RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328834.9

CNOT10-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT10, Length 2,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-201ENST00000328834 CCDC7Q96M83 1385 aa20.46■□□□□ 0.87
CNOT10-201ENST00000328834 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.45■□□□□ 0.86
CNOT10-201ENST00000328834 ARHGEF11O15085 1522 aa20.45■□□□□ 0.86
CNOT10-201ENST00000328834 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.45■□□□□ 0.86
CNOT10-201ENST00000328834 FBLN2P98095 1184 aa20.43■□□□□ 0.86
CNOT10-201ENST00000328834 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CNOT10-201ENST00000328834 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CNOT10-201ENST00000328834 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CNOT10-201ENST00000328834 IQGAP2Q13576 1575 aa20.39■□□□□ 0.85
CNOT10-201ENST00000328834 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.39■□□□□ 0.85
CNOT10-201ENST00000328834 HECW1Q76N89 1606 aa20.39■□□□□ 0.85
CNOT10-201ENST00000328834 ABCC5O15440 1437 aa20.38■□□□□ 0.85
CNOT10-201ENST00000328834 DAPK1P53355 1430 aa20.37■□□□□ 0.85
CNOT10-201ENST00000328834 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.37■□□□□ 0.85
CNOT10-201ENST00000328834 NCOA1Q15788 1441 aa20.36■□□□□ 0.85
CNOT10-201ENST00000328834 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CNOT10-201ENST00000328834 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.35■□□□□ 0.85
CNOT10-201ENST00000328834 WDR62O43379 1518 aa20.35■□□□□ 0.85
CNOT10-201ENST00000328834 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 PBRM1Q86U86 1689 aa20.33■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 AKNAQ7Z591 1439 aa20.32■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 PKD2Q13563 968 aa20.31■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.3■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.3■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 MIA2Q96PC5 1412 aa20.29■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 ADAMTS12P58397 1594 aa20.27■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 BCL11AQ9H165 835 aa20.27■□□□□ 0.84
CNOT10-201ENST00000328834 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.26■□□□□ 0.83
CNOT10-201ENST00000328834 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.25■□□□□ 0.83
CNOT10-201ENST00000328834 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.25■□□□□ 0.83
CNOT10-201ENST00000328834 DISP1Q96F81 1524 aa20.24■□□□□ 0.83
CNOT10-201ENST00000328834 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.24■□□□□ 0.83
CNOT10-201ENST00000328834 USP47Q96K76 1375 aa20.23■□□□□ 0.83
CNOT10-201ENST00000328834 PZPP20742 1482 aa20.22■□□□□ 0.83
CNOT10-201ENST00000328834 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.19■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 KIF14Q15058 1648 aa20.17■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 KIAA0556O60303 1618 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 ROCK1Q13464 1354 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.16■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.15■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 NBR1Q14596 966 aa20.14■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 RGL3Q3MIN7 710 aa20.14■□□□□ 0.82
CNOT10-201ENST00000328834 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.14■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 TMC1Q8TDI8 760 aa20.14■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 NUP155O75694 1391 aa20.13■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.12■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.11■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.11■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.09■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 NUDCQ9Y266 331 aa20.09■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.818e-6■□□□□ 8.2
CNOT10-201ENST00000328834 GRIN2AQ12879 1464 aa20.08■□□□□ 0.81
CNOT10-201ENST00000328834 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CNOT10-201ENST00000328834 JPH4Q96JJ6 628 aa20.07■□□□□ 0.8
CNOT10-201ENST00000328834 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.07■□□□□ 0.8
CNOT10-201ENST00000328834 SKAP1Q86WV1 359 aa20.06■□□□□ 0.8
CNOT10-201ENST00000328834 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.04■□□□□ 0.8
CNOT10-201ENST00000328834 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.03■□□□□ 0.8
CNOT10-201ENST00000328834 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.03■□□□□ 0.8
CNOT10-201ENST00000328834 MBD5Q9P267 1494 aa20.02■□□□□ 0.8
CNOT10-201ENST00000328834 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 IFT140Q96RY7 1462 aa20■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 TSPY4P0CV99 314 aa19.99■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 TSPY10P0CW01 314 aa19.99■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.99■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.99■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 CEP170Q5SW79 1584 aa19.99■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 KDM5CP41229 1560 aa19.98■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 PLIN1O60240 522 aa19.98■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.97■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CNOT10-201ENST00000328834 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CNOT10-201ENST00000328834 KIF15Q9NS87 1388 aa19.94■□□□□ 0.78
CNOT10-201ENST00000328834 ERCC6Q03468 1493 aa19.94■□□□□ 0.78
CNOT10-201ENST00000328834 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CNOT10-201ENST00000328834 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CNOT10-201ENST00000328834 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.9■□□□□ 0.78
CNOT10-201ENST00000328834 ATP10BO94823 1461 aa19.9■□□□□ 0.78
CNOT10-201ENST00000328834 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CNOT10-201ENST00000328834 ADGRL2O95490 1459 aa19.88■□□□□ 0.77
CNOT10-201ENST00000328834 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.87■□□□□ 0.77
CNOT10-201ENST00000328834 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.87■□□□□ 0.77
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