RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.76■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 DAPK1P53355 1430 aa24.75■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.75■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.74■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.73■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.73■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 ROCK1Q13464 1354 aa24.73■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.72■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 ABCC5O15440 1437 aa24.71■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SSR4-201ENST00000320857 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.69■■□□□ 1.54
SSR4-201ENST00000320857 PREX2Q70Z35 1606 aa24.63■■□□□ 1.53
SSR4-201ENST00000320857 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.62■■□□□ 1.53
SSR4-201ENST00000320857 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SSR4-201ENST00000320857 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.534e-9■□□□□ 10.3
SSR4-201ENST00000320857 NEUROD1Q13562 356 aa24.61■■□□□ 1.53
SSR4-201ENST00000320857 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.61■■□□□ 1.53
SSR4-201ENST00000320857 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.6■■□□□ 1.53
SSR4-201ENST00000320857 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.6■■□□□ 1.53
SSR4-201ENST00000320857 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.57■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 TRIM52Q96A61 297 aa24.56■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 ADGRL2O95490 1459 aa24.56■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 KDM6BO15054 1643 aa24.55■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.55■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.54■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.54■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.53■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 ASXL2Q76L83 1435 aa24.53■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 NCOA1Q15788 1441 aa24.52■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 KCNH8Q96L42 1107 aa24.52■■□□□ 1.52
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.5■■□□□ 1.51
SSR4-201ENST00000320857 MBD5Q9P267 1494 aa24.5■■□□□ 1.51
SSR4-201ENST00000320857 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.5■■□□□ 1.51
SSR4-201ENST00000320857 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SSR4-201ENST00000320857 TONSLQ96HA7 1378 aa24.48■■□□□ 1.51
SSR4-201ENST00000320857 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.48■■□□□ 1.51
SSR4-201ENST00000320857 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.47■■□□□ 1.51
SSR4-201ENST00000320857 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.47■■□□□ 1.51
SSR4-201ENST00000320857 PLCH2O75038 1416 aa24.47■■□□□ 1.51
SSR4-201ENST00000320857 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.45■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.44■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.44■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 TSPY4P0CV99 314 aa24.43■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 TSPY10P0CW01 314 aa24.43■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.43■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.42■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.41■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.4■■□□□ 1.5
SSR4-201ENST00000320857 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.38■■□□□ 1.49
SSR4-201ENST00000320857 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.37■■□□□ 1.49
SSR4-201ENST00000320857 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.37■■□□□ 1.49
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.36■■□□□ 1.49
SSR4-201ENST00000320857 DIP2BQ9P265 1576 aa24.35■■□□□ 1.49
SSR4-201ENST00000320857 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SSR4-201ENST00000320857 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.32■■□□□ 1.48
SSR4-201ENST00000320857 ABCC1P33527 1531 aa24.32■■□□□ 1.48
SSR4-201ENST00000320857 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.32■■□□□ 1.48
SSR4-201ENST00000320857 PZPP20742 1482 aa24.31■■□□□ 1.48
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.3■■□□□ 1.48
SSR4-201ENST00000320857 KIF15Q9NS87 1388 aa24.3■■□□□ 1.48
SSR4-201ENST00000320857 PLXNC1O60486 1568 aa24.26■■□□□ 1.47
SSR4-201ENST00000320857 FOXD1Q16676 465 aa24.25■■□□□ 1.47
SSR4-201ENST00000320857 MIER1Q8N108 512 aa24.25■■□□□ 1.47
SSR4-201ENST00000320857 TSPOAP1O95153 1857 aa24.25■■□□□ 1.47
SSR4-201ENST00000320857 GLI2P10070 1586 aa24.24■■□□□ 1.47
SSR4-201ENST00000320857 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SSR4-201ENST00000320857 FANCAO15360 1455 aa24.23■■□□□ 1.47
SSR4-201ENST00000320857 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.22■■□□□ 1.47
SSR4-201ENST00000320857 CD109Q6YHK3 1445 aa24.21■■□□□ 1.47
SSR4-201ENST00000320857 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.21■■□□□ 1.47
SSR4-201ENST00000320857 NUP155O75694 1391 aa24.2■■□□□ 1.46
SSR4-201ENST00000320857 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.19■■□□□ 1.46
SSR4-201ENST00000320857 PKD2Q13563 968 aa24.17■■□□□ 1.46
SSR4-201ENST00000320857 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.16■■□□□ 1.46
SSR4-201ENST00000320857 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.16■■□□□ 1.46
SSR4-201ENST00000320857 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.15■■□□□ 1.46
SSR4-201ENST00000320857 ADGRL1O94910 1474 aa24.13■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.12■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 UNC13BO14795 1591 aa24.11■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 ERBINQ96RT1 1412 aa24.11■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 AFAP1Q8N556 730 aa24.11■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.11■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.1■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.1■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SSR4-201ENST00000320857 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SSR4-201ENST00000320857 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.06■■□□□ 1.44
SSR4-201ENST00000320857 ATP7AQ04656 1500 aa24.04■■□□□ 1.44
SSR4-201ENST00000320857 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.03■■□□□ 1.44
SSR4-201ENST00000320857 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
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