ENST00000344079 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.08■■□□□ 1.93
LRRC27-201ENST00000344079 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.08■■□□□ 1.93
LRRC27-201ENST00000344079 PLCH2O75038 1416 aa27.08■■□□□ 1.93
LRRC27-201ENST00000344079 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.07■■□□□ 1.92
LRRC27-201ENST00000344079 ADGRL2O95490 1459 aa27.07■■□□□ 1.92
LRRC27-201ENST00000344079 MBD5Q9P267 1494 aa27.06■■□□□ 1.92
LRRC27-201ENST00000344079 KDM6BO15054 1643 aa27.04■■□□□ 1.92
LRRC27-201ENST00000344079 NCOA1Q15788 1441 aa27.04■■□□□ 1.92
LRRC27-201ENST00000344079 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
LRRC27-201ENST00000344079 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.02■■□□□ 1.92
LRRC27-201ENST00000344079 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.01■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.01■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.01■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.01■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.01■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 SYCP2Q9BX26 1530 aa27■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 RSPH4AQ5TD94 716 aa27■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.99■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 TSPY4P0CV99 314 aa26.98■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 TSPY10P0CW01 314 aa26.98■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 DIP2BQ9P265 1576 aa26.96■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
LRRC27-201ENST00000344079 ABCC1P33527 1531 aa26.92■■□□□ 1.9
LRRC27-201ENST00000344079 TRIM52Q96A61 297 aa26.91■■□□□ 1.9
LRRC27-201ENST00000344079 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.91■■□□□ 1.9
LRRC27-201ENST00000344079 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.9■■□□□ 1.9
LRRC27-201ENST00000344079 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.89■■□□□ 1.9
LRRC27-201ENST00000344079 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.88■■□□□ 1.89
LRRC27-201ENST00000344079 GLI2P10070 1586 aa26.87■■□□□ 1.89
LRRC27-201ENST00000344079 FANCAO15360 1455 aa26.86■■□□□ 1.89
LRRC27-201ENST00000344079 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.86■■□□□ 1.89
LRRC27-201ENST00000344079 KIF15Q9NS87 1388 aa26.85■■□□□ 1.89
LRRC27-201ENST00000344079 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.83■■□□□ 1.89
LRRC27-201ENST00000344079 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
LRRC27-201ENST00000344079 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
LRRC27-201ENST00000344079 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.81■■□□□ 1.88
LRRC27-201ENST00000344079 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.81■■□□□ 1.88
LRRC27-201ENST00000344079 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.8■■□□□ 1.88
LRRC27-201ENST00000344079 TSPOAP1O95153 1857 aa26.8■■□□□ 1.88
LRRC27-201ENST00000344079 CD109Q6YHK3 1445 aa26.8■■□□□ 1.88
LRRC27-201ENST00000344079 PLXNC1O60486 1568 aa26.8■■□□□ 1.88
LRRC27-201ENST00000344079 NEUROD1Q13562 356 aa26.76■■□□□ 1.88
LRRC27-201ENST00000344079 ADGRL1O94910 1474 aa26.75■■□□□ 1.87
LRRC27-201ENST00000344079 PZPP20742 1482 aa26.73■■□□□ 1.87
LRRC27-201ENST00000344079 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC27-201ENST00000344079 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.72■■□□□ 1.87
LRRC27-201ENST00000344079 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.71■■□□□ 1.87
LRRC27-201ENST00000344079 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
LRRC27-201ENST00000344079 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.7■■□□□ 1.87
LRRC27-201ENST00000344079 AFAP1Q8N556 730 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRC27-201ENST00000344079 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
LRRC27-201ENST00000344079 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
LRRC27-201ENST00000344079 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRC27-201ENST00000344079 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.68■■□□□ 1.86
LRRC27-201ENST00000344079 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.68■■□□□ 1.86
LRRC27-201ENST00000344079 NUP155O75694 1391 aa26.65■■□□□ 1.86
LRRC27-201ENST00000344079 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.64■■□□□ 1.86
LRRC27-201ENST00000344079 FOXD1Q16676 465 aa26.64■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 ERBINQ96RT1 1412 aa26.64■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 TONSLQ96HA7 1378 aa26.62■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.62■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 ATP7AQ04656 1500 aa26.62■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 NEO1Q92859 1461 aa26.61■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 UNC13BO14795 1591 aa26.6■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.6■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
LRRC27-201ENST00000344079 PKD2Q13563 968 aa26.56■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.56■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.54■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 KDM5CP41229 1560 aa26.53■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.52■■□□□ 1.84
LRRC27-201ENST00000344079 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
LRRC27-201ENST00000344079 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms