RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 KDM6BO15054 1643 aa30.93■■■□□ 2.54
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MESP1-201ENST00000300057 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.91■■■□□ 2.54
MESP1-201ENST00000300057 SHROOM2Q13796 1616 aa30.9■■■□□ 2.54
MESP1-201ENST00000300057 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.9■■■□□ 2.54
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MESP1-201ENST00000300057 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
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MESP1-201ENST00000300057 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.79■■■□□ 2.52
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MESP1-201ENST00000300057 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
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MESP1-201ENST00000300057 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.55■■■□□ 2.48
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MESP1-201ENST00000300057 TSPY10P0CW01 314 aa30.48■■■□□ 2.47
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MESP1-201ENST00000300057 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.48■■■□□ 2.47
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MESP1-201ENST00000300057 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.92■■■□□ 2.38
MESP1-201ENST00000300057 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
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MESP1-201ENST00000300057 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
MESP1-201ENST00000300057 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.88■■■□□ 2.37
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