RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 NEFLP07196 543 aa31.52■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 GRIN2AQ12879 1464 aa31.52■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.51■■■□□ 2.63
HOXD1-201ENST00000331462 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.5■■■□□ 2.63
HOXD1-201ENST00000331462 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXD1-201ENST00000331462 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXD1-201ENST00000331462 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
HOXD1-201ENST00000331462 NCOA1Q15788 1441 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXD1-201ENST00000331462 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.45■■■□□ 2.62
HOXD1-201ENST00000331462 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXD1-201ENST00000331462 BCANQ96GW7 911 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD1-201ENST00000331462 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
HOXD1-201ENST00000331462 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXD1-201ENST00000331462 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
HOXD1-201ENST00000331462 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.39■■■□□ 2.61
HOXD1-201ENST00000331462 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
HOXD1-201ENST00000331462 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC7Q96M83 1385 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXD1-201ENST00000331462 ARID3CA6NKF2 412 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRL2O95490 1459 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXD1-201ENST00000331462 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXD1-201ENST00000331462 PZPP20742 1482 aa31.33■■■□□ 2.61
HOXD1-201ENST00000331462 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.33■■■□□ 2.61
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
HOXD1-201ENST00000331462 FOXD1Q16676 465 aa31.3■■■□□ 2.6
HOXD1-201ENST00000331462 CEP170Q5SW79 1584 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXD1-201ENST00000331462 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
HOXD1-201ENST00000331462 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
HOXD1-201ENST00000331462 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.28■■■□□ 2.6
HOXD1-201ENST00000331462 SYNJ2O15056 1496 aa31.27■■■□□ 2.6
HOXD1-201ENST00000331462 MBD5Q9P267 1494 aa31.27■■■□□ 2.6
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.27■■■□□ 2.6
HOXD1-201ENST00000331462 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
HOXD1-201ENST00000331462 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
HOXD1-201ENST00000331462 KIF14Q15058 1648 aa31.23■■■□□ 2.59
HOXD1-201ENST00000331462 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXD1-201ENST00000331462 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
HOXD1-201ENST00000331462 NUP160Q12769 1436 aa31.2■■■□□ 2.58
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXD1-201ENST00000331462 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
HOXD1-201ENST00000331462 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD1-201ENST00000331462 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXD1-201ENST00000331462 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXD1-201ENST00000331462 ERICH6BQ5W0A0 696 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD1-201ENST00000331462 ABCA8O94911 1581 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC184Q52MB2 194 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXD1-201ENST00000331462 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
HOXD1-201ENST00000331462 ANP32EQ9BTT0 268 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD1-201ENST00000331462 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD1-201ENST00000331462 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD1-201ENST00000331462 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXD1-201ENST00000331462 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
HOXD1-201ENST00000331462 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXD1-201ENST00000331462 KDM5CP41229 1560 aa31.02■■■□□ 2.56
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.01■■■□□ 2.56
HOXD1-201ENST00000331462 MRS2Q9HD23 443 aa31.01■■■□□ 2.56
HOXD1-201ENST00000331462 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
HOXD1-201ENST00000331462 JPH4Q96JJ6 628 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXD1-201ENST00000331462 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
HOXD1-201ENST00000331462 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.99■■■□□ 2.55
HOXD1-201ENST00000331462 USP47Q96K76 1375 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXD1-201ENST00000331462 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXD1-201ENST00000331462 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.97■■■□□ 2.55
HOXD1-201ENST00000331462 PKD2Q13563 968 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXD1-201ENST00000331462 ATP10BO94823 1461 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.95■■■□□ 2.55
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRGP23470 1445 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD1-201ENST00000331462 FAM9BQ8IZU0 186 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD1-201ENST00000331462 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD1-201ENST00000331462 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
HOXD1-201ENST00000331462 NUP155O75694 1391 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD1-201ENST00000331462 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
HOXD1-201ENST00000331462 FBLN2P98095 1184 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD1-201ENST00000331462 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXD1-201ENST00000331462 KIF15Q9NS87 1388 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD1-201ENST00000331462 PREX2Q70Z35 1606 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD1-201ENST00000331462 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.76■■■□□ 2.52
HOXD1-201ENST00000331462 TSPY4P0CV99 314 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD1-201ENST00000331462 TSPY10P0CW01 314 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD1-201ENST00000331462 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
HOXD1-201ENST00000331462 E9PCH4 1651 aa30.71■■■□□ 2.51
HOXD1-201ENST00000331462 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.71■■■□□ 2.51
HOXD1-201ENST00000331462 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.7■■■□□ 2.5
HOXD1-201ENST00000331462 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
HOXD1-201ENST00000331462 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.69■■■□□ 2.5
HOXD1-201ENST00000331462 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.68■■■□□ 2.5
HOXD1-201ENST00000331462 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXD1-201ENST00000331462 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD1-201ENST00000331462 UNC13BO14795 1591 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXD1-201ENST00000331462 NUDCQ9Y266 331 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXD1-201ENST00000331462 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.49
HOXD1-201ENST00000331462 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.61■■■□□ 2.49
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