RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 NAIPQ13075 1403 aa18.26■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.25■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 OSCARQ8IYS5 282 aa18.25■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.24■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 HFM1A2PYH4 1435 aa18.23■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 ANP32CO43423 234 aa18.23■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.22■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.22■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.22■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 NUP155O75694 1391 aa18.22■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 UACAQ9BZF9 1416 aa18.21■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 ARHGEF11O15085 1522 aa18.21■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.51
HPS1-201ENST00000325103 MIA2Q96PC5 1412 aa18.2■□□□□ 0.5
HPS1-201ENST00000325103 ATP10BO94823 1461 aa18.19■□□□□ 0.5
HPS1-201ENST00000325103 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.18■□□□□ 0.5
HPS1-201ENST00000325103 DAPK1P53355 1430 aa18.18■□□□□ 0.5
HPS1-201ENST00000325103 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
HPS1-201ENST00000325103 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.16■□□□□ 0.5
HPS1-201ENST00000325103 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.16■□□□□ 0.5
HPS1-201ENST00000325103 ABCC5O15440 1437 aa18.15■□□□□ 0.5
HPS1-201ENST00000325103 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
HPS1-201ENST00000325103 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 MAPKBP1O60336 1514 aa18.13■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.13■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 CHD1O14646 1710 aa18.12■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.12■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.11■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.11■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 AFAP1Q8N556 730 aa18.1■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 KIF15Q9NS87 1388 aa18.09■□□□□ 0.49
HPS1-201ENST00000325103 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.08■□□□□ 0.48
HPS1-201ENST00000325103 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.07■□□□□ 0.48
HPS1-201ENST00000325103 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
HPS1-201ENST00000325103 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.04■□□□□ 0.48
HPS1-201ENST00000325103 KIF14Q15058 1648 aa18.04■□□□□ 0.48
HPS1-201ENST00000325103 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.03■□□□□ 0.48
HPS1-201ENST00000325103 KIF3BO15066 747 aa18.01■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.01■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 NCOA1Q15788 1441 aa18■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 GGT6Q6P531 493 aa18■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 AKNAQ7Z591 1439 aa17.99■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 ABCA8O94911 1581 aa17.98■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 NBPF8Q3BBV2 869 aa17.98■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 ROCK1Q13464 1354 aa17.97■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.96■□□□□ 0.47
HPS1-201ENST00000325103 BCANQ96GW7 911 aa17.94■□□□□ 0.46
HPS1-201ENST00000325103 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.93■□□□□ 0.46
HPS1-201ENST00000325103 KDM6BO15054 1643 aa17.93■□□□□ 0.46
HPS1-201ENST00000325103 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.91■□□□□ 0.46
HPS1-201ENST00000325103 NEFLP07196 543 aa17.89■□□□□ 0.46
HPS1-201ENST00000325103 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.89■□□□□ 0.46
HPS1-201ENST00000325103 ABCC2Q92887 1545 aa17.89■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 MRS2Q9HD23 443 aa17.87■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.87■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.86■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.86■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.86■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 MLECQ14165 292 aa17.85■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.85■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.85■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.84■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 RAPGEF3O95398 923 aa17.83■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 WASHC2AQ641Q2 1341 aa17.83■□□□□ 0.45
HPS1-201ENST00000325103 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa17.83■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 KANK1Q14678 1352 aa17.81■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.81■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.8■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.79■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.79■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 ASXL2Q76L83 1435 aa17.78■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.78■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 USP47Q96K76 1375 aa17.78■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 PLCH2O75038 1416 aa17.77■□□□□ 0.44
HPS1-201ENST00000325103 NBPF1Q3BBV0 1214 aa17.76■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.75■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa17.75■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 MBD5Q9P267 1494 aa17.75■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 SHROOM2Q13796 1616 aa17.74■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 TMC1Q8TDI8 760 aa17.74■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 PZPP20742 1482 aa17.74■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 KIF7Q2M1P5 1343 aa17.74■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 FANCAO15360 1455 aa17.73■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.73■□□□□ 0.43
HPS1-201ENST00000325103 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.73■□□□□ 0.43
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