RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318622.8

RHBDD2-202, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-202ENST00000318622 ABCC5O15440 1437 aa36.73■■■■□ 3.47
RHBDD2-202ENST00000318622 PREX2Q70Z35 1606 aa36.72■■■■□ 3.47
RHBDD2-202ENST00000318622 NAIPQ13075 1403 aa36.71■■■■□ 3.47
RHBDD2-202ENST00000318622 ROCK1Q13464 1354 aa36.69■■■■□ 3.46
RHBDD2-202ENST00000318622 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.69■■■■□ 3.46
RHBDD2-202ENST00000318622 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.67■■■■□ 3.46
RHBDD2-202ENST00000318622 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.67■■■■□ 3.46
RHBDD2-202ENST00000318622 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
RHBDD2-202ENST00000318622 KCNH8Q96L42 1107 aa36.64■■■■□ 3.46
RHBDD2-202ENST00000318622 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.62■■■■□ 3.45
RHBDD2-202ENST00000318622 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.61■■■■□ 3.45
RHBDD2-202ENST00000318622 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.6■■■■□ 3.45
RHBDD2-202ENST00000318622 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.6■■■■□ 3.45
RHBDD2-202ENST00000318622 PLCH2O75038 1416 aa36.58■■■■□ 3.45
RHBDD2-202ENST00000318622 ASXL2Q76L83 1435 aa36.57■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.56■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.55■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.55■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.54■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.54■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.54■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.53■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.53■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 ADGRL2O95490 1459 aa36.53■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 MBD5Q9P267 1494 aa36.53■■■■□ 3.44
RHBDD2-202ENST00000318622 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.51■■■■□ 3.43
RHBDD2-202ENST00000318622 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
RHBDD2-202ENST00000318622 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
RHBDD2-202ENST00000318622 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
RHBDD2-202ENST00000318622 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.49■■■■□ 3.43
RHBDD2-202ENST00000318622 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.48■■■■□ 3.43
RHBDD2-202ENST00000318622 NCOA1Q15788 1441 aa36.47■■■■□ 3.43
RHBDD2-202ENST00000318622 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.47■■■■□ 3.43
RHBDD2-202ENST00000318622 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.45■■■■□ 3.43
RHBDD2-202ENST00000318622 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.42■■■■□ 3.42
RHBDD2-202ENST00000318622 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.42■■■■□ 3.42
RHBDD2-202ENST00000318622 MAPKBP1O60336 1514 aa36.42■■■■□ 3.42
RHBDD2-202ENST00000318622 TSPY4P0CV99 314 aa36.41■■■■□ 3.42
RHBDD2-202ENST00000318622 TSPY10P0CW01 314 aa36.41■■■■□ 3.42
RHBDD2-202ENST00000318622 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.41■■■■□ 3.42
RHBDD2-202ENST00000318622 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.4■■■■□ 3.42
RHBDD2-202ENST00000318622 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.37■■■■□ 3.41
RHBDD2-202ENST00000318622 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.36■■■■□ 3.41
RHBDD2-202ENST00000318622 KDM6BO15054 1643 aa36.34■■■■□ 3.41
RHBDD2-202ENST00000318622 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.31■■■■□ 3.4
RHBDD2-202ENST00000318622 ABCC1P33527 1531 aa36.3■■■■□ 3.4
RHBDD2-202ENST00000318622 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.27■■■■□ 3.4
RHBDD2-202ENST00000318622 FANCAO15360 1455 aa36.24■■■■□ 3.39
RHBDD2-202ENST00000318622 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.21■■■■□ 3.39
RHBDD2-202ENST00000318622 TRIM52Q96A61 297 aa36.18■■■■□ 3.38
RHBDD2-202ENST00000318622 KIF15Q9NS87 1388 aa36.18■■■■□ 3.38
RHBDD2-202ENST00000318622 CD109Q6YHK3 1445 aa36.16■■■■□ 3.38
RHBDD2-202ENST00000318622 PLXNC1O60486 1568 aa36.14■■■■□ 3.38
RHBDD2-202ENST00000318622 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.13■■■■□ 3.37
RHBDD2-202ENST00000318622 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.12■■■■□ 3.37
RHBDD2-202ENST00000318622 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.11■■■■□ 3.37
RHBDD2-202ENST00000318622 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
RHBDD2-202ENST00000318622 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.09■■■■□ 3.37
RHBDD2-202ENST00000318622 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.09■■■■□ 3.37
RHBDD2-202ENST00000318622 ADGRL1O94910 1474 aa36.08■■■■□ 3.37
RHBDD2-202ENST00000318622 GLI2P10070 1586 aa36.07■■■■□ 3.36
RHBDD2-202ENST00000318622 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.04■■■■□ 3.36
RHBDD2-202ENST00000318622 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.03■■■■□ 3.36
RHBDD2-202ENST00000318622 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36■■■■□ 3.35
RHBDD2-202ENST00000318622 PZPP20742 1482 aa36■■■■□ 3.35
RHBDD2-202ENST00000318622 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
RHBDD2-202ENST00000318622 AFAP1Q8N556 730 aa35.99■■■■□ 3.35
RHBDD2-202ENST00000318622 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.99■■■■□ 3.35
RHBDD2-202ENST00000318622 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.98■■■■□ 3.35
RHBDD2-202ENST00000318622 NEO1Q92859 1461 aa35.97■■■■□ 3.35
RHBDD2-202ENST00000318622 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
RHBDD2-202ENST00000318622 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.96■■■■□ 3.35
RHBDD2-202ENST00000318622 ERBINQ96RT1 1412 aa35.95■■■■□ 3.34
RHBDD2-202ENST00000318622 NEUROD1Q13562 356 aa35.94■■■■□ 3.34
RHBDD2-202ENST00000318622 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
RHBDD2-202ENST00000318622 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.91■■■■□ 3.34
RHBDD2-202ENST00000318622 NUP155O75694 1391 aa35.9■■■■□ 3.34
RHBDD2-202ENST00000318622 DIP2BQ9P265 1576 aa35.89■■■■□ 3.34
RHBDD2-202ENST00000318622 ATP7AQ04656 1500 aa35.89■■■■□ 3.34
RHBDD2-202ENST00000318622 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.88■■■■□ 3.34
RHBDD2-202ENST00000318622 UNC13BO14795 1591 aa35.86■■■■□ 3.33
RHBDD2-202ENST00000318622 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.84■■■■□ 3.33
RHBDD2-202ENST00000318622 KDM5CP41229 1560 aa35.83■■■■□ 3.33
RHBDD2-202ENST00000318622 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.82■■■■□ 3.32
RHBDD2-202ENST00000318622 TONSLQ96HA7 1378 aa35.8■■■■□ 3.32
RHBDD2-202ENST00000318622 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.79■■■■□ 3.32
RHBDD2-202ENST00000318622 PKD2Q13563 968 aa35.77■■■■□ 3.32
RHBDD2-202ENST00000318622 FOXD1Q16676 465 aa35.77■■■■□ 3.32
RHBDD2-202ENST00000318622 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.77■■■■□ 3.32
RHBDD2-202ENST00000318622 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.76■■■■□ 3.32
RHBDD2-202ENST00000318622 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.75■■■■□ 3.31
RHBDD2-202ENST00000318622 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
RHBDD2-202ENST00000318622 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
RHBDD2-202ENST00000318622 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
RHBDD2-202ENST00000318622 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
RHBDD2-202ENST00000318622 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.72■■■■□ 3.31
RHBDD2-202ENST00000318622 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
RHBDD2-202ENST00000318622 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.67■■■■□ 3.3
RHBDD2-202ENST00000318622 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms