RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317012.4

ZBED2-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED2, Length 2,311 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2-201ENST00000317012 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ZBED2-201ENST00000317012 KDM6BO15054 1643 aa18.58■□□□□ 0.56
ZBED2-201ENST00000317012 ARHGEF11O15085 1522 aa18.57■□□□□ 0.56
ZBED2-201ENST00000317012 JPH4Q96JJ6 628 aa18.56■□□□□ 0.56
ZBED2-201ENST00000317012 CCDC184Q52MB2 194 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED2-201ENST00000317012 NUP160Q12769 1436 aa18.55■□□□□ 0.56
ZBED2-201ENST00000317012 FOXD1Q16676 465 aa18.54■□□□□ 0.56
ZBED2-201ENST00000317012 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.54■□□□□ 0.56
ZBED2-201ENST00000317012 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
ZBED2-201ENST00000317012 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
ZBED2-201ENST00000317012 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.51■□□□□ 0.55
ZBED2-201ENST00000317012 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
ZBED2-201ENST00000317012 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.5■□□□□ 0.55
ZBED2-201ENST00000317012 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.5■□□□□ 0.55
ZBED2-201ENST00000317012 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.49■□□□□ 0.55
ZBED2-201ENST00000317012 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
ZBED2-201ENST00000317012 MSH5O43196 834 aa18.48■□□□□ 0.55
ZBED2-201ENST00000317012 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.45■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 CHD1O14646 1710 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 AKNAQ7Z591 1439 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 CCDC7Q96M83 1385 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 NCOA1Q15788 1441 aa18.4■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 MIA2Q96PC5 1412 aa18.39■□□□□ 0.54
ZBED2-201ENST00000317012 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
ZBED2-201ENST00000317012 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED2-201ENST00000317012 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
ZBED2-201ENST00000317012 MRS2Q9HD23 443 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED2-201ENST00000317012 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
ZBED2-201ENST00000317012 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
ZBED2-201ENST00000317012 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED2-201ENST00000317012 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.33■□□□□ 0.53
ZBED2-201ENST00000317012 DAPK1P53355 1430 aa18.33■□□□□ 0.53
ZBED2-201ENST00000317012 ABCA8O94911 1581 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 KIF14Q15058 1648 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 ABCC5O15440 1437 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 PTPRGP23470 1445 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 ROCK1Q13464 1354 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED2-201ENST00000317012 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.25■□□□□ 0.51
ZBED2-201ENST00000317012 SHROOM2Q13796 1616 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED2-201ENST00000317012 ATP10BO94823 1461 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED2-201ENST00000317012 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED2-201ENST00000317012 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.23■□□□□ 0.51
ZBED2-201ENST00000317012 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ZBED2-201ENST00000317012 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.21■□□□□ 0.51
ZBED2-201ENST00000317012 PZPP20742 1482 aa18.21■□□□□ 0.51
ZBED2-201ENST00000317012 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ZBED2-201ENST00000317012 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.21■□□□□ 0.51
ZBED2-201ENST00000317012 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.2■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.2■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.19■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 MBD5Q9P267 1494 aa18.15■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.15■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.15■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 USP47Q96K76 1375 aa18.14■□□□□ 0.5
ZBED2-201ENST00000317012 PKD2Q13563 968 aa18.12■□□□□ 0.49
ZBED2-201ENST00000317012 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ZBED2-201ENST00000317012 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED2-201ENST00000317012 NUDCQ9Y266 331 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED2-201ENST00000317012 ABCC2Q92887 1545 aa18.08■□□□□ 0.49
ZBED2-201ENST00000317012 KDM5CP41229 1560 aa18.08■□□□□ 0.48
ZBED2-201ENST00000317012 ADGRL2O95490 1459 aa18.07■□□□□ 0.48
ZBED2-201ENST00000317012 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ZBED2-201ENST00000317012 PREX2Q70Z35 1606 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED2-201ENST00000317012 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED2-201ENST00000317012 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.05■□□□□ 0.48
ZBED2-201ENST00000317012 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED2-201ENST00000317012 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED2-201ENST00000317012 OSCARQ8IYS5 282 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED2-201ENST00000317012 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED2-201ENST00000317012 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.02■□□□□ 0.47
ZBED2-201ENST00000317012 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED2-201ENST00000317012 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED2-201ENST00000317012 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED2-201ENST00000317012 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
ZBED2-201ENST00000317012 TMC1Q8TDI8 760 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED2-201ENST00000317012 CARD11Q9BXL7 1154 aa18■□□□□ 0.47
ZBED2-201ENST00000317012 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18■□□□□ 0.47
ZBED2-201ENST00000317012 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms