RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343916.7

COL9A3-201, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL9A3, Length 2,485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL9A3-201ENST00000343916 CCDC184Q52MB2 194 aa26.87■■□□□ 1.89
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COL9A3-201ENST00000343916 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.76■■□□□ 1.87
COL9A3-201ENST00000343916 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.74■■□□□ 1.87
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COL9A3-201ENST00000343916 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
COL9A3-201ENST00000343916 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.71■■□□□ 1.87
COL9A3-201ENST00000343916 MRS2Q9HD23 443 aa26.71■■□□□ 1.87
COL9A3-201ENST00000343916 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.71■■□□□ 1.87
COL9A3-201ENST00000343916 OSCARQ8IYS5 282 aa26.7■■□□□ 1.86
COL9A3-201ENST00000343916 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.7■■□□□ 1.86
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COL9A3-201ENST00000343916 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.67■■□□□ 1.86
COL9A3-201ENST00000343916 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.66■■□□□ 1.86
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