RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.31■■■□□ 2.92
VSTM4-201ENST00000298454 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.29■■■□□ 2.92
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
VSTM4-201ENST00000298454 ROCK1Q13464 1354 aa33.24■■■□□ 2.91
VSTM4-201ENST00000298454 KDM6BO15054 1643 aa33.23■■■□□ 2.91
VSTM4-201ENST00000298454 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.23■■■□□ 2.91
VSTM4-201ENST00000298454 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.23■■■□□ 2.91
VSTM4-201ENST00000298454 OSCARQ8IYS5 282 aa33.19■■■□□ 2.9
VSTM4-201ENST00000298454 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
VSTM4-201ENST00000298454 NEUROD1Q13562 356 aa33.16■■■□□ 2.9
VSTM4-201ENST00000298454 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.16■■■□□ 2.9
VSTM4-201ENST00000298454 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.11■■■□□ 2.89
VSTM4-201ENST00000298454 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.11■■■□□ 2.89
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM52Q96A61 297 aa33.11■■■□□ 2.89
VSTM4-201ENST00000298454 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.1■■■□□ 2.89
VSTM4-201ENST00000298454 PREX2Q70Z35 1606 aa33.09■■■□□ 2.89
VSTM4-201ENST00000298454 KCNH8Q96L42 1107 aa33.09■■■□□ 2.89
VSTM4-201ENST00000298454 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.08■■■□□ 2.89
VSTM4-201ENST00000298454 NCOA1Q15788 1441 aa33.08■■■□□ 2.89
VSTM4-201ENST00000298454 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRL2O95490 1459 aa33.05■■■□□ 2.88
VSTM4-201ENST00000298454 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.05■■■□□ 2.88
VSTM4-201ENST00000298454 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.03■■■□□ 2.88
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.03■■■□□ 2.88
VSTM4-201ENST00000298454 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
VSTM4-201ENST00000298454 MBD5Q9P267 1494 aa33■■■□□ 2.87
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.99■■■□□ 2.87
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.98■■■□□ 2.87
VSTM4-201ENST00000298454 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.98■■■□□ 2.87
VSTM4-201ENST00000298454 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.98■■■□□ 2.87
VSTM4-201ENST00000298454 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.98■■■□□ 2.87
VSTM4-201ENST00000298454 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.98■■■□□ 2.87
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.96■■■□□ 2.87
VSTM4-201ENST00000298454 TSPY4P0CV99 314 aa32.95■■■□□ 2.87
VSTM4-201ENST00000298454 TSPY10P0CW01 314 aa32.95■■■□□ 2.87
VSTM4-201ENST00000298454 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.95■■■□□ 2.86
VSTM4-201ENST00000298454 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.9■■■□□ 2.86
VSTM4-201ENST00000298454 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.89■■■□□ 2.86
VSTM4-201ENST00000298454 PLCH2O75038 1416 aa32.88■■■□□ 2.85
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.87■■■□□ 2.85
VSTM4-201ENST00000298454 TONSLQ96HA7 1378 aa32.86■■■□□ 2.85
VSTM4-201ENST00000298454 FOXD1Q16676 465 aa32.86■■■□□ 2.85
VSTM4-201ENST00000298454 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.86■■■□□ 2.85
VSTM4-201ENST00000298454 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.86■■■□□ 2.85
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
VSTM4-201ENST00000298454 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.81■■■□□ 2.84
VSTM4-201ENST00000298454 KIF15Q9NS87 1388 aa32.8■■■□□ 2.84
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.8■■■□□ 2.84
VSTM4-201ENST00000298454 PZPP20742 1482 aa32.79■■■□□ 2.84
VSTM4-201ENST00000298454 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.78■■■□□ 2.84
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.77■■■□□ 2.84
VSTM4-201ENST00000298454 ASXL2Q76L83 1435 aa32.76■■■□□ 2.83
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.73■■■□□ 2.83
VSTM4-201ENST00000298454 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.72■■■□□ 2.83
VSTM4-201ENST00000298454 ABCC1P33527 1531 aa32.69■■■□□ 2.82
VSTM4-201ENST00000298454 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.69■■■□□ 2.82
VSTM4-201ENST00000298454 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.68■■■□□ 2.82
VSTM4-201ENST00000298454 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.66■■■□□ 2.82
VSTM4-201ENST00000298454 NUP155O75694 1391 aa32.65■■■□□ 2.82
VSTM4-201ENST00000298454 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.63■■■□□ 2.81
VSTM4-201ENST00000298454 PKD2Q13563 968 aa32.62■■■□□ 2.81
VSTM4-201ENST00000298454 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
VSTM4-201ENST00000298454 PLXNC1O60486 1568 aa32.59■■■□□ 2.81
VSTM4-201ENST00000298454 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.59■■■□□ 2.81
VSTM4-201ENST00000298454 FANCAO15360 1455 aa32.58■■■□□ 2.81
VSTM4-201ENST00000298454 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.55■■■□□ 2.8
VSTM4-201ENST00000298454 AFAP1Q8N556 730 aa32.53■■■□□ 2.8
VSTM4-201ENST00000298454 MIER1Q8N108 512 aa32.52■■■□□ 2.8
VSTM4-201ENST00000298454 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.49■■■□□ 2.79
VSTM4-201ENST00000298454 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
VSTM4-201ENST00000298454 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.47■■■□□ 2.79
VSTM4-201ENST00000298454 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRL1O94910 1474 aa32.45■■■□□ 2.79
VSTM4-201ENST00000298454 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.45■■■□□ 2.79
VSTM4-201ENST00000298454 UNC13BO14795 1591 aa32.44■■■□□ 2.78
VSTM4-201ENST00000298454 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.43■■■□□ 2.78
VSTM4-201ENST00000298454 ERBINQ96RT1 1412 aa32.43■■■□□ 2.78
VSTM4-201ENST00000298454 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.43■■■□□ 2.78
VSTM4-201ENST00000298454 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.43■■■□□ 2.78
VSTM4-201ENST00000298454 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.42■■■□□ 2.78
VSTM4-201ENST00000298454 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.41■■■□□ 2.78
VSTM4-201ENST00000298454 CD109Q6YHK3 1445 aa32.39■■■□□ 2.78
VSTM4-201ENST00000298454 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.38■■■□□ 2.77
VSTM4-201ENST00000298454 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.38■■■□□ 2.77
VSTM4-201ENST00000298454 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.38■■■□□ 2.77
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF8Q3BBV2 869 aa32.33■■■□□ 2.77
VSTM4-201ENST00000298454 ATP7AQ04656 1500 aa32.33■■■□□ 2.77
VSTM4-201ENST00000298454 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
VSTM4-201ENST00000298454 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.32■■■□□ 2.76
VSTM4-201ENST00000298454 IQGAP3Q86VI3 1631 aa32.31■■■□□ 2.76
VSTM4-201ENST00000298454 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.28■■■□□ 2.76
VSTM4-201ENST00000298454 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.24■■■□□ 2.75
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.22■■■□□ 2.75
VSTM4-201ENST00000298454 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2R1Q13018 1463 aa32.2■■■□□ 2.74
VSTM4-201ENST00000298454 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.18■■■□□ 2.74
VSTM4-201ENST00000298454 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms