RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 CUX1P39880 1505 aa19.01■□□□□ 0.63
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PTPRN-201ENST00000295718 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19■□□□□ 0.63
PTPRN-201ENST00000295718 CDCA7LQ96GN5 454 aa19■□□□□ 0.63
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PTPRN-201ENST00000295718 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PTPRN-201ENST00000295718 USP47Q96K76 1375 aa18.93■□□□□ 0.62
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PTPRN-201ENST00000295718 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRN-201ENST00000295718 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
PTPRN-201ENST00000295718 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRN-201ENST00000295718 GSE1Q14687 1217 aa18.83■□□□□ 0.6
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PTPRN-201ENST00000295718 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.82■□□□□ 0.6
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PTPRN-201ENST00000295718 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
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PTPRN-201ENST00000295718 MS4A1P11836 297 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRN-201ENST00000295718 NCOA1Q15788 1441 aa18.66■□□□□ 0.58
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PTPRN-201ENST00000295718 APAF1O14727 1248 aa18.64■□□□□ 0.58
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PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.63■□□□□ 0.57
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PTPRN-201ENST00000295718 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
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PTPRN-201ENST00000295718 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
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PTPRN-201ENST00000295718 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.55■□□□□ 0.56
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PTPRN-201ENST00000295718 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRN-201ENST00000295718 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRN-201ENST00000295718 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
PTPRN-201ENST00000295718 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRN-201ENST00000295718 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRN-201ENST00000295718 ARID3AQ99856 593 aa18.52■□□□□ 0.56
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