RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343318.9

LRRD1-201, Transcript of leucine rich repeats and death domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRD1, Length 2,073 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1-201ENST00000343318 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.86■■□□□ 1.73
LRRD1-201ENST00000343318 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
LRRD1-201ENST00000343318 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
LRRD1-201ENST00000343318 KDM6BO15054 1643 aa25.85■■□□□ 1.73
LRRD1-201ENST00000343318 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.84■■□□□ 1.73
LRRD1-201ENST00000343318 ROCK1Q13464 1354 aa25.79■■□□□ 1.72
LRRD1-201ENST00000343318 NEUROD1Q13562 356 aa25.77■■□□□ 1.72
LRRD1-201ENST00000343318 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.74■■□□□ 1.71
LRRD1-201ENST00000343318 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
LRRD1-201ENST00000343318 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
LRRD1-201ENST00000343318 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.71■■□□□ 1.71
LRRD1-201ENST00000343318 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.7■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.7■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.7■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 TRIM52Q96A61 297 aa25.69■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 OSCARQ8IYS5 282 aa25.68■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 NCOA1Q15788 1441 aa25.68■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 PREX2Q70Z35 1606 aa25.68■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 KCNH8Q96L42 1107 aa25.67■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.65■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 ADGRL2O95490 1459 aa25.64■■□□□ 1.7
LRRD1-201ENST00000343318 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.64■■□□□ 1.69
LRRD1-201ENST00000343318 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.69
LRRD1-201ENST00000343318 MBD5Q9P267 1494 aa25.61■■□□□ 1.69
LRRD1-201ENST00000343318 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.61■■□□□ 1.69
LRRD1-201ENST00000343318 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.59■■□□□ 1.69
LRRD1-201ENST00000343318 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.59■■□□□ 1.69
LRRD1-201ENST00000343318 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.58■■□□□ 1.69
LRRD1-201ENST00000343318 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.58■■□□□ 1.69
LRRD1-201ENST00000343318 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.58■■□□□ 1.69
LRRD1-201ENST00000343318 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.57■■□□□ 1.68
LRRD1-201ENST00000343318 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.56■■□□□ 1.68
LRRD1-201ENST00000343318 FOXD1Q16676 465 aa25.55■■□□□ 1.68
LRRD1-201ENST00000343318 TSPY4P0CV99 314 aa25.54■■□□□ 1.68
LRRD1-201ENST00000343318 TSPY10P0CW01 314 aa25.54■■□□□ 1.68
LRRD1-201ENST00000343318 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.52■■□□□ 1.68
LRRD1-201ENST00000343318 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
LRRD1-201ENST00000343318 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.51■■□□□ 1.67
LRRD1-201ENST00000343318 TONSLQ96HA7 1378 aa25.51■■□□□ 1.67
LRRD1-201ENST00000343318 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.5■■□□□ 1.67
LRRD1-201ENST00000343318 PLCH2O75038 1416 aa25.49■■□□□ 1.67
LRRD1-201ENST00000343318 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
LRRD1-201ENST00000343318 PZPP20742 1482 aa25.47■■□□□ 1.67
LRRD1-201ENST00000343318 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
LRRD1-201ENST00000343318 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.46■■□□□ 1.67
LRRD1-201ENST00000343318 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.45■■□□□ 1.66
LRRD1-201ENST00000343318 KIF15Q9NS87 1388 aa25.45■■□□□ 1.66
LRRD1-201ENST00000343318 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.44■■□□□ 1.66
LRRD1-201ENST00000343318 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.43■■□□□ 1.66
LRRD1-201ENST00000343318 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.43■■□□□ 1.66
LRRD1-201ENST00000343318 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.4■■□□□ 1.66
LRRD1-201ENST00000343318 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.4■■□□□ 1.66
LRRD1-201ENST00000343318 ASXL2Q76L83 1435 aa25.39■■□□□ 1.65
LRRD1-201ENST00000343318 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.37■■□□□ 1.65
LRRD1-201ENST00000343318 ABCC1P33527 1531 aa25.35■■□□□ 1.65
LRRD1-201ENST00000343318 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
LRRD1-201ENST00000343318 NUP155O75694 1391 aa25.34■■□□□ 1.65
LRRD1-201ENST00000343318 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.33■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.32■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 PKD2Q13563 968 aa25.32■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 MIER1Q8N108 512 aa25.32■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.32■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.29■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.29■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 PLXNC1O60486 1568 aa25.28■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
LRRD1-201ENST00000343318 FANCAO15360 1455 aa25.26■■□□□ 1.63
LRRD1-201ENST00000343318 AFAP1Q8N556 730 aa25.24■■□□□ 1.63
LRRD1-201ENST00000343318 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.23■■□□□ 1.63
LRRD1-201ENST00000343318 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRD1-201ENST00000343318 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRD1-201ENST00000343318 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
LRRD1-201ENST00000343318 UNC13BO14795 1591 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRD1-201ENST00000343318 ADGRL1O94910 1474 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRD1-201ENST00000343318 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRD1-201ENST00000343318 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
LRRD1-201ENST00000343318 ERBINQ96RT1 1412 aa25.14■■□□□ 1.62
LRRD1-201ENST00000343318 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.14■■□□□ 1.62
LRRD1-201ENST00000343318 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.14■■□□□ 1.61
LRRD1-201ENST00000343318 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.14■■□□□ 1.61
LRRD1-201ENST00000343318 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRD1-201ENST00000343318 CD109Q6YHK3 1445 aa25.1■■□□□ 1.61
LRRD1-201ENST00000343318 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.08■■□□□ 1.61
LRRD1-201ENST00000343318 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
LRRD1-201ENST00000343318 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
LRRD1-201ENST00000343318 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
LRRD1-201ENST00000343318 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.08■■□□□ 1.61
LRRD1-201ENST00000343318 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
LRRD1-201ENST00000343318 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
LRRD1-201ENST00000343318 ATP7AQ04656 1500 aa25.08■■□□□ 1.6
LRRD1-201ENST00000343318 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
LRRD1-201ENST00000343318 PLA2R1Q13018 1463 aa25.02■■□□□ 1.6
LRRD1-201ENST00000343318 MYT1LQ9UL68 1186 aa25■■□□□ 1.59
LRRD1-201ENST00000343318 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
LRRD1-201ENST00000343318 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.97■■□□□ 1.59
LRRD1-201ENST00000343318 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms