RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
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GINS3-202ENST00000328514 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.4■□□□□ 0.06
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GINS3-202ENST00000328514 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.39■□□□□ 0.05
GINS3-202ENST00000328514 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.37■□□□□ 0.05
GINS3-202ENST00000328514 MRS2Q9HD23 443 aa15.36■□□□□ 0.05
GINS3-202ENST00000328514 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
GINS3-202ENST00000328514 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.34■□□□□ 0.05
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GINS3-202ENST00000328514 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.32■□□□□ 0.04
GINS3-202ENST00000328514 TOPBP1Q92547 1522 aa15.32■□□□□ 0.04
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GINS3-202ENST00000328514 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.31■□□□□ 0.04
GINS3-202ENST00000328514 MIA2Q96PC5 1412 aa15.31■□□□□ 0.04
GINS3-202ENST00000328514 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.31■□□□□ 0.04
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GINS3-202ENST00000328514 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
GINS3-202ENST00000328514 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.3■□□□□ 0.04
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GINS3-202ENST00000328514 KDM6BO15054 1643 aa15.29■□□□□ 0.04
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GINS3-202ENST00000328514 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.29■□□□□ 0.04
GINS3-202ENST00000328514 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.28■□□□□ 0.04
GINS3-202ENST00000328514 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
GINS3-202ENST00000328514 ROCK1Q13464 1354 aa15.26■□□□□ 0.03
GINS3-202ENST00000328514 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
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GINS3-202ENST00000328514 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
GINS3-202ENST00000328514 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.22■□□□□ 0.03
GINS3-202ENST00000328514 NBR1Q14596 966 aa15.21■□□□□ 0.02
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GINS3-202ENST00000328514 MBD5Q9P267 1494 aa15.19■□□□□ 0.02
GINS3-202ENST00000328514 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
GINS3-202ENST00000328514 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
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GINS3-202ENST00000328514 USP35Q9P2H5 1018 aa15.17■□□□□ 0.02
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GINS3-202ENST00000328514 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
GINS3-202ENST00000328514 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
GINS3-202ENST00000328514 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
GINS3-202ENST00000328514 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
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GINS3-202ENST00000328514 DAPK1P53355 1430 aa15.15■□□□□ 0.02
GINS3-202ENST00000328514 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
GINS3-202ENST00000328514 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.14■□□□□ 0.01
GINS3-202ENST00000328514 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
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GINS3-202ENST00000328514 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.13■□□□□ 0.01
GINS3-202ENST00000328514 KIF14Q15058 1648 aa15.12■□□□□ 0.01
GINS3-202ENST00000328514 ABCC5O15440 1437 aa15.11■□□□□ 0.01
GINS3-202ENST00000328514 KDM5CP41229 1560 aa15.11■□□□□ 0.01
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GINS3-202ENST00000328514 CHD1O14646 1710 aa15.11■□□□□ 0.01
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GINS3-202ENST00000328514 PZPP20742 1482 aa15.09■□□□□ 0.01
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GINS3-202ENST00000328514 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
GINS3-202ENST00000328514 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
GINS3-202ENST00000328514 KIF15Q9NS87 1388 aa15.06■□□□□ 0
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GINS3-202ENST00000328514 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.05■□□□□ -0
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GINS3-202ENST00000328514 ADGBQ8N7X0 1667 aa15□□□□□ -0.01
GINS3-202ENST00000328514 FBLN2P98095 1184 aa15□□□□□ -0.01
GINS3-202ENST00000328514 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GINS3-202ENST00000328514 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS3-202ENST00000328514 NEFMP07197 916 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS3-202ENST00000328514 IL27Q8NEV9 243 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS3-202ENST00000328514 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS3-202ENST00000328514 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.96□□□□□ -0.01
GINS3-202ENST00000328514 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 ADAMTS12P58397 1594 aa14.95□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.94□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.94□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 PBRM1Q86U86 1689 aa14.93□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GINS3-202ENST00000328514 NLRP13Q86W25 1043 aa14.93□□□□□ -0.02
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